RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469521.5

TRAPPC10-208, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC10, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-208ENST00000469521 VEZTQ9HBM0 779 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 CA12O43570 354 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 TNFAIP1Q13829 316 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 TEKT1Q969V4 418 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 RASAL3Q86YV0 1011 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 LAMB1P07942 1786 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 SALL1Q9NSC2 1324 aa23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 AKAP11Q9UKA4 1901 aa23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 PHKA1P46020 1223 aa23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 TFCP2Q12800 502 aa23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 POLA2Q14181 598 aa23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 IFFO2Q5TF58 517 aa23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 MOB2Q70IA6 237 aa23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 MRIQ9BWK5 157 aa23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 A0A1B0GUL7 405 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 MS4A1P11836 297 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 ADORA1P30542 326 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCDC102BQ68D86 513 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 ARMC9Q7Z3E5 817 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZDHHC15Q96MV8 337 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZIC5Q96T25 663 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 OTOFQ9HC10 1997 aa23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 UBE2Q2LH0YL09 131 aa23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 LBX1P52954 281 aa23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 SSH3Q8TE77 659 aa23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 ATP8B2P98198 1209 aa23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 RASA3Q14644 834 aa23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 HHIPL2Q6UWX4 724 aa23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 PANK1Q8TE04 598 aa23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 TIMM10P62072 90 aa23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 MAP3K11Q16584 847 aa23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 TNS4Q8IZW8 715 aa23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 XAGE2Q96GT9 111 aa23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 TNNI2P48788 182 aa23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 RASGRF1Q13972 1273 aa23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 LDLRAD1Q5T700 205 aa23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 MYH2Q9UKX2 1941 aa23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 PRDX5P30044 214 aa23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 SAGE1Q9NXZ1 904 aa23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 TMOD2Q9NZR1 351 aa23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 UNCXA6NJT0 531 aa23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 PRKG1Q13976 671 aa23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC10-208ENST00000469521 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC10-208ENST00000469521 FKBP1CQ5VVH2 108 aa23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC10-208ENST00000469521 TEPSINQ96N21 525 aa23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC10-208ENST00000469521 NEUROD6Q96NK8 337 aa23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC10-208ENST00000469521 GPR108Q9NPR9 543 aa23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC10-208ENST00000469521 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC10-208ENST00000469521 MAST2Q6P0Q8 1798 aa23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC10-208ENST00000469521 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC10-208ENST00000469521 CEP85Q6P2H3 762 aa23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC10-208ENST00000469521 TSKSQ9UJT2 592 aa23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC10-208ENST00000469521 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC10-208ENST00000469521 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC10-208ENST00000469521 SURF6O75683 361 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC10-208ENST00000469521 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC10-208ENST00000469521 IREB2P48200 963 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC10-208ENST00000469521 DIXDC1Q155Q3 683 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM83AQ86UY5 434 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC10-208ENST00000469521 CSRNP1Q96S65 589 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC10-208ENST00000469521 TMEM39BQ9GZU3 492 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC10-208ENST00000469521 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC10-208ENST00000469521 FZD1Q9UP38 647 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC10-208ENST00000469521 CACNB3P54284 484 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC10-208ENST00000469521 TNNI3KQ59H18 835 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC10-208ENST00000469521 GORABQ5T7V8 394 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC10-208ENST00000469521 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC10-208ENST00000469521 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC10-208ENST00000469521 CDAN1Q8IWY9 1227 aa23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC10-208ENST00000469521 USP2O75604 605 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC10-208ENST00000469521 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC10-208ENST00000469521 SPATA5Q8NB90 893 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC10-208ENST00000469521 RNF186Q9NXI6 227 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC10-208ENST00000469521 GAKO14976 1311 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC10-208ENST00000469521 DOCK2Q92608 1830 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC10-208ENST00000469521 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC10-208ENST00000469521 SREBF2Q12772 1141 aa23.2■■□□□ 1.3
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