RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467128.5

USP34-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 4

Gene USP34, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-208	ENST00000467128	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
USP34-208	ENST00000467128	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
USP34-208	ENST00000467128	MTX1	Q13505	466 aa		10.48	□□□□□ -0.73
USP34-208	ENST00000467128	AOC3	Q16853	763 aa		10.48	□□□□□ -0.73
USP34-208	ENST00000467128	SLC51A	Q86UW1	340 aa		10.48	□□□□□ -0.73
USP34-208	ENST00000467128	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
USP34-208	ENST00000467128	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
USP34-208	ENST00000467128	POLL	Q9UGP5	575 aa		10.48	□□□□□ -0.73
USP34-208	ENST00000467128	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		10.48	□□□□□ -0.73
USP34-208	ENST00000467128	TOMM70	O94826	608 aa		10.47	□□□□□ -0.73
USP34-208	ENST00000467128	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
USP34-208	ENST00000467128	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
USP34-208	ENST00000467128	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
USP34-208	ENST00000467128	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
USP34-208	ENST00000467128	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		10.47	□□□□□ -0.73
USP34-208	ENST00000467128	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		10.47	□□□□□ -0.73
USP34-208	ENST00000467128	SCN9A	Q15858	1988 aa		10.46	□□□□□ -0.73
USP34-208	ENST00000467128	C6orf229	H3BNL8	230 aa		10.46	□□□□□ -0.73
USP34-208	ENST00000467128	CHRND	Q07001	517 aa		10.46	□□□□□ -0.73
USP34-208	ENST00000467128	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		10.46	□□□□□ -0.73
USP34-208	ENST00000467128	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		10.46	□□□□□ -0.73
USP34-208	ENST00000467128	PODN	Q7Z5L7	613 aa		10.46	□□□□□ -0.73
USP34-208	ENST00000467128	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
USP34-208	ENST00000467128	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
USP34-208	ENST00000467128	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
USP34-208	ENST00000467128	MEIS3	Q99687	375 aa		10.46	□□□□□ -0.73
USP34-208	ENST00000467128	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		10.46	□□□□□ -0.73
USP34-208	ENST00000467128	WDR70	Q9NW82	654 aa		10.46	□□□□□ -0.73
USP34-208	ENST00000467128	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		10.46	□□□□□ -0.73
USP34-208	ENST00000467128	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		10.46	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		10.45	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		10.45	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	POTEC	B2RU33	542 aa		10.45	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	ECE2	O60344	883 aa		10.45	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	TNIP1	Q15025	636 aa		10.45	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		10.45	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		10.45	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	YDJC	A8MPS7	323 aa		10.44	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	CIAO1	O76071	339 aa		10.44	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	GNAI2	P04899	355 aa		10.44	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	MMP14	P50281	582 aa		10.44	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	SCNN1D	P51172	638 aa		10.44	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	COPS2	P61201	443 aa		10.44	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	CXCL9	Q07325	125 aa		10.44	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	FSTL1	Q12841	308 aa		10.44	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	UBE4A	Q14139	1066 aa		10.44	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	LAPTM4A	Q15012	233 aa		10.44	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	DPF2	Q92785	391 aa		10.44	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	COA1	Q9GZY4	146 aa		10.44	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		10.44	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	HACL1	Q9UJ83	578 aa		10.44	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		10.44	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		10.43	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	C1QTNF8	P60827	252 aa		10.43	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	PDE3A	Q14432	1141 aa		10.43	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		10.43	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		10.43	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		10.43	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	RRAGC	Q9HB90	399 aa		10.43	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	COPRS	Q9NQ92	184 aa		10.43	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	EYA2	O00167	538 aa		10.42	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	RLBP1	P12271	317 aa		10.42	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	KCNJ4	P48050	445 aa		10.42	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	LDHD	Q86WU2	507 aa		10.42	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		10.42	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		10.42	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		10.42	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		10.42	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		10.42	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		10.42	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	TNN	Q9UQP3	1299 aa		10.42	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	PDE8B	O95263	885 aa		10.41	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	EPHX2	P34913	555 aa		10.41	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		10.41	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		10.41	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		10.41	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	USP17L3	A6NCW0	530 aa		10.4	□□□□□ -0.74
USP34-208	ENST00000467128	USP17L4	A6NCW7	530 aa		10.4	□□□□□ -0.74

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