RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466278.1

MKL1-208, Transcript of MKL/myocardin-like protein 1, human

TSL 3

Gene MKL1, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKL1-208	ENST00000466278	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	28.32	■■■□□ 2.12
MKL1-208	ENST00000466278	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	28.32	■■■□□ 2.12
MKL1-208	ENST00000466278	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		28.32	■■■□□ 2.12
MKL1-208	ENST00000466278	MAST3	O60307	1309 aa		28.32	■■■□□ 2.12
MKL1-208	ENST00000466278	TNFAIP1	Q13829	316 aa		28.31	■■■□□ 2.12
MKL1-208	ENST00000466278	GRIK5	Q16478	980 aa		28.31	■■■□□ 2.12
MKL1-208	ENST00000466278	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	28.31	■■■□□ 2.12
MKL1-208	ENST00000466278	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		28.3	■■■□□ 2.12
MKL1-208	ENST00000466278	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		28.3	■■■□□ 2.12
MKL1-208	ENST00000466278	TSKS	Q9UJT2	592 aa		28.3	■■■□□ 2.12
MKL1-208	ENST00000466278	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		28.29	■■■□□ 2.12
MKL1-208	ENST00000466278	TEKT1	Q969V4	418 aa		28.29	■■■□□ 2.12
MKL1-208	ENST00000466278	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	28.29	■■■□□ 2.12
MKL1-208	ENST00000466278	PRKG1	Q13976	671 aa		28.28	■■■□□ 2.12
MKL1-208	ENST00000466278	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		28.28	■■■□□ 2.12
MKL1-208	ENST00000466278	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	28.28	■■■□□ 2.12
MKL1-208	ENST00000466278	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	28.28	■■■□□ 2.12
MKL1-208	ENST00000466278	RASA3	Q14644	834 aa		28.27	■■■□□ 2.12
MKL1-208	ENST00000466278	MRI	Q9BWK5	157 aa		28.27	■■■□□ 2.12
MKL1-208	ENST00000466278	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		28.27	■■■□□ 2.12
MKL1-208	ENST00000466278	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	28.27	■■■□□ 2.12
MKL1-208	ENST00000466278	SEMA3E	O15041	775 aa		28.26	■■■□□ 2.11
MKL1-208	ENST00000466278	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	28.26	■■■□□ 2.11
MKL1-208	ENST00000466278	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		28.26	■■■□□ 2.11
MKL1-208	ENST00000466278	PHKA1	P46020	1223 aa		28.25	■■■□□ 2.11
MKL1-208	ENST00000466278	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		28.25	■■■□□ 2.11
MKL1-208	ENST00000466278	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		28.25	■■■□□ 2.11
MKL1-208	ENST00000466278	CSRNP1	Q96S65	589 aa		28.25	■■■□□ 2.11
MKL1-208	ENST00000466278	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		28.24	■■■□□ 2.11
MKL1-208	ENST00000466278	ZBTB22	O15209	634 aa		28.24	■■■□□ 2.11
MKL1-208	ENST00000466278	TNNI2	P48788	182 aa		28.24	■■■□□ 2.11
MKL1-208	ENST00000466278	TFCP2	Q12800	502 aa		28.24	■■■□□ 2.11
MKL1-208	ENST00000466278	MAP3K11	Q16584	847 aa		28.24	■■■□□ 2.11
MKL1-208	ENST00000466278	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		28.24	■■■□□ 2.11
MKL1-208	ENST00000466278	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		28.24	■■■□□ 2.11
MKL1-208	ENST00000466278	ADORA1	P30542	326 aa		28.23	■■■□□ 2.11
MKL1-208	ENST00000466278	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	28.23	■■■□□ 2.11
MKL1-208	ENST00000466278		A0A1B0GUL7	405 aa		28.22	■■■□□ 2.11
MKL1-208	ENST00000466278	RLBP1	P12271	317 aa		28.22	■■■□□ 2.11
MKL1-208	ENST00000466278	CCDC102B	Q68D86	513 aa		28.22	■■■□□ 2.11
MKL1-208	ENST00000466278	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		28.22	■■■□□ 2.11
MKL1-208	ENST00000466278	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		28.22	■■■□□ 2.11
MKL1-208	ENST00000466278	FZD1	Q9UP38	647 aa		28.22	■■■□□ 2.11
MKL1-208	ENST00000466278	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		28.21	■■■□□ 2.11
MKL1-208	ENST00000466278	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		28.21	■■■□□ 2.11
MKL1-208	ENST00000466278	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		28.21	■■■□□ 2.11
MKL1-208	ENST00000466278	UNCX	A6NJT0	531 aa		28.2	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	TIMM10	P62072	90 aa		28.2	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	28.2	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	28.2	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	RNF186	Q9NXI6	227 aa		28.2	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	28.19	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	28.19	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	28.19	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	28.19	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	XAGE2	Q96GT9	111 aa		28.19	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	28.18	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	TRPA1	O75762	1119 aa		28.18	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	PRDX5	P30044	214 aa		28.18	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	POLA2	Q14181	598 aa		28.18	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	TEPSIN	Q96N21	525 aa		28.18	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		28.18	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	OTOF	Q9HC10	1997 aa		28.18	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	CAPN15	O75808	1086 aa		28.17	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	RASGRF1	Q13972	1273 aa		28.17	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		28.17	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	SSH3	Q8TE77	659 aa		28.17	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		28.17	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	28.16	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	CACNB3	P54284	484 aa		28.16	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	ATP8B2	P98198	1209 aa		28.16	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	SREBF2	Q12772	1141 aa		28.16	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	SPRYD7	Q5W111	196 aa		28.16	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	FAM83A	Q86UY5	434 aa		28.16	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		28.16	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		28.16	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		28.16	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	LAMB1	P07942	1786 aa		28.15	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	28.15	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	MS4A1	P11836	297 aa		28.15	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		28.15	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	28.15	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	28.14	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	28.14	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		28.14	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		28.14	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		28.14	■■■□□ 2.1
MKL1-208	ENST00000466278	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		28.14	■■■□□ 2.09
MKL1-208	ENST00000466278	TM4SF4	P48230	202 aa		28.13	■■■□□ 2.09
MKL1-208	ENST00000466278	GORAB	Q5T7V8	394 aa		28.13	■■■□□ 2.09
MKL1-208	ENST00000466278	PANK1	Q8TE04	598 aa		28.13	■■■□□ 2.09
MKL1-208	ENST00000466278	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	28.12	■■■□□ 2.09
MKL1-208	ENST00000466278	WNK4	Q96J92	1243 aa		28.12	■■■□□ 2.09
MKL1-208	ENST00000466278	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	28.11	■■■□□ 2.09
MKL1-208	ENST00000466278	HOOK2	Q96ED9	719 aa		28.11	■■■□□ 2.09
MKL1-208	ENST00000466278	GPR108	Q9NPR9	543 aa		28.11	■■■□□ 2.09
MKL1-208	ENST00000466278	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	28.11	■■■□□ 2.09
MKL1-208	ENST00000466278	ABCF2	Q9UG63	623 aa		28.11	■■■□□ 2.09
MKL1-208	ENST00000466278	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	28.1	■■■□□ 2.09

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