RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-210	ENST00000463041	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	MEIS3	Q99687	375 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	VEZT	Q9HBM0	779 aa		9.07	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	9.07	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	9.07	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	9.07	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	9.07	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	BCAR3	O75815	825 aa		9.06	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	TNNI2	P48788	182 aa		9.06	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	9.06	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	PRKG1	Q13976	671 aa		9.06	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		9.06	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	9.06	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		9.06	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	9.06	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	TEKT1	Q969V4	418 aa		9.06	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	SIL1	Q9H173	461 aa		9.06	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	9.06	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	MAST3	O60307	1309 aa		9.05	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	9.05	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	GNAI2	P04899	355 aa		9.05	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	TRIM27	P14373	513 aa		9.05	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	9.05	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	SREBF2	Q12772	1141 aa		9.05	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	MTX1	Q13505	466 aa		9.05	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	GRIK5	Q16478	980 aa		9.05	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	ATP2B3	Q16720	1220 aa		9.05	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		9.05	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	SPRYD7	Q5W111	196 aa		9.05	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	ABHD8	Q96I13	439 aa		9.05	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		9.05	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		9.05	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	AK9	Q5TCS8	1911 aa		9.04	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	SEMA3E	O15041	775 aa		9.04	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	SRGAP3	O43295	1099 aa		9.04	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		9.04	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	FAM83A	Q86UY5	434 aa		9.04	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		9.04	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		9.04	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	9.04	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		9.04	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	AOX1	Q06278	1338 aa		9.04	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	9.03	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		9.03	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	ALDH1A1	P00352	501 aa		9.03	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	9.03	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	TIMM10	P62072	90 aa		9.03	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	9.03	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	DGKZ	Q13574	1117 aa		9.03	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	9.03	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	9.03	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		9.03	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	HOOK2	Q96ED9	719 aa		9.03	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	TEPSIN	Q96N21	525 aa		9.03	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		9.03	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		9.03	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		9.03	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		9.02	□□□□□ -0.96
PTPRF-210	ENST00000463041	TBC1D8	O95759	1140 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	PHKA1	P46020	1223 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	MAP3K9	P80192	1104 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	CCDC102B	Q68D86	513 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	WNK4	Q96J92	1243 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	FZD1	Q9UP38	647 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041		A0A1B0GUL7	405 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	ATP8B2	P98198	1209 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	TFCP2	Q12800	502 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	9.01	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	9.01	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	9.01	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	SLF2	Q8IX21	1173 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	FAM151A	Q8WW52	585 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	9.01	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	XAGE2	Q96GT9	111 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	TNN	Q9UQP3	1299 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	9.01	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		9	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	9	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	GPR25	O00155	361 aa		9	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	9	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	PRDX5	P30044	214 aa		9	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	ADORA1	P30542	326 aa		9	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	GORAB	Q5T7V8	394 aa		9	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	DCAF15	Q66K64	600 aa		9	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	9	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	9	□□□□□ -0.97
PTPRF-210	ENST00000463041	IFNL1	Q8IU54	200 aa		9	□□□□□ -0.97

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