RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462123.5

SIKE1-204, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIKE1, Length 394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-204ENST00000462123 ZIC5Q96T25 663 aa25.9■■□□□ 1.74
SIKE1-204ENST00000462123 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
SIKE1-204ENST00000462123 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SIKE1-204ENST00000462123 AKAP2Q9Y2D5 859 aa25.9■■□□□ 1.74
SIKE1-204ENST00000462123 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa25.9■■□□□ 1.74
SIKE1-204ENST00000462123 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
SIKE1-204ENST00000462123 TEKT1Q969V4 418 aa25.89■■□□□ 1.74
SIKE1-204ENST00000462123 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.89■■□□□ 1.74
SIKE1-204ENST00000462123 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
SIKE1-204ENST00000462123 CLRN2A0PK11 232 aa25.88■■□□□ 1.73
SIKE1-204ENST00000462123 HHIPL2Q6UWX4 724 aa25.88■■□□□ 1.73
SIKE1-204ENST00000462123 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.88■■□□□ 1.73
SIKE1-204ENST00000462123 ZDHHC15Q96MV8 337 aa25.88■■□□□ 1.73
SIKE1-204ENST00000462123 CSRNP1Q96S65 589 aa25.88■■□□□ 1.73
SIKE1-204ENST00000462123 VEZTQ9HBM0 779 aa25.88■■□□□ 1.73
SIKE1-204ENST00000462123 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
SIKE1-204ENST00000462123 RASA3Q14644 834 aa25.87■■□□□ 1.73
SIKE1-204ENST00000462123 MOB2Q70IA6 237 aa25.87■■□□□ 1.73
SIKE1-204ENST00000462123 DENND2AQ9ULE3 1009 aa25.87■■□□□ 1.73
SIKE1-204ENST00000462123 TNNQ9UQP3 1299 aa25.87■■□□□ 1.73
SIKE1-204ENST00000462123 TNNI2P48788 182 aa25.86■■□□□ 1.73
SIKE1-204ENST00000462123 FKBP1CQ5VVH2 108 aa25.86■■□□□ 1.73
SIKE1-204ENST00000462123 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
SIKE1-204ENST00000462123 SALL1Q9NSC2 1324 aa25.86■■□□□ 1.73
SIKE1-204ENST00000462123 GRIK5Q16478 980 aa25.85■■□□□ 1.73
SIKE1-204ENST00000462123 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
SIKE1-204ENST00000462123 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
SIKE1-204ENST00000462123 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
SIKE1-204ENST00000462123 AOX1Q06278 1338 aa25.84■■□□□ 1.73
SIKE1-204ENST00000462123 TM4SF4P48230 202 aa25.83■■□□□ 1.73
SIKE1-204ENST00000462123 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
SIKE1-204ENST00000462123 MS4A1P11836 297 aa25.82■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 CCDC102BQ68D86 513 aa25.82■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 FAM83AQ86UY5 434 aa25.82■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 RNF186Q9NXI6 227 aa25.82■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 INHBEP58166 350 aa25.81■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.81■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.81■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 TMOD2Q9NZR1 351 aa25.81■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa25.8■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 A0A1B0GUL7 405 aa25.8■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 PHKA1P46020 1223 aa25.8■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 TIMM10P62072 90 aa25.8■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 ATP8B2P98198 1209 aa25.8■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 SREBF2Q12772 1141 aa25.8■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 TFCP2Q12800 502 aa25.8■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 POLA2Q14181 598 aa25.8■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 SSH3Q8TE77 659 aa25.8■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 HOOK2Q96ED9 719 aa25.8■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 TEPSINQ96N21 525 aa25.8■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 LDHBP07195 334 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 PRKG1Q13976 671 aa25.79■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 SPRYD7Q5W111 196 aa25.79■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 GPR108Q9NPR9 543 aa25.79■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.78■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 USP2O75604 605 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa25.78■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 XAGE2Q96GT9 111 aa25.78■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 TSKSQ9UJT2 592 aa25.78■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 TCP10L2B9ZVM9 353 aa25.77■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 TRPA1O75762 1119 aa25.77■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.77■■□□□ 1.72
SIKE1-204ENST00000462123 ADORA1P30542 326 aa25.76■■□□□ 1.71
SIKE1-204ENST00000462123 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
SIKE1-204ENST00000462123 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
SIKE1-204ENST00000462123 CFHR5Q9BXR6 569 aa25.76■■□□□ 1.71
SIKE1-204ENST00000462123 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.76■■□□□ 1.71
SIKE1-204ENST00000462123 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
SIKE1-204ENST00000462123 RLBP1P12271 317 aa25.75■■□□□ 1.71
SIKE1-204ENST00000462123 PRDX5P30044 214 aa25.75■■□□□ 1.71
SIKE1-204ENST00000462123 SLF2Q8IX21 1173 aa25.75■■□□□ 1.71
SIKE1-204ENST00000462123 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
SIKE1-204ENST00000462123 ALDH1A1P00352 501 aa25.74■■□□□ 1.71
SIKE1-204ENST00000462123 RASGRF1Q13972 1273 aa25.74■■□□□ 1.71
SIKE1-204ENST00000462123 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
SIKE1-204ENST00000462123 TMEM39BQ9GZU3 492 aa25.74■■□□□ 1.71
SIKE1-204ENST00000462123 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa25.74■■□□□ 1.71
SIKE1-204ENST00000462123 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
SIKE1-204ENST00000462123 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.73■■□□□ 1.71
SIKE1-204ENST00000462123 GORABQ5T7V8 394 aa25.72■■□□□ 1.71
SIKE1-204ENST00000462123 FAM151AQ8WW52 585 aa25.72■■□□□ 1.71
SIKE1-204ENST00000462123 WNK4Q96J92 1243 aa25.72■■□□□ 1.71
SIKE1-204ENST00000462123 IGSF3O75054 1194 aa25.71■■□□□ 1.71
SIKE1-204ENST00000462123 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.71■■□□□ 1.71
SIKE1-204ENST00000462123 MAP3K9P80192 1104 aa25.71■■□□□ 1.71
SIKE1-204ENST00000462123 CLMNQ96JQ2 1002 aa25.71■■□□□ 1.71
SIKE1-204ENST00000462123 FZD1Q9UP38 647 aa25.71■■□□□ 1.71
SIKE1-204ENST00000462123 ECM29Q5VYK3 1845 aa25.71■■□□□ 1.71
SIKE1-204ENST00000462123 GAKO14976 1311 aa25.7■■□□□ 1.71
SIKE1-204ENST00000462123 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
SIKE1-204ENST00000462123 DIXDC1Q155Q3 683 aa25.7■■□□□ 1.7
SIKE1-204ENST00000462123 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa25.7■■□□□ 1.7
SIKE1-204ENST00000462123 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
SIKE1-204ENST00000462123 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
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