RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459667.1

VARS-218, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene VARS, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-218ENST00000459667 TNNI3KQ59H18 835 aa25.56■■□□□ 1.68
VARS-218ENST00000459667 C2orf69Q8N8R5 385 aa25.56■■□□□ 1.68
VARS-218ENST00000459667 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.56■■□□□ 1.68
VARS-218ENST00000459667 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa25.56■■□□□ 1.68
VARS-218ENST00000459667 AOX1Q06278 1338 aa25.56■■□□□ 1.68
VARS-218ENST00000459667 HMMRO75330 724 aa25.55■■□□□ 1.68
VARS-218ENST00000459667 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
VARS-218ENST00000459667 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa25.55■■□□□ 1.68
VARS-218ENST00000459667 TEKT1Q969V4 418 aa25.55■■□□□ 1.68
VARS-218ENST00000459667 VEZTQ9HBM0 779 aa25.55■■□□□ 1.68
VARS-218ENST00000459667 SALL1Q9NSC2 1324 aa25.55■■□□□ 1.68
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VARS-218ENST00000459667 ECE1P42892 770 aa25.53■■□□□ 1.68
VARS-218ENST00000459667 CYP4F22Q6NT55 531 aa25.53■■□□□ 1.68
VARS-218ENST00000459667 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.53■■□□□ 1.68
VARS-218ENST00000459667 HHIPL1Q96JK4 782 aa25.53■■□□□ 1.68
VARS-218ENST00000459667 CAPNS2Q96L46 248 aa25.53■■□□□ 1.68
VARS-218ENST00000459667 MRIQ9BWK5 157 aa25.53■■□□□ 1.68
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VARS-218ENST00000459667 SPDYE2Q495Y8 402 aa25.52■■□□□ 1.68
VARS-218ENST00000459667 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.52■■□□□ 1.68
VARS-218ENST00000459667 SIRT2Q8IXJ6 389 aa25.52■■□□□ 1.68
VARS-218ENST00000459667 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
VARS-218ENST00000459667 DEFB129Q9H1M3 183 aa25.52■■□□□ 1.68
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VARS-218ENST00000459667 ZDHHC15Q96MV8 337 aa25.51■■□□□ 1.67
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VARS-218ENST00000459667 FKBP1BP68106 108 aa25.5■■□□□ 1.67
VARS-218ENST00000459667 HHIPL2Q6UWX4 724 aa25.5■■□□□ 1.67
VARS-218ENST00000459667 THSD7BQ9C0I4 1608 aa25.49■■□□□ 1.67
VARS-218ENST00000459667 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.49■■□□□ 1.67
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VARS-218ENST00000459667 SPATA5Q8NB90 893 aa25.49■■□□□ 1.67
VARS-218ENST00000459667 HMG20BQ9P0W2 317 aa25.49■■□□□ 1.67
VARS-218ENST00000459667 ABCF2Q9UG63 623 aa25.49■■□□□ 1.67
VARS-218ENST00000459667 DIXDC1Q155Q3 683 aa25.48■■□□□ 1.67
VARS-218ENST00000459667 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.48■■□□□ 1.67
VARS-218ENST00000459667 PI16Q6UXB8 463 aa25.48■■□□□ 1.67
VARS-218ENST00000459667 MCAMP43121 646 aa25.47■■□□□ 1.67
VARS-218ENST00000459667 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
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VARS-218ENST00000459667 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
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VARS-218ENST00000459667 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
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VARS-218ENST00000459667 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.45■■□□□ 1.66
VARS-218ENST00000459667 TMOD2Q9NZR1 351 aa25.45■■□□□ 1.66
VARS-218ENST00000459667 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.44■■□□□ 1.66
VARS-218ENST00000459667 MYH2Q9UKX2 1941 aa25.44■■□□□ 1.66
VARS-218ENST00000459667 TNNI2P48788 182 aa25.44■■□□□ 1.66
VARS-218ENST00000459667 CACNB3P54284 484 aa25.44■■□□□ 1.66
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VARS-218ENST00000459667 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.44■■□□□ 1.66
VARS-218ENST00000459667 AOC2O75106 756 aa25.43■■□□□ 1.66
VARS-218ENST00000459667 RAB11FIP3O75154 756 aa25.43■■□□□ 1.66
VARS-218ENST00000459667 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
VARS-218ENST00000459667 PRKG1Q13976 671 aa25.43■■□□□ 1.66
VARS-218ENST00000459667 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
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VARS-218ENST00000459667 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa25.42■■□□□ 1.66
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VARS-218ENST00000459667 SNRKQ9NRH2 765 aa25.42■■□□□ 1.66
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VARS-218ENST00000459667 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
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VARS-218ENST00000459667 NOGQ13253 232 aa25.4■■□□□ 1.66
VARS-218ENST00000459667 FKBP1CQ5VVH2 108 aa25.4■■□□□ 1.66
VARS-218ENST00000459667 TMEM39BQ9GZU3 492 aa25.4■■□□□ 1.66
VARS-218ENST00000459667 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
VARS-218ENST00000459667 FZD1Q9UP38 647 aa25.4■■□□□ 1.66
VARS-218ENST00000459667 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
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