RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, human

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PBRM1-218	ENST00000458294	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		33.22	■■■□□ 2.91
PBRM1-218	ENST00000458294	OPTN	Q96CV9	577 aa		33.22	■■■□□ 2.91
PBRM1-218	ENST00000458294	ELP3	Q9H9T3	547 aa		33.22	■■■□□ 2.91
PBRM1-218	ENST00000458294	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	33.21	■■■□□ 2.91
PBRM1-218	ENST00000458294	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PBRM1-218	ENST00000458294	PTPN18	Q99952	460 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PBRM1-218	ENST00000458294	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	33.21	■■■□□ 2.91
PBRM1-218	ENST00000458294	HTT	P42858	3142 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PBRM1-218	ENST00000458294	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		33.2	■■■□□ 2.91
PBRM1-218	ENST00000458294	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PBRM1-218	ENST00000458294	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	33.19	■■■□□ 2.9
PBRM1-218	ENST00000458294	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PBRM1-218	ENST00000458294	METTL24	Q5JXM2	366 aa		33.18	■■■□□ 2.9
PBRM1-218	ENST00000458294	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
PBRM1-218	ENST00000458294	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		33.18	■■■□□ 2.9
PBRM1-218	ENST00000458294	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		33.18	■■■□□ 2.9
PBRM1-218	ENST00000458294	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		33.18	■■■□□ 2.9
PBRM1-218	ENST00000458294	SP3	Q02447	781 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PBRM1-218	ENST00000458294	LRRC24	Q50LG9	513 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PBRM1-218	ENST00000458294	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PBRM1-218	ENST00000458294	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PBRM1-218	ENST00000458294	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PBRM1-218	ENST00000458294	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
PBRM1-218	ENST00000458294	ZNF521	Q96K83	1311 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PBRM1-218	ENST00000458294	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
PBRM1-218	ENST00000458294	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
PBRM1-218	ENST00000458294	PDE8B	O95263	885 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PBRM1-218	ENST00000458294	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
PBRM1-218	ENST00000458294	PTPRC	P08575	1304 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PBRM1-218	ENST00000458294	MAP3K9	P80192	1104 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PBRM1-218	ENST00000458294	VGLL4	Q14135	290 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PBRM1-218	ENST00000458294	GRIK5	Q16478	980 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PBRM1-218	ENST00000458294	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	33.15	■■■□□ 2.9
PBRM1-218	ENST00000458294	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	33.15	■■■□□ 2.9
PBRM1-218	ENST00000458294	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PBRM1-218	ENST00000458294	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	33.15	■■■□□ 2.9
PBRM1-218	ENST00000458294	TEKT1	Q969V4	418 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PBRM1-218	ENST00000458294	EFCC1	Q9HA90	598 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PBRM1-218	ENST00000458294	CSAD	Q9Y600	493 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PBRM1-218	ENST00000458294	GTF2A2	P52657	109 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PBRM1-218	ENST00000458294	MRI	Q9BWK5	157 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PBRM1-218	ENST00000458294	KIF16B	Q96L93	1317 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PBRM1-218	ENST00000458294	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PBRM1-218	ENST00000458294	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	33.11	■■■□□ 2.89
PBRM1-218	ENST00000458294	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PBRM1-218	ENST00000458294	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PBRM1-218	ENST00000458294	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PBRM1-218	ENST00000458294	MAST3	O60307	1309 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PBRM1-218	ENST00000458294	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PBRM1-218	ENST00000458294	CCL15	Q16663	113 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PBRM1-218	ENST00000458294	ARMC5	Q96C12	935 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PBRM1-218	ENST00000458294	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PBRM1-218	ENST00000458294	CENPF	P49454	3210 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PBRM1-218	ENST00000458294	POTEF	A5A3E0	1075 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PBRM1-218	ENST00000458294	BCAM	P50895	628 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PBRM1-218	ENST00000458294	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
PBRM1-218	ENST00000458294	FAM83A	Q86UY5	434 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PBRM1-218	ENST00000458294	OTUD5	Q96G74	571 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PBRM1-218	ENST00000458294	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PBRM1-218	ENST00000458294	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PBRM1-218	ENST00000458294	CACNB3	P54284	484 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PBRM1-218	ENST00000458294	ARHGEF6	Q15052	776 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PBRM1-218	ENST00000458294	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
PBRM1-218	ENST00000458294	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PBRM1-218	ENST00000458294	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PBRM1-218	ENST00000458294	HOOK2	Q96ED9	719 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PBRM1-218	ENST00000458294	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	33.07	■■■□□ 2.88
PBRM1-218	ENST00000458294	USP44	Q9H0E7	712 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PBRM1-218	ENST00000458294	FGFR2	P21802	821 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PBRM1-218	ENST00000458294	CAP1	Q01518	475 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PBRM1-218	ENST00000458294	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
PBRM1-218	ENST00000458294	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PBRM1-218	ENST00000458294	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PBRM1-218	ENST00000458294	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
PBRM1-218	ENST00000458294	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
PBRM1-218	ENST00000458294	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PBRM1-218	ENST00000458294	ERO1B	Q86YB8	467 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PBRM1-218	ENST00000458294	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PBRM1-218	ENST00000458294	GCC1	Q96CN9	775 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PBRM1-218	ENST00000458294	WRNIP1	Q96S55	665 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PBRM1-218	ENST00000458294	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PBRM1-218	ENST00000458294		E9PSI1	815 aa		33.03	■■■□□ 2.88
PBRM1-218	ENST00000458294	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
PBRM1-218	ENST00000458294	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
PBRM1-218	ENST00000458294	CETP	P11597	493 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PBRM1-218	ENST00000458294	DCAF15	Q66K64	600 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PBRM1-218	ENST00000458294	EYA2	O00167	538 aa		33.01	■■■□□ 2.87
PBRM1-218	ENST00000458294	SLC5A1	P13866	664 aa		33	■■■□□ 2.87
PBRM1-218	ENST00000458294	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	33	■■■□□ 2.87
PBRM1-218	ENST00000458294	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		33	■■■□□ 2.87
PBRM1-218	ENST00000458294	LPIN2	Q92539	896 aa		33	■■■□□ 2.87
PBRM1-218	ENST00000458294	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	33	■■■□□ 2.87
PBRM1-218	ENST00000458294	BRCA2	P51587	3418 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PBRM1-218	ENST00000458294	SNAPC2	Q13487	334 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PBRM1-218	ENST00000458294	ZNF333	Q96JL9	665 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PBRM1-218	ENST00000458294	TLR2	O60603	784 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PBRM1-218	ENST00000458294	PPIL2	Q13356	520 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PBRM1-218	ENST00000458294	NBPF11	Q86T75	865 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PBRM1-218	ENST00000458294	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PBRM1-218	ENST00000458294	IRF6	O14896	467 aa		32.97	■■■□□ 2.87

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