RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455020.2

SPDYE2B-202, Transcript of speedy/RINGO cell cycle regulator family member E2B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPDYE2B, Length 1,219 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE2B-202ENST00000455020 LINS1Q8NG48 757 aa25.27■■□□□ 1.64
SPDYE2B-202ENST00000455020 DNAAF4Q8WXU2 420 aa25.27■■□□□ 1.64
SPDYE2B-202ENST00000455020 TCP10L2B9ZVM9 353 aa25.26■■□□□ 1.63
SPDYE2B-202ENST00000455020 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SPDYE2B-202ENST00000455020 MFSD14BQ5SR56 506 aa25.26■■□□□ 1.63
SPDYE2B-202ENST00000455020 SERPINA10Q9UK55 444 aa25.26■■□□□ 1.63
SPDYE2B-202ENST00000455020 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SPDYE2B-202ENST00000455020 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.26■■□□□ 1.63
SPDYE2B-202ENST00000455020 ARHGEF6Q15052 776 aa25.25■■□□□ 1.63
SPDYE2B-202ENST00000455020 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SPDYE2B-202ENST00000455020 SPDYE5A6NIY4 337 aa25.24■■□□□ 1.63
SPDYE2B-202ENST00000455020 MAP3K9P80192 1104 aa25.24■■□□□ 1.63
SPDYE2B-202ENST00000455020 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
SPDYE2B-202ENST00000455020 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
SPDYE2B-202ENST00000455020 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
SPDYE2B-202ENST00000455020 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa25.24■■□□□ 1.63
SPDYE2B-202ENST00000455020 LAMA3Q16787 3333 aa25.24■■□□□ 1.63
SPDYE2B-202ENST00000455020 PLIN1O60240 522 aa25.23■■□□□ 1.63
SPDYE2B-202ENST00000455020 TLR2O60603 784 aa25.23■■□□□ 1.63
SPDYE2B-202ENST00000455020 GRIK5Q16478 980 aa25.23■■□□□ 1.63
SPDYE2B-202ENST00000455020 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.23■■□□□ 1.63
SPDYE2B-202ENST00000455020 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SPDYE2B-202ENST00000455020 CSADQ9Y600 493 aa25.23■■□□□ 1.63
SPDYE2B-202ENST00000455020 COL6A3P12111 3177 aa25.23■■□□□ 1.63
SPDYE2B-202ENST00000455020 BTBD19C9JJ37 291 aa25.22■■□□□ 1.63
SPDYE2B-202ENST00000455020 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SPDYE2B-202ENST00000455020 CTGFP29279 349 aa25.22■■□□□ 1.63
SPDYE2B-202ENST00000455020 MTFR1Q15390 333 aa25.22■■□□□ 1.63
SPDYE2B-202ENST00000455020 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SPDYE2B-202ENST00000455020 CRKP46108 304 aa25.21■■□□□ 1.63
SPDYE2B-202ENST00000455020 GYG1P46976 350 aa25.21■■□□□ 1.63
SPDYE2B-202ENST00000455020 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SPDYE2B-202ENST00000455020 CACNB3P54284 484 aa25.2■■□□□ 1.62
SPDYE2B-202ENST00000455020 LMBR1LQ6UX01 489 aa25.2■■□□□ 1.62
SPDYE2B-202ENST00000455020 IRF6O14896 467 aa25.18■■□□□ 1.62
SPDYE2B-202ENST00000455020 CETPP11597 493 aa25.18■■□□□ 1.62
SPDYE2B-202ENST00000455020 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa25.18■■□□□ 1.62
SPDYE2B-202ENST00000455020 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SPDYE2B-202ENST00000455020 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.18■■□□□ 1.62
SPDYE2B-202ENST00000455020 F6X3S4 739 aa25.17■■□□□ 1.62
SPDYE2B-202ENST00000455020 TNNI2P48788 182 aa25.17■■□□□ 1.62
SPDYE2B-202ENST00000455020 KIF22Q14807 665 aa25.17■■□□□ 1.62
SPDYE2B-202ENST00000455020 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SPDYE2B-202ENST00000455020 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SPDYE2B-202ENST00000455020 WRNIP1Q96S55 665 aa25.17■■□□□ 1.62
SPDYE2B-202ENST00000455020 MGAMO43451 1857 aa25.16■■□□□ 1.62
SPDYE2B-202ENST00000455020 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.16■■□□□ 1.62
SPDYE2B-202ENST00000455020 BEND3Q5T5X7 828 aa25.16■■□□□ 1.62
SPDYE2B-202ENST00000455020 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa25.16■■□□□ 1.62
SPDYE2B-202ENST00000455020 ERO1BQ86YB8 467 aa25.16■■□□□ 1.62
SPDYE2B-202ENST00000455020 PRO3102Q9H379 93 aa25.16■■□□□ 1.62
SPDYE2B-202ENST00000455020 ADGRA2Q96PE1 1338 aa25.15■■□□□ 1.62
SPDYE2B-202ENST00000455020 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SPDYE2B-202ENST00000455020 SNAPC2Q13487 334 aa25.15■■□□□ 1.62
SPDYE2B-202ENST00000455020 CCDC57Q2TAC2 916 aa25.15■■□□□ 1.62
SPDYE2B-202ENST00000455020 C17orf99Q6UX52 265 aa25.15■■□□□ 1.62
SPDYE2B-202ENST00000455020 TRIM47Q96LD4 638 aa25.15■■□□□ 1.62
SPDYE2B-202ENST00000455020 GNRH1P01148 92 aa25.14■■□□□ 1.62
SPDYE2B-202ENST00000455020 PRMT2P55345 433 aa25.14■■□□□ 1.62
SPDYE2B-202ENST00000455020 PPIL2Q13356 520 aa25.14■■□□□ 1.62
SPDYE2B-202ENST00000455020 UBE4AQ14139 1066 aa25.14■■□□□ 1.62
SPDYE2B-202ENST00000455020 WWC1Q8IX03 1113 aa25.14■■□□□ 1.62
SPDYE2B-202ENST00000455020 DPF3Q92784 378 aa25.14■■□□□ 1.62
SPDYE2B-202ENST00000455020 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
SPDYE2B-202ENST00000455020 CPA4Q9UI42 421 aa25.14■■□□□ 1.62
SPDYE2B-202ENST00000455020 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
SPDYE2B-202ENST00000455020 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.13■■□□□ 1.61
SPDYE2B-202ENST00000455020 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SPDYE2B-202ENST00000455020 OSBPP22059 807 aa25.13■■□□□ 1.61
SPDYE2B-202ENST00000455020 SRRDQ9UH36 339 aa25.13■■□□□ 1.61
SPDYE2B-202ENST00000455020 A0A0C4DFX4 3053 aa25.13■■□□□ 1.61
SPDYE2B-202ENST00000455020 CCDC27Q2M243 656 aa25.12■■□□□ 1.61
SPDYE2B-202ENST00000455020 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SPDYE2B-202ENST00000455020 CUL9Q8IWT3 2517 aa25.12■■□□□ 1.61
SPDYE2B-202ENST00000455020 GRM8O00222 908 aa25.11■■□□□ 1.61
SPDYE2B-202ENST00000455020 PSMC4P43686 418 aa25.11■■□□□ 1.61
SPDYE2B-202ENST00000455020 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
SPDYE2B-202ENST00000455020 ALPK3Q96L96 1907 aa25.11■■□□□ 1.61
SPDYE2B-202ENST00000455020 MYH13Q9UKX3 1938 aa25.11■■□□□ 1.61
SPDYE2B-202ENST00000455020 GRK4P32298 578 aa25.1■■□□□ 1.61
SPDYE2B-202ENST00000455020 GJA8P48165 433 aa25.1■■□□□ 1.61
SPDYE2B-202ENST00000455020 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
SPDYE2B-202ENST00000455020 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25.1■■□□□ 1.61
SPDYE2B-202ENST00000455020 MYPNQ86TC9 1320 aa25.1■■□□□ 1.61
SPDYE2B-202ENST00000455020 CCL5P13501 91 aa25.09■■□□□ 1.61
SPDYE2B-202ENST00000455020 INPP5BP32019 993 aa25.09■■□□□ 1.61
SPDYE2B-202ENST00000455020 IL16Q14005 1332 aa25.09■■□□□ 1.61
SPDYE2B-202ENST00000455020 GJB1P08034 283 aa25.08■■□□□ 1.61
SPDYE2B-202ENST00000455020 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
SPDYE2B-202ENST00000455020 FAM83AQ86UY5 434 aa25.08■■□□□ 1.61
SPDYE2B-202ENST00000455020 RAET1EQ8TD07 263 aa25.08■■□□□ 1.61
SPDYE2B-202ENST00000455020 TEKT1Q969V4 418 aa25.08■■□□□ 1.61
SPDYE2B-202ENST00000455020 PDHXO00330 501 aa25.07■■□□□ 1.6
SPDYE2B-202ENST00000455020 VAMP4O75379 141 aa25.07■■□□□ 1.6
SPDYE2B-202ENST00000455020 MOGSQ13724 837 aa25.07■■□□□ 1.6
SPDYE2B-202ENST00000455020 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SPDYE2B-202ENST00000455020 FBXO33Q7Z6M2 555 aa25.07■■□□□ 1.6
SPDYE2B-202ENST00000455020 ANKRD23Q86SG2 305 aa25.07■■□□□ 1.6
SPDYE2B-202ENST00000455020 NKX2-3Q8TAU0 364 aa25.07■■□□□ 1.6
SPDYE2B-202ENST00000455020 ZDHHC15Q96MV8 337 aa25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms