RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452979.5

HERC3-207, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HERC3, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-207ENST00000452979 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 ELP3Q9H9T3 547 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 EFCC1Q9HA90 598 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 CAP1Q01518 475 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 CRKP46108 304 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 MAP3K9P80192 1104 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 FBXO33Q7Z6M2 555 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 CDAN1Q8IWY9 1227 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 UTYO14607 1347 aa14.74□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 MROH5Q6ZUA9 1318 aa14.74□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 BRCA2P51587 3418 aa14.74□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 TNNI2P48788 182 aa14.74□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 GTF2A2P52657 109 aa14.74□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 VGLL4Q14135 290 aa14.74□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 BRI3BPQ8WY22 251 aa14.74□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 MRIQ9BWK5 157 aa14.74□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 TMEM39BQ9GZU3 492 aa14.74□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 TCP10L2B9ZVM9 353 aa14.73□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 ARHGEF6Q15052 776 aa14.73□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 GRIK5Q16478 980 aa14.73□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 MIER1Q8N108 512 aa14.73□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.73□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa14.73□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 MRS2Q9HD23 443 aa14.73□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa14.72□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 CCL15Q16663 113 aa14.72□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 SLC4A10Q6U841 1118 aa14.72□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa14.72□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 SUCLG2Q96I99 432 aa14.72□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 ZNF333Q96JL9 665 aa14.72□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 CSADQ9Y600 493 aa14.72□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 SPDYE5A6NIY4 337 aa14.71□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 FKBP1CQ5VVH2 108 aa14.71□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 NBPF11Q86T75 865 aa14.71□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 FAM83AQ86UY5 434 aa14.71□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 FAM43AQ8N2R8 423 aa14.71□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 VGLL2Q8N8G2 317 aa14.71□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HERC3-207ENST00000452979 PDE8BO95263 885 aa14.7□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 CAVIN4Q5BKX8 364 aa14.7□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 VPS37DQ86XT2 251 aa14.7□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 TEKT1Q969V4 418 aa14.7□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 OTUD5Q96G74 571 aa14.7□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 ZDHHC15Q96MV8 337 aa14.7□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.7□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa14.7□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 TLR2O60603 784 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 CETPP11597 493 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 LRRC24Q50LG9 513 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 ERO1BQ86YB8 467 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 HOOK2Q96ED9 719 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 KIF16BQ96L93 1317 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 GNRH1P01148 92 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 METTL24Q5JXM2 366 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 HHIPL2Q6UWX4 724 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 ANKRD44Q8N8A2 993 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 IRF6O14896 467 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 FGFR2P21802 821 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 BCAMP50895 628 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 CACNB3P54284 484 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 PPIL2Q13356 520 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 MAST3O60307 1309 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 BTBD19C9JJ37 291 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 PRMT2P55345 433 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 PPATQ06203 517 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 SNAPC2Q13487 334 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 WRNIP1Q96S55 665 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 TMOD2Q9NZR1 351 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 MYH13Q9UKX3 1938 aa14.65□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 DCAF15Q66K64 600 aa14.65□□□□□ -0.06
HERC3-207ENST00000452979 KLHDC4Q8TBB5 520 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 200.3 ms