RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450375.5

PARL-208, Transcript of presenilin associated rhomboid like, human

TSL 2

Gene PARL, Length 488 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PARL-208	ENST00000450375	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PARL-208	ENST00000450375	VEZT	Q9HBM0	779 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PARL-208	ENST00000450375	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PARL-208	ENST00000450375	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.6
PARL-208	ENST00000450375	CLRN2	A0PK11	232 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	ATP2B3	Q16720	1220 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	SRGAP3	O43295	1099 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	GNAI2	P04899	355 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	SLC10A3	P09131	477 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	FGFR2	P21802	821 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	PRKG1	Q13976	671 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	MOB2	Q70IA6	237 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	COPRS	Q9NQ92	184 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	TSKS	Q9UJT2	592 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	AK9	Q5TCS8	1911 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	CRK	P46108	304 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	TNFAIP1	Q13829	316 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	ZIC5	Q96T25	663 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	TNN	Q9UQP3	1299 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	MAST3	O60307	1309 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	TEKT1	Q969V4	418 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	TNNI2	P48788	182 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	MTX1	Q13505	466 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	RASA3	Q14644	834 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	HAX1	O00165	279 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	EVX2	Q03828	476 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	AOX1	Q06278	1338 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	11.22	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	GRIK5	Q16478	980 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	SEMA3E	O15041	775 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	TRPA1	O75762	1119 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	PHKA1	P46020	1223 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	TFCP2	Q12800	502 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	GORAB	Q5T7V8	394 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	CSRNP1	Q96S65	589 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	MRI	Q9BWK5	157 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	RNF186	Q9NXI6	227 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PARL-208	ENST00000450375	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PARL-208	ENST00000450375		A0A1B0GUL7	405 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PARL-208	ENST00000450375	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PARL-208	ENST00000450375	ADORA1	P30542	326 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PARL-208	ENST00000450375	TIMM10	P62072	90 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PARL-208	ENST00000450375	SREBF2	Q12772	1141 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PARL-208	ENST00000450375	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PARL-208	ENST00000450375	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PARL-208	ENST00000450375	CCDC102B	Q68D86	513 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PARL-208	ENST00000450375	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PARL-208	ENST00000450375	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PARL-208	ENST00000450375	XAGE2	Q96GT9	111 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PARL-208	ENST00000450375	FZD1	Q9UP38	647 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PARL-208	ENST00000450375	UNCX	A6NJT0	531 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PARL-208	ENST00000450375	MS4A1	P11836	297 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PARL-208	ENST00000450375	CACNB3	P54284	484 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PARL-208	ENST00000450375	MAP3K11	Q16584	847 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PARL-208	ENST00000450375	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PARL-208	ENST00000450375	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PARL-208	ENST00000450375	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PARL-208	ENST00000450375	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PARL-208	ENST00000450375	OTOF	Q9HC10	1997 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PARL-208	ENST00000450375	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62

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