RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450098.1

HES6-209, Transcript of hes family bHLH transcription factor 6, human

TSL 3

Gene HES6, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HES6-209	ENST00000450098	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		42.18	■■■■■ 4.34
HES6-209	ENST00000450098	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		42.18	■■■■■ 4.34
HES6-209	ENST00000450098	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		42.18	■■■■■ 4.34
HES6-209	ENST00000450098	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	42.17	■■■■■ 4.34
HES6-209	ENST00000450098	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	42.17	■■■■■ 4.34
HES6-209	ENST00000450098	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		42.17	■■■■■ 4.34
HES6-209	ENST00000450098	SRGAP3	O43295	1099 aa		42.16	■■■■■ 4.34
HES6-209	ENST00000450098	TNFAIP1	Q13829	316 aa		42.16	■■■■■ 4.34
HES6-209	ENST00000450098	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	42.16	■■■■■ 4.34
HES6-209	ENST00000450098	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	42.16	■■■■■ 4.34
HES6-209	ENST00000450098	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		42.15	■■■■■ 4.34
HES6-209	ENST00000450098	RASA3	Q14644	834 aa		42.15	■■■■■ 4.34
HES6-209	ENST00000450098	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		42.15	■■■■■ 4.34
HES6-209	ENST00000450098	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		42.15	■■■■■ 4.34
HES6-209	ENST00000450098	GNAI2	P04899	355 aa		42.13	■■■■■ 4.33
HES6-209	ENST00000450098	TEKT1	Q969V4	418 aa		42.13	■■■■■ 4.33
HES6-209	ENST00000450098	RNF186	Q9NXI6	227 aa		42.13	■■■■■ 4.33
HES6-209	ENST00000450098	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	42.12	■■■■■ 4.33
HES6-209	ENST00000450098	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		42.12	■■■■■ 4.33
HES6-209	ENST00000450098	MAST3	O60307	1309 aa		42.12	■■■■■ 4.33
HES6-209	ENST00000450098	MAP3K11	Q16584	847 aa		42.11	■■■■■ 4.33
HES6-209	ENST00000450098	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	42.11	■■■■■ 4.33
HES6-209	ENST00000450098	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		42.11	■■■■■ 4.33
HES6-209	ENST00000450098	MRI	Q9BWK5	157 aa		42.11	■■■■■ 4.33
HES6-209	ENST00000450098	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	42.11	■■■■■ 4.33
HES6-209	ENST00000450098	FZD1	Q9UP38	647 aa		42.11	■■■■■ 4.33
HES6-209	ENST00000450098	TRPA1	O75762	1119 aa		42.09	■■■■■ 4.33
HES6-209	ENST00000450098	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		42.08	■■■■■ 4.33
HES6-209	ENST00000450098	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		42.05	■■■■■ 4.32
HES6-209	ENST00000450098	TNNI2	P48788	182 aa		42.05	■■■■■ 4.32
HES6-209	ENST00000450098	UNCX	A6NJT0	531 aa		42.04	■■■■■ 4.32
HES6-209	ENST00000450098	SEMA3E	O15041	775 aa		42.04	■■■■■ 4.32
HES6-209	ENST00000450098	PHKA1	P46020	1223 aa		42.04	■■■■■ 4.32
HES6-209	ENST00000450098	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	42.04	■■■■■ 4.32
HES6-209	ENST00000450098	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		42.03	■■■■■ 4.32
HES6-209	ENST00000450098	ADORA1	P30542	326 aa		42.03	■■■■■ 4.32
HES6-209	ENST00000450098	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		42.03	■■■■■ 4.32
HES6-209	ENST00000450098	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	42.03	■■■■■ 4.32
HES6-209	ENST00000450098	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		42.03	■■■■■ 4.32
HES6-209	ENST00000450098	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		42.03	■■■■■ 4.32
HES6-209	ENST00000450098	ZBTB22	O15209	634 aa		42.02	■■■■■ 4.32
HES6-209	ENST00000450098	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	42.02	■■■■■ 4.32
HES6-209	ENST00000450098	SPRYD7	Q5W111	196 aa		42.02	■■■■■ 4.32
HES6-209	ENST00000450098	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	42.02	■■■■■ 4.32
HES6-209	ENST00000450098	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		42.02	■■■■■ 4.32
HES6-209	ENST00000450098	TEPSIN	Q96N21	525 aa		42.02	■■■■■ 4.32
HES6-209	ENST00000450098	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		42.02	■■■■■ 4.32
HES6-209	ENST00000450098	TFCP2	Q12800	502 aa		42.01	■■■■■ 4.32
HES6-209	ENST00000450098	CCDC102B	Q68D86	513 aa		42.01	■■■■■ 4.32
HES6-209	ENST00000450098	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		42	■■■■■ 4.31
HES6-209	ENST00000450098	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	42	■■■■■ 4.31
HES6-209	ENST00000450098	TM4SF4	P48230	202 aa		42	■■■■■ 4.31
HES6-209	ENST00000450098	ABHD8	Q96I13	439 aa		42	■■■■■ 4.31
HES6-209	ENST00000450098	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		42	■■■■■ 4.31
HES6-209	ENST00000450098	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		42	■■■■■ 4.31
HES6-209	ENST00000450098	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		42	■■■■■ 4.31
HES6-209	ENST00000450098	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		41.99	■■■■■ 4.31
HES6-209	ENST00000450098	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		41.99	■■■■■ 4.31
HES6-209	ENST00000450098		A0A1B0GUL7	405 aa		41.99	■■■■■ 4.31
HES6-209	ENST00000450098	TIMM10	P62072	90 aa		41.99	■■■■■ 4.31
HES6-209	ENST00000450098	SREBF2	Q12772	1141 aa		41.99	■■■■■ 4.31
HES6-209	ENST00000450098	CACNB3	P54284	484 aa		41.98	■■■■■ 4.31
HES6-209	ENST00000450098	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		41.98	■■■■■ 4.31
HES6-209	ENST00000450098	PRDX5	P30044	214 aa		41.97	■■■■■ 4.31
HES6-209	ENST00000450098	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		41.96	■■■■■ 4.31
HES6-209	ENST00000450098	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	41.95	■■■■■ 4.31
HES6-209	ENST00000450098	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	41.95	■■■■■ 4.31
HES6-209	ENST00000450098	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		41.95	■■■■■ 4.31
HES6-209	ENST00000450098	XAGE2	Q96GT9	111 aa		41.95	■■■■■ 4.31
HES6-209	ENST00000450098	RLBP1	P12271	317 aa		41.94	■■■■■ 4.3
HES6-209	ENST00000450098	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	41.94	■■■■■ 4.3
HES6-209	ENST00000450098	FAM83A	Q86UY5	434 aa		41.94	■■■■■ 4.3
HES6-209	ENST00000450098	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		41.94	■■■■■ 4.3
HES6-209	ENST00000450098	WNK4	Q96J92	1243 aa		41.94	■■■■■ 4.3
HES6-209	ENST00000450098	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	41.94	■■■■■ 4.3
HES6-209	ENST00000450098	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	41.93	■■■■■ 4.3
HES6-209	ENST00000450098	RASGRF1	Q13972	1273 aa		41.93	■■■■■ 4.3
HES6-209	ENST00000450098	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		41.93	■■■■■ 4.3
HES6-209	ENST00000450098	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		41.93	■■■■■ 4.3
HES6-209	ENST00000450098	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	41.93	■■■■■ 4.3
HES6-209	ENST00000450098	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	41.93	■■■■■ 4.3
HES6-209	ENST00000450098	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	41.92	■■■■■ 4.3
HES6-209	ENST00000450098	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	41.91	■■■■■ 4.3
HES6-209	ENST00000450098	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		41.91	■■■■■ 4.3
HES6-209	ENST00000450098	POLA2	Q14181	598 aa		41.9	■■■■■ 4.3
HES6-209	ENST00000450098	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		41.9	■■■■■ 4.3
HES6-209	ENST00000450098	DGKZ	Q13574	1117 aa		41.89	■■■■■ 4.3
HES6-209	ENST00000450098	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	41.88	■■■■■ 4.29
HES6-209	ENST00000450098	INHBE	P58166	350 aa		41.88	■■■■■ 4.29
HES6-209	ENST00000450098	TBC1D8	O95759	1140 aa		41.87	■■■■■ 4.29
HES6-209	ENST00000450098	ATP8B2	P98198	1209 aa		41.87	■■■■■ 4.29
HES6-209	ENST00000450098	SSH3	Q8TE77	659 aa		41.87	■■■■■ 4.29
HES6-209	ENST00000450098	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		41.87	■■■■■ 4.29
HES6-209	ENST00000450098	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	41.87	■■■■■ 4.29
HES6-209	ENST00000450098	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		41.85	■■■■■ 4.29
HES6-209	ENST00000450098	HOOK2	Q96ED9	719 aa		41.85	■■■■■ 4.29
HES6-209	ENST00000450098	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	41.84	■■■■■ 4.29
HES6-209	ENST00000450098	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	41.84	■■■■■ 4.29
HES6-209	ENST00000450098	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		41.84	■■■■■ 4.29
HES6-209	ENST00000450098	ELP3	Q9H9T3	547 aa		41.84	■■■■■ 4.29

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms