RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447950.1

PTPRD-AS1-202, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD-AS1, Length 1,668 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MYH2Q9UKX2 1941 aa18■□□□□ 0.47
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CA12O43570 354 aa17.94■□□□□ 0.46
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZDHHC15Q96MV8 337 aa17.93■□□□□ 0.46
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HHIPL2Q6UWX4 724 aa17.9■□□□□ 0.46
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MAST3O60307 1309 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SALL1Q9NSC2 1324 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ATP8B2P98198 1209 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PI16Q6UXB8 463 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SSH3Q8TE77 659 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZBTB22O15209 634 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NEUROD6Q96NK8 337 aa17.88■□□□□ 0.45
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MAST2Q6P0Q8 1798 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LDHBP07195 334 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TM4SF4P48230 202 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP17.87■□□□□ 0.45
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SLC10A4Q96EP9 437 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IREB2P48200 963 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NFIAQ12857 509 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF384Q8TF68 577 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ABHD8Q96I13 439 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TBC1D8O95759 1140 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TNNI2P48788 182 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MVPQ14764 893 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
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