RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439083.5

TNS1-208, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 5

Gene TNS1, Length 538 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-208ENST00000439083 CCDC85CA6NKD9 419 aa18.03■□□□□ 0.48
TNS1-208ENST00000439083 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
TNS1-208ENST00000439083 IREB2P48200 963 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
TNS1-208ENST00000439083 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
TNS1-208ENST00000439083 ATG9AQ7Z3C6 839 aa18.03■□□□□ 0.48
TNS1-208ENST00000439083 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
TNS1-208ENST00000439083 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
TNS1-208ENST00000439083 AKAP11Q9UKA4 1901 aa18.02■□□□□ 0.48
TNS1-208ENST00000439083 SSC5DA1L4H1 1573 aa18.02■□□□□ 0.48
TNS1-208ENST00000439083 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
TNS1-208ENST00000439083 ALDH1A1P00352 501 aa18.02■□□□□ 0.48
TNS1-208ENST00000439083 SLC5A1P13866 664 aa18.02■□□□□ 0.48
TNS1-208ENST00000439083 TNNI2P48788 182 aa18.02■□□□□ 0.48
TNS1-208ENST00000439083 RGS19P49795 217 aa18.02■□□□□ 0.48
TNS1-208ENST00000439083 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
TNS1-208ENST00000439083 TEKT1Q969V4 418 aa18.02■□□□□ 0.48
TNS1-208ENST00000439083 MAST3O60307 1309 aa18.01■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 ZBTB22O15209 634 aa18.01■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 USP2O75604 605 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 GRIK5Q16478 980 aa18.01■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa18.01■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 WDR66Q8TBY9 1149 aa18.01■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 ZDHHC15Q96MV8 337 aa18.01■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 CEP126Q9P2H0 1117 aa18.01■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 ECM29Q5VYK3 1845 aa18■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 IL15P40933 162 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 FKBP1CQ5VVH2 108 aa18■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 TEPSINQ96N21 525 aa18■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 COPRSQ9NQ92 184 aa18■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 FZD1Q9UP38 647 aa18■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 TBC1D8O95759 1140 aa17.99■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 GNAI3P08754 354 aa17.99■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 HHIPL2Q6UWX4 724 aa17.99■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 WNK4Q96J92 1243 aa17.99■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 CLMNQ96JQ2 1002 aa17.99■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 GPR25O00155 361 aa17.98■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP17.98■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 ATP2B3Q16720 1220 aa17.98■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 FAM83AQ86UY5 434 aa17.98■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 MEIS3Q99687 375 aa17.98■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 TCP10L2B9ZVM9 353 aa17.97■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 SEMA3EO15041 775 aa17.97■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 MTX1Q13505 466 aa17.97■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 IFNL1Q8IU54 200 aa17.97■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 SIL1Q9H173 461 aa17.97■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 TMOD2Q9NZR1 351 aa17.97■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 ARAP2Q8WZ64 1704 aa17.97■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 HOOK2Q96ED9 719 aa17.96■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 TMEM39BQ9GZU3 492 aa17.96■□□□□ 0.47
TNS1-208ENST00000439083 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 MAP3K9P80192 1104 aa17.95■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa17.95■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 SALL1Q9NSC2 1324 aa17.95■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 FKTNO75072 461 aa17.94■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa17.94■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 DENND2AQ9ULE3 1009 aa17.94■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 TRIM27P14373 513 aa17.93■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 GJA5P36382 358 aa17.93■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 CDAN1Q8IWY9 1227 aa17.93■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP17.93■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP17.92■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 SRGAP3O43295 1099 aa17.92■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 OPTNQ96CV9 577 aa17.92■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa17.92■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 AKAP2Q9Y2D5 859 aa17.92■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 CSADQ9Y600 493 aa17.92■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 LDHBP07195 334 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 PHKA1P46020 1223 aa17.91■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 CACNB3P54284 484 aa17.91■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 ELP3Q9H9T3 547 aa17.91■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 BCAR3O75815 825 aa17.9■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 GNAI2P04899 355 aa17.9■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 PRDX5P30044 214 aa17.9■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 VGLL4Q14135 290 aa17.9■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 DCAF15Q66K64 600 aa17.9■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 CCDC102BQ68D86 513 aa17.9■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 FAM151AQ8WW52 585 aa17.9■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 MS4A4AQ96JQ5 239 aa17.9■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 HPS5Q9UPZ3 1129 aa17.9■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa17.9■□□□□ 0.46
TNS1-208ENST00000439083 SPDYE5A6NIY4 337 aa17.89■□□□□ 0.45
TNS1-208ENST00000439083 GTF2A2P52657 109 aa17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.6 ms