RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438290.2

SOX21-AS1-201, SOX21 antisense divergent transcript 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SOX21-AS1, Length 3,287 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX21-AS1-201ENST00000438290 SYKP43405 635 aa16.71■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 TRDNQ13061 729 aa16.71■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 LINC00301Q8NCQ3 95 aa16.71■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 CARD6Q9BX69 1037 aa16.71■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 SLU7O95391 586 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 FANCCQ00597 558 aa16.7■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 METTL24Q5JXM2 366 aa16.7■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 MYSM1Q5VVJ2 828 aa16.7■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa16.7■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 SLC26A6Q9BXS9 759 aa16.7■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 FANCLQ9NW38 375 aa16.7■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 UTYO14607 1347 aa16.7■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 CTDSPL2Q05D32 466 aa16.7■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 ENGASEQ8NFI3 743 aa16.7■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 HINFPQ9BQA5 517 aa16.7■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 CNNM1Q9NRU3 951 aa16.7■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 GPAA1O43292 621 aa16.69■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 TFRCP02786 760 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 USPL1Q5W0Q7 1092 aa16.69■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa16.69■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 GRIN1Q05586 938 aa16.69■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 ERBB3P21860 1342 aa16.69■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 EEF2KMTQ96G04 330 aa16.69■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa16.69■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 FOXO4P98177 505 aa16.68■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 LONRF3Q496Y0 759 aa16.68■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa16.68■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa16.68■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 EYA2O00167 538 aa16.68■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 AFMP43652 599 aa16.68■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 ANO1Q5XXA6 986 aa16.68■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa16.68■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa16.68■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 SMIM22K7EJ46 135 aa16.67■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 PES1O00541 588 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP16.67■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 MIGA1Q8NAN2 632 aa16.67■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 CNNM3Q8NE01 707 aa16.67■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 LZTFL1Q9NQ48 299 aa16.67■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 GNG11P61952 73 aa16.67■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 VPS37DQ86XT2 251 aa16.67■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 KRT222Q8N1A0 295 aa16.67■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 UBXN4Q92575 508 aa16.67■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 NCAPD2Q15021 1401 aa16.67■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 CTAGE5O15320 804 aa16.67■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 TPM4P67936 248 aa16.67■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 ADALQ6DHV7 355 aa16.67■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa16.67■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 CDC27P30260 824 aa16.66■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 A0A0U1RQJ8 604 aa16.66■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 TOP1P11387 765 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 ATRIPQ8WXE1 791 aa16.66■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 ZNF446Q9NWS9 450 aa16.66■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 ANTXR2P58335 489 aa16.65■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 KRT40Q6A162 431 aa16.65■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 CYB5R4Q7L1T6 521 aa16.65■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 NEK11Q8NG66 645 aa16.65■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 BTBD18B2RXH4 712 aa16.65■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 NRDCO43847 1150 aa16.65■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 GUCY1A2P33402 732 aa16.65■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 PLBD2Q8NHP8 589 aa16.65■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa16.65■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 MTF1Q14872 753 aa16.65■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 USP49Q70CQ1 688 aa16.65■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 NCOA7Q8NI08 942 aa16.65■□□□□ 0.26
SOX21-AS1-201ENST00000438290 IL15P40933 162 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SOX21-AS1-201ENST00000438290 CLCN6P51797 869 aa16.64■□□□□ 0.25
SOX21-AS1-201ENST00000438290 PDE4BQ07343 736 aa16.64■□□□□ 0.25
SOX21-AS1-201ENST00000438290 TBC1D10CQ8IV04 446 aa16.64■□□□□ 0.25
SOX21-AS1-201ENST00000438290 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa16.64■□□□□ 0.25
SOX21-AS1-201ENST00000438290 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa16.64■□□□□ 0.25
SOX21-AS1-201ENST00000438290 MINDY4BA8MYZ0 360 aa16.64■□□□□ 0.25
SOX21-AS1-201ENST00000438290 PRKAB2O43741 272 aa16.64■□□□□ 0.25
SOX21-AS1-201ENST00000438290 NR5A1Q13285 461 aa16.64■□□□□ 0.25
SOX21-AS1-201ENST00000438290 TRIM29Q14134 588 aa16.64■□□□□ 0.25
SOX21-AS1-201ENST00000438290 HPS5Q9UPZ3 1129 aa16.64■□□□□ 0.25
SOX21-AS1-201ENST00000438290 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SOX21-AS1-201ENST00000438290 TSGA10IPQ3SY00 556 aa16.64■□□□□ 0.25
SOX21-AS1-201ENST00000438290 NYAP1Q6ZVC0 841 aa16.64■□□□□ 0.25
SOX21-AS1-201ENST00000438290 PRDM11Q9NQV5 511 aa16.64■□□□□ 0.25
SOX21-AS1-201ENST00000438290 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
SOX21-AS1-201ENST00000438290 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
SOX21-AS1-201ENST00000438290 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
SOX21-AS1-201ENST00000438290 TMEM67Q5HYA8 995 aa16.63■□□□□ 0.25
SOX21-AS1-201ENST00000438290 HELLSQ9NRZ9 838 aa16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms