RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436287.1

ACTBP11-201, Transcript of actin, beta pseudogene 11, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP11, Length 1,126 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP11-201ENST00000436287 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP18.89■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF333Q96JL9 665 aa18.89■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 TMEM39BQ9GZU3 492 aa18.89■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa18.89■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa18.88■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 TCP10L2B9ZVM9 353 aa18.88■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 ALDH1L1O75891 902 aa18.88■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 CRKP46108 304 aa18.88■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 TNNI2P48788 182 aa18.88■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 CCL15Q16663 113 aa18.88■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 TMEM106CQ9BVX2 250 aa18.88■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 FBXO33Q7Z6M2 555 aa18.87■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 FAM43AQ8N2R8 423 aa18.87■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa18.87■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 GRIK5Q16478 980 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 NBPF11Q86T75 865 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 KAZALD1Q96I82 304 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 CSADQ9Y600 493 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 OTUD5Q96G74 571 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 SUCLG2Q96I99 432 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 LAMB1P07942 1786 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 ECM29Q5VYK3 1845 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 MROH5Q6ZUA9 1318 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 SPDYE5A6NIY4 337 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC4A10Q6U841 1118 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 MRIQ9BWK5 157 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTBP11-201ENST00000436287 TLR2O60603 784 aa18.83■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 VPS37DQ86XT2 251 aa18.83■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 ERO1BQ86YB8 467 aa18.83■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa18.83■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 CENPFP49454 3210 aa18.83■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 UTYO14607 1347 aa18.82■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 CETPP11597 493 aa18.82■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 CACNB3P54284 484 aa18.82■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa18.82■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 CAVIN4Q5BKX8 364 aa18.82■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 TEKT1Q969V4 418 aa18.82■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 ZDHHC15Q96MV8 337 aa18.82■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 MRS2Q9HD23 443 aa18.82■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 A0A1B0GUL6 1792 aa18.81■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 CACNA1FO60840 1977 aa18.81■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP18.81■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 FKBP1CQ5VVH2 108 aa18.81■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 FAM83AQ86UY5 434 aa18.81■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 BTBD19C9JJ37 291 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 IRF6O14896 467 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 SNAPC2Q13487 334 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 LRRC24Q50LG9 513 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 VGLL2Q8N8G2 317 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 HOOK2Q96ED9 719 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 WRNIP1Q96S55 665 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 TMOD2Q9NZR1 351 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 BRCA2P51587 3418 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 PDE8BO95263 885 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 GNRH1P01148 92 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 BCAMP50895 628 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 KIF22Q14807 665 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 METTL24Q5JXM2 366 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 CEP290O15078 2479 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 PPIL2Q13356 520 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 ANKRD44Q8N8A2 993 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 SH3TC2Q8TF17 1288 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 OTOFQ9HC10 1997 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 MYCP01106 439 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 PRMT2P55345 433 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 PPATQ06203 517 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 DCAF15Q66K64 600 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 HHIPL2Q6UWX4 724 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 C17orf99Q6UX52 265 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTBP11-201ENST00000436287 MAST3O60307 1309 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTBP11-201ENST00000436287 KIF16BQ96L93 1317 aa18.75■□□□□ 0.59
ACTBP11-201ENST00000436287 FGFR2P21802 821 aa18.75■□□□□ 0.59
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF341Q9BYN7 854 aa18.75■□□□□ 0.59
ACTBP11-201ENST00000436287 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
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