RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429755.8

HOXB-AS3-201, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 435 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CRKP46108 304 aa19.32■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PRKG1Q13976 671 aa19.32■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FKBP1CQ5VVH2 108 aa19.32■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 JAG2Q9Y219 1238 aa19.32■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa19.32■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MAST3O60307 1309 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TBC1D8O95759 1140 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LPIN2Q92539 896 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ARHGAP45Q92619 1136 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CDCA7LQ96GN5 454 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FKTNO75072 461 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CIAO1O76071 339 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 HHIPL2Q6UWX4 724 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 WDR66Q8TBY9 1149 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TEKT1Q969V4 418 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 HOOK2Q96ED9 719 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 WNK4Q96J92 1243 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FAM83AQ86UY5 434 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 IFNL1Q8IU54 200 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZDHHC15Q96MV8 337 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TEPSINQ96N21 525 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SSC5DA1L4H1 1573 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SLC5A1P13866 664 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 BCAMP50895 628 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KLHDC4Q8TBB5 520 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TMOD2Q9NZR1 351 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 AOX1Q06278 1338 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SEMA3EO15041 775 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MAP3K9P80192 1104 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ATG9AQ7Z3C6 839 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CLMNQ96JQ2 1002 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CEP126Q9P2H0 1117 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 IL15P40933 162 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 COPRSQ9NQ92 184 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FZD1Q9UP38 647 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 HPS5Q9UPZ3 1129 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ARAP2Q8WZ64 1704 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LAMB1P07942 1786 aa19.24■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TCP10L2B9ZVM9 353 aa19.23■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RARSP54136 660 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 GRIK5Q16478 980 aa19.23■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CSADQ9Y600 493 aa19.23■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP19.22■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 GNAI3P08754 354 aa19.22■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 GTF2A2P52657 109 aa19.22■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP19.22■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TMEM39BQ9GZU3 492 aa19.22■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SALL1Q9NSC2 1324 aa19.22■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ATP2B3Q16720 1220 aa19.21■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DCAF15Q66K64 600 aa19.21■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 OPTNQ96CV9 577 aa19.21■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ERO1AQ96HE7 468 aa19.21■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MS4A4AQ96JQ5 239 aa19.21■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa19.21■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DENND2AQ9ULE3 1009 aa19.21■□□□□ 0.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
HOXB-AS3-201ENST00000429755 GJA5P36382 358 aa19.2■□□□□ 0.66
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MTX1Q13505 466 aa19.2■□□□□ 0.66
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ARHGEF6Q15052 776 aa19.2■□□□□ 0.66
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ELP3Q9H9T3 547 aa19.2■□□□□ 0.66
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SPDYE5A6NIY4 337 aa19.19■□□□□ 0.66
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ERO1BQ86YB8 467 aa19.19■□□□□ 0.66
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FAM151AQ8WW52 585 aa19.19■□□□□ 0.66
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PTPN18Q99952 460 aa19.19■□□□□ 0.66
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
HOXB-AS3-201ENST00000429755 VGLL4Q14135 290 aa19.18■□□□□ 0.66
HOXB-AS3-201ENST00000429755 AKAP2Q9Y2D5 859 aa19.18■□□□□ 0.66
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LDHBP07195 334 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SP3Q02447 781 aa19.17■□□□□ 0.66
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CRHR2Q13324 411 aa19.17■□□□□ 0.66
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SIL1Q9H173 461 aa19.17■□□□□ 0.66
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa19.17■□□□□ 0.66
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CETPP11597 493 aa19.16■□□□□ 0.66
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CDAN1Q8IWY9 1227 aa19.16■□□□□ 0.66
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SLF2Q8IX21 1173 aa19.16■□□□□ 0.66
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MEIS3Q99687 375 aa19.16■□□□□ 0.66
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZNF341Q9BYN7 854 aa19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms