RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429574.1

LIN28AP1-201, Transcript of LIN28A pseudogene 1, humanhuman

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Gene LIN28AP1, Length 405 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AP1-201ENST00000429574 MCOLN1Q9GZU1 580 aa23.48■■□□□ 1.35
LIN28AP1-201ENST00000429574 TMOD2Q9NZR1 351 aa23.48■■□□□ 1.35
LIN28AP1-201ENST00000429574 MAST3O60307 1309 aa23.48■■□□□ 1.35
LIN28AP1-201ENST00000429574 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
LIN28AP1-201ENST00000429574 SPDYE2Q495Y8 402 aa23.47■■□□□ 1.35
LIN28AP1-201ENST00000429574 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
LIN28AP1-201ENST00000429574 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23.46■■□□□ 1.35
LIN28AP1-201ENST00000429574 CIAO1O76071 339 aa23.46■■□□□ 1.35
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LIN28AP1-201ENST00000429574 WDR66Q8TBY9 1149 aa23.46■■□□□ 1.35
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LIN28AP1-201ENST00000429574 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa23.46■■□□□ 1.35
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LIN28AP1-201ENST00000429574 FGFR2P21802 821 aa23.45■■□□□ 1.34
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LIN28AP1-201ENST00000429574 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
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LIN28AP1-201ENST00000429574 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23.43■■□□□ 1.34
LIN28AP1-201ENST00000429574 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa23.43■■□□□ 1.34
LIN28AP1-201ENST00000429574 ALDH1A1P00352 501 aa23.42■■□□□ 1.34
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LIN28AP1-201ENST00000429574 SRGAP3O43295 1099 aa23.41■■□□□ 1.34
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
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LIN28AP1-201ENST00000429574 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa23.41■■□□□ 1.34
LIN28AP1-201ENST00000429574 MRIQ9BWK5 157 aa23.41■■□□□ 1.34
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LIN28AP1-201ENST00000429574 HOOK2Q96ED9 719 aa23.4■■□□□ 1.34
LIN28AP1-201ENST00000429574 WNK4Q96J92 1243 aa23.4■■□□□ 1.34
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZDHHC15Q96MV8 337 aa23.4■■□□□ 1.34
LIN28AP1-201ENST00000429574 COPRSQ9NQ92 184 aa23.4■■□□□ 1.34
LIN28AP1-201ENST00000429574 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
LIN28AP1-201ENST00000429574 BCAR3O75815 825 aa23.39■■□□□ 1.33
LIN28AP1-201ENST00000429574 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
LIN28AP1-201ENST00000429574 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.39■■□□□ 1.33
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LIN28AP1-201ENST00000429574 TMEM39BQ9GZU3 492 aa23.39■■□□□ 1.33
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LIN28AP1-201ENST00000429574 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.39■■□□□ 1.33
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LIN28AP1-201ENST00000429574 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.37■■□□□ 1.33
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LIN28AP1-201ENST00000429574 SSC5DA1L4H1 1573 aa23.36■■□□□ 1.33
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LIN28AP1-201ENST00000429574 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
LIN28AP1-201ENST00000429574 ELP3Q9H9T3 547 aa23.36■■□□□ 1.33
LIN28AP1-201ENST00000429574 GPR25O00155 361 aa23.35■■□□□ 1.33
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LIN28AP1-201ENST00000429574 IFNL1Q8IU54 200 aa23.35■■□□□ 1.33
LIN28AP1-201ENST00000429574 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
LIN28AP1-201ENST00000429574 FKTNO75072 461 aa23.34■■□□□ 1.33
LIN28AP1-201ENST00000429574 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.34■■□□□ 1.33
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LIN28AP1-201ENST00000429574 DCAF15Q66K64 600 aa23.34■■□□□ 1.33
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LIN28AP1-201ENST00000429574 TEPSINQ96N21 525 aa23.34■■□□□ 1.33
LIN28AP1-201ENST00000429574 NEUROD6Q96NK8 337 aa23.34■■□□□ 1.33
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LIN28AP1-201ENST00000429574 PHKA1P46020 1223 aa23.33■■□□□ 1.33
LIN28AP1-201ENST00000429574 TIMM10P62072 90 aa23.33■■□□□ 1.33
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LIN28AP1-201ENST00000429574 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
LIN28AP1-201ENST00000429574 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
LIN28AP1-201ENST00000429574 CCDC102BQ68D86 513 aa23.32■■□□□ 1.32
LIN28AP1-201ENST00000429574 SLF2Q8IX21 1173 aa23.32■■□□□ 1.32
LIN28AP1-201ENST00000429574 A0A1B0GUL7 405 aa23.31■■□□□ 1.32
LIN28AP1-201ENST00000429574 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
LIN28AP1-201ENST00000429574 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
LIN28AP1-201ENST00000429574 TFCP2Q12800 502 aa23.31■■□□□ 1.32
LIN28AP1-201ENST00000429574 MTX1Q13505 466 aa23.31■■□□□ 1.32
LIN28AP1-201ENST00000429574 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
LIN28AP1-201ENST00000429574 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
LIN28AP1-201ENST00000429574 ABCF2Q9UG63 623 aa23.31■■□□□ 1.32
LIN28AP1-201ENST00000429574 PRDX5P30044 214 aa23.3■■□□□ 1.32
LIN28AP1-201ENST00000429574 ADORA1P30542 326 aa23.3■■□□□ 1.32
LIN28AP1-201ENST00000429574 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
LIN28AP1-201ENST00000429574 DIXDC1Q155Q3 683 aa23.3■■□□□ 1.32
LIN28AP1-201ENST00000429574 CFHR5Q9BXR6 569 aa23.3■■□□□ 1.32
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