RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429160.1

UBXN7-205, Transcript of UBX domain protein 7, human

TSL 2

Gene UBXN7, Length 3,158 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN7-205	ENST00000429160	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	HOOK2	Q96ED9	719 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	GORAB	Q5T7V8	394 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	CST9	Q5W186	159 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	TRAF5	O00463	557 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	ADM5	C9JUS6	153 aa		13.52	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	PHKA1	P46020	1223 aa		13.52	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	GSTO1	P78417	241 aa		13.52	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		13.52	□□□□□ -0.24
UBXN7-205	ENST00000429160	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		13.52	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		13.51	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	DOCK2	Q92608	1830 aa		13.51	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		13.51	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		13.51	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	ADORA1	P30542	326 aa		13.51	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	MAP2K2	P36507	400 aa		13.51	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	13.51	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		13.51	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	CCDC102A	Q96A19	550 aa		13.51	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		13.51	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		13.51	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		13.51	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	13.51	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	LDHC	P07864	332 aa		13.5	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	TIMM10	P62072	90 aa		13.5	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM83A	Q86UY5	434 aa		13.5	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160		F8W031	263 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	MAP3K11	Q16584	847 aa		13.5	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	RASGRF1	Q13972	1273 aa		13.49	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	CERS3	Q8IU89	383 aa		13.49	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	SPATA5	Q8NB90	893 aa		13.49	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	GAK	O14976	1311 aa		13.49	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		13.49	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	VEGFB	P49765	207 aa		13.48	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	RGMB	Q6NW40	437 aa		13.48	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		13.48	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	CAPNS2	Q96L46	248 aa		13.48	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		13.48	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		13.48	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	JAG2	Q9Y219	1238 aa		13.48	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	NOG	Q13253	232 aa		13.47	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		13.47	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		13.47	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	CA12	O43570	354 aa		13.47	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	HUNK	P57058	714 aa		13.47	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		13.47	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	HTRA3	P83110	453 aa		13.46	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC10A3	P09131	477 aa		13.46	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		13.46	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	AIDA	Q96BJ3	306 aa		13.46	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	VEZT	Q9HBM0	779 aa		13.46	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		13.46	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		13.46	□□□□□ -0.25
UBXN7-205	ENST00000429160	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		13.46	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		13.45	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	OTOF	Q9HC10	1997 aa		13.45	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	ENTPD3	O75355	529 aa		13.45	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	PLCG2	P16885	1265 aa		13.45	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	13.45	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	AACS	Q86V21	672 aa		13.45	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		13.45	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		13.45	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	MCAM	P43121	646 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	GRIK5	Q16478	980 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	DCAF15	Q66K64	600 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM151A	Q8WW52	585 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	IDI2	Q9BXS1	227 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBXN7-205	ENST00000429160	DCTPP1	Q9H773	170 aa		13.44	□□□□□ -0.26

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