RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428962.2

THBS3-202, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 2

Gene THBS3, Length 1,833 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-202ENST00000428962 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
THBS3-202ENST00000428962 USP25Q9UHP3 1055 aa16.04■□□□□ 0.16
THBS3-202ENST00000428962 KDM4AO75164 1064 aa16.03■□□□□ 0.16
THBS3-202ENST00000428962 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
THBS3-202ENST00000428962 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
THBS3-202ENST00000428962 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
THBS3-202ENST00000428962 AIDAQ96BJ3 306 aa16.03■□□□□ 0.16
THBS3-202ENST00000428962 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa16.03■□□□□ 0.16
THBS3-202ENST00000428962 CPLX1O14810 134 aa16.03■□□□□ 0.16
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THBS3-202ENST00000428962 APPP05067 770 aa16.03■□□□□ 0.16
THBS3-202ENST00000428962 ITPK1Q13572 414 aa16.03■□□□□ 0.16
THBS3-202ENST00000428962 ALX1Q15699 326 aa16.03■□□□□ 0.16
THBS3-202ENST00000428962 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
THBS3-202ENST00000428962 FAM200AQ8TCP9 573 aa16.03■□□□□ 0.16
THBS3-202ENST00000428962 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
THBS3-202ENST00000428962 ADCY5O95622 1261 aa16.02■□□□□ 0.16
THBS3-202ENST00000428962 ANTXR2P58335 489 aa16.02■□□□□ 0.16
THBS3-202ENST00000428962 TYRO3Q06418 890 aa16.02■□□□□ 0.16
THBS3-202ENST00000428962 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
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THBS3-202ENST00000428962 RCOR1Q9UKL0 485 aa16.02■□□□□ 0.16
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THBS3-202ENST00000428962 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 WWC3Q9ULE0 1092 aa16.01■□□□□ 0.15
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THBS3-202ENST00000428962 CDKL5O76039 1030 aa16.01■□□□□ 0.15
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THBS3-202ENST00000428962 RASGRF1Q13972 1273 aa16.01■□□□□ 0.15
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THBS3-202ENST00000428962 C8orf76Q96K31 380 aa16.01■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 TMEM87BQ96K49 555 aa16.01■□□□□ 0.15
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THBS3-202ENST00000428962 TIAM2Q8IVF5 1701 aa16■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 OFD1O75665 1012 aa16■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 GNAT2P19087 354 aa16■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
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THBS3-202ENST00000428962 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa16■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 KRT27Q7Z3Y8 459 aa16■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 CCDC125Q86Z20 511 aa16■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 TBC1D10CQ8IV04 446 aa16■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 SEC31BQ9NQW1 1179 aa16■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
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THBS3-202ENST00000428962 MRVI1Q9Y6F6 885 aa16■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 C4AP0C0L4 1744 aa15.99■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 C4BP0C0L5 1744 aa15.99■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 NR1I2O75469 434 aa15.99■□□□□ 0.15
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THBS3-202ENST00000428962 NBPF3Q9H094 633 aa15.99■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 USP28Q96RU2 1077 aa15.98■□□□□ 0.15
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THBS3-202ENST00000428962 CNNM2Q9H8M5 875 aa15.98■□□□□ 0.15
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THBS3-202ENST00000428962 TPM3P06753 285 aa15.98■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 GUCY1B3Q02153 619 aa15.98■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 CKAP2LQ8IYA6 745 aa15.98■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 NACAP1Q9BZK3 213 aa15.98■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 RTEL1Q9NZ71 1219 aa15.98■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa15.97■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 CHRNDQ07001 517 aa15.97■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 KIAA2012Q0VF49 1180 aa15.97■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa15.97■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
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THBS3-202ENST00000428962 CHD4Q14839 1912 aa15.96■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa15.96■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 ME1P48163 572 aa15.96■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 ANO6Q4KMQ2 910 aa15.96■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 CYB5R4Q7L1T6 521 aa15.96■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 IFNL3Q8IZI9 196 aa15.96■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 KRT23Q9C075 422 aa15.96■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa15.96■□□□□ 0.15
THBS3-202ENST00000428962 KINO60870 393 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
THBS3-202ENST00000428962 YEATS4O95619 227 aa15.96■□□□□ 0.14
THBS3-202ENST00000428962 PLCB2Q00722 1185 aa15.96■□□□□ 0.14
THBS3-202ENST00000428962 FAM160A1Q05DH4 1040 aa15.96■□□□□ 0.14
THBS3-202ENST00000428962 SGMS1Q86VZ5 419 aa15.96■□□□□ 0.14
THBS3-202ENST00000428962 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa15.96■□□□□ 0.14
THBS3-202ENST00000428962 KCNG4Q8TDN1 519 aa15.96■□□□□ 0.14
THBS3-202ENST00000428962 NEDD4P46934 1319 aa15.95■□□□□ 0.14
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