RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428678.1

UPK3BP1-201, Transcript of uroplakin 3B pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene UPK3BP1, Length 509 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BP1-201ENST00000428678 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.16■■□□□ 1.3
UPK3BP1-201ENST00000428678 ARMC5Q96C12 935 aa23.16■■□□□ 1.3
UPK3BP1-201ENST00000428678 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
UPK3BP1-201ENST00000428678 CEP290O15078 2479 aa23.16■■□□□ 1.3
UPK3BP1-201ENST00000428678 CRKP46108 304 aa23.15■■□□□ 1.3
UPK3BP1-201ENST00000428678 MS4A4AQ96JQ5 239 aa23.15■■□□□ 1.3
UPK3BP1-201ENST00000428678 TEPSINQ96N21 525 aa23.15■■□□□ 1.3
UPK3BP1-201ENST00000428678 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
UPK3BP1-201ENST00000428678 TMEM39BQ9GZU3 492 aa23.15■■□□□ 1.3
UPK3BP1-201ENST00000428678 MRS2Q9HD23 443 aa23.15■■□□□ 1.3
UPK3BP1-201ENST00000428678 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa23.14■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 ALDH1L1O75891 902 aa23.14■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 TNNI2P48788 182 aa23.14■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 CAP1Q01518 475 aa23.14■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 VGLL4Q14135 290 aa23.14■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 CCL15Q16663 113 aa23.14■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 BRI3BPQ8WY22 251 aa23.14■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 CSADQ9Y600 493 aa23.14■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 EN2P19622 333 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 MAP3K9P80192 1104 aa23.13■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 VPS37DQ86XT2 251 aa23.13■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 SUCLG2Q96I99 432 aa23.13■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23.13■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 GTF2A2P52657 109 aa23.12■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 ARHGEF6Q15052 776 aa23.12■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 OTUD5Q96G74 571 aa23.12■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa23.12■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 GRIK5Q16478 980 aa23.11■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP23.11■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 TMEM106CQ9BVX2 250 aa23.11■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 MROH5Q6ZUA9 1318 aa23.1■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.1■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 CACNB3P54284 484 aa23.09■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa23.09■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.09■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 KAZALD1Q96I82 304 aa23.09■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF333Q96JL9 665 aa23.09■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa23.09■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 FBXO33Q7Z6M2 555 aa23.08■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 NBPF11Q86T75 865 aa23.08■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa23.08■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 TEKT1Q969V4 418 aa23.08■■□□□ 1.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 CAVIN4Q5BKX8 364 aa23.07■■□□□ 1.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 METTL24Q5JXM2 366 aa23.07■■□□□ 1.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 TMOD2Q9NZR1 351 aa23.07■■□□□ 1.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 SPDYE5A6NIY4 337 aa23.06■■□□□ 1.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa23.06■■□□□ 1.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 LRRC24Q50LG9 513 aa23.06■■□□□ 1.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 WRNIP1Q96S55 665 aa23.06■■□□□ 1.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa23.06■■□□□ 1.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 MYCP01106 439 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 CETPP11597 493 aa23.05■■□□□ 1.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 ERO1BQ86YB8 467 aa23.04■■□□□ 1.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 BCAMP50895 628 aa23.03■■□□□ 1.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 SNAPC2Q13487 334 aa23.03■■□□□ 1.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 KIF22Q14807 665 aa23.03■■□□□ 1.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 HOOK2Q96ED9 719 aa23.03■■□□□ 1.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZDHHC15Q96MV8 337 aa23.03■■□□□ 1.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 UTYO14607 1347 aa23.03■■□□□ 1.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa23.03■■□□□ 1.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa23.03■■□□□ 1.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 BTBD19C9JJ37 291 aa23.02■■□□□ 1.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 TLR2O60603 784 aa23.02■■□□□ 1.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 PDE8BO95263 885 aa23.02■■□□□ 1.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 FAM83AQ86UY5 434 aa23.02■■□□□ 1.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.02■■□□□ 1.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa23.02■■□□□ 1.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 MAST3O60307 1309 aa23.02■■□□□ 1.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 IRF6O14896 467 aa23.01■■□□□ 1.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 ANP32CO43423 234 aa23.01■■□□□ 1.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 DCAF15Q66K64 600 aa23.01■■□□□ 1.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 VGLL2Q8N8G2 317 aa23.01■■□□□ 1.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 SH3TC2Q8TF17 1288 aa23.01■■□□□ 1.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 PPIL2Q13356 520 aa23■■□□□ 1.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 FKBP1CQ5VVH2 108 aa23■■□□□ 1.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 KLHDC4Q8TBB5 520 aa23■■□□□ 1.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 MRIQ9BWK5 157 aa23■■□□□ 1.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.99■■□□□ 1.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.98■■□□□ 1.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.98■■□□□ 1.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms