RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428426.2

AC002511.1-201, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene AC002511.1, Length 1,000 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC002511.1-201ENST00000428426 FAM205AQ6ZU69 1335 aa13.58□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 GRM8O00222 908 aa13.57□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 CRKP46108 304 aa13.57□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 CACNB3P54284 484 aa13.57□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 SLC4A10Q6U841 1118 aa13.57□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 KAZALD1Q96I82 304 aa13.57□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 SUCLG2Q96I99 432 aa13.57□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 CENPFP49454 3210 aa13.56□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 UNCXA6NJT0 531 aa13.56□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 VGLL4Q14135 290 aa13.56□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 UBE4AQ14139 1066 aa13.56□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 FAM43AQ8N2R8 423 aa13.56□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 ARMC5Q96C12 935 aa13.56□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa13.56□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa13.55□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 MAP3K9P80192 1104 aa13.55□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 CCL15Q16663 113 aa13.55□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 LRRC24Q50LG9 513 aa13.55□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 WDR63Q8IWG1 891 aa13.55□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP13.55□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 OTUD5Q96G74 571 aa13.55□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa13.55□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 SERPINA10Q9UK55 444 aa13.55□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa13.55□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 HTTP42858 3142 aa13.55□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 TNFAIP1Q13829 316 aa13.54□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 GCC1Q96CN9 775 aa13.54□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa13.54□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 MRS2Q9HD23 443 aa13.54□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 ARAP2Q8WZ64 1704 aa13.53□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 FBXO33Q7Z6M2 555 aa13.53□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 KLHDC4Q8TBB5 520 aa13.53□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 ZNF333Q96JL9 665 aa13.53□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 TMEM106CQ9BVX2 250 aa13.53□□□□□ -0.24
AC002511.1-201ENST00000428426 BRCA2P51587 3418 aa13.52□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 ALDH1L1O75891 902 aa13.52□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 BCAMP50895 628 aa13.52□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 GTF2A2P52657 109 aa13.52□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa13.52□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 SH3TC2Q8TF17 1288 aa13.52□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa13.52□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 CSADQ9Y600 493 aa13.52□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 AK9Q5TCS8 1911 aa13.52□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 BTBD19C9JJ37 291 aa13.51□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 TNNI2P48788 182 aa13.51□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa13.51□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 MIGA2Q7L4E1 593 aa13.51□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 VPS37DQ86XT2 251 aa13.51□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa13.51□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 SPDYE5A6NIY4 337 aa13.5□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 IRF6O14896 467 aa13.5□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 CTGFP29279 349 aa13.5□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 METTL24Q5JXM2 366 aa13.5□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 WRNIP1Q96S55 665 aa13.5□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 MROH5Q6ZUA9 1318 aa13.49□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 TLR2O60603 784 aa13.49□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 INPP5BP32019 993 aa13.49□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP13.49□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 NBPF11Q86T75 865 aa13.49□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 ANKRD44Q8N8A2 993 aa13.49□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 VGLL2Q8N8G2 317 aa13.49□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 TEKT1Q969V4 418 aa13.49□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 PDE8BO95263 885 aa13.48□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 CETPP11597 493 aa13.48□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 CAVIN4Q5BKX8 364 aa13.48□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 ERO1BQ86YB8 467 aa13.48□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 ZDHHC15Q96MV8 337 aa13.48□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 CPA4Q9UI42 421 aa13.48□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 UTYO14607 1347 aa13.47□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 TCP10Q12799 353 aa13.47□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 ARHGEF6Q15052 776 aa13.47□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 MTFR1Q15390 333 aa13.47□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 FAM9BQ8IZU0 186 aa13.47□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 H0YGN5 161 aa13.46□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 SNAPC2Q13487 334 aa13.46□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 C17orf99Q6UX52 265 aa13.46□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa13.46□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 TMOD2Q9NZR1 351 aa13.46□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 MYH13Q9UKX3 1938 aa13.46□□□□□ -0.25
AC002511.1-201ENST00000428426 FGFR2P21802 821 aa13.45□□□□□ -0.26
AC002511.1-201ENST00000428426 PPIL2Q13356 520 aa13.45□□□□□ -0.26
AC002511.1-201ENST00000428426 KIF22Q14807 665 aa13.45□□□□□ -0.26
AC002511.1-201ENST00000428426 FAM83AQ86UY5 434 aa13.45□□□□□ -0.26
AC002511.1-201ENST00000428426 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms