RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
HOXA4-202ENST00000428284 MECOMQ03112 1051 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXA4-202ENST00000428284 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXA4-202ENST00000428284 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXA4-202ENST00000428284 GPC2Q8N158 579 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXA4-202ENST00000428284 MAGEB6Q8N7X4 407 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
HOXA4-202ENST00000428284 AGBL3Q8NEM8 1001 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXA4-202ENST00000428284 RFX7Q2KHR2 1363 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXA4-202ENST00000428284 MAST3O60307 1309 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXA4-202ENST00000428284 PDE6AP16499 860 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXA4-202ENST00000428284 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
HOXA4-202ENST00000428284 RPS12P25398 132 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
HOXA4-202ENST00000428284 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
HOXA4-202ENST00000428284 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
HOXA4-202ENST00000428284 DPY19L2Q6NUT2 758 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXA4-202ENST00000428284 GMLQ99445 158 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXA4-202ENST00000428284 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 IGSF3O75054 1194 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 DDNO94850 711 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 CHGBP05060 677 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 ADD2P35612 726 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 SCNN1DP51172 638 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 DIXDC1Q155Q3 683 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF532Q9HCE3 1301 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 GSTO1P78417 241 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF384Q8TF68 577 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 HIP1O00291 1037 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 USP17L8P0C7I0 530 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 CYP7A1P22680 504 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 SLFNL1Q499Z3 407 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 TICAM2Q86XR7 235 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 SLF2Q8IX21 1173 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 OGFOD1Q8N543 542 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 HDAC9Q9UKV0 1011 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 CDC45O75419 566 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 UBE3CQ15386 1083 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 DPF2Q92785 391 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 TEKT1Q969V4 418 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 ECM29Q5VYK3 1845 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 LDHCP07864 332 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 CHMLP26374 656 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 CASC1Q6TDU7 716 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 ADGRA1Q86SQ6 560 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 APPBP2Q92624 585 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 GLTPD2A6NH11 291 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 CRKP46108 304 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP24.84■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 MICALL2Q8IY33 904 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 FAM227BQ96M60 508 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 SERPINA10Q9UK55 444 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 SCN4AP35499 1836 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 SHTN1A0MZ66 631 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXA4-202ENST00000428284 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa24.83■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 A0A0D9SFI3 127 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 HHIPL2Q6UWX4 724 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 MIGA1Q8NAN2 632 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 GPRC5DQ9NZD1 345 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 CFAP100Q494V2 611 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 MRIQ9BWK5 157 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 GAKO14976 1311 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 WDR90Q96KV7 1748 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 H7C1D1 291 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 MMP14P50281 582 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 RUFY2Q8WXA3 655 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 OSBP2Q969R2 916 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 HELLSQ9NRZ9 838 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP24.8■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 BTDP43251 543 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 ZDHHC15Q96MV8 337 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 MYOZ2Q9NPC6 264 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 M0R2C6 588 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 DLGAP5Q15398 846 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 AIDAQ96BJ3 306 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 BAG3O95817 575 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXA4-202ENST00000428284 FOCADQ5VW36 1801 aa24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms