RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 PDCP20941 246 aa27.4■■□□□ 1.98
FAAP20-209ENST00000428120 NKX2-3Q8TAU0 364 aa27.4■■□□□ 1.98
FAAP20-209ENST00000428120 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
FAAP20-209ENST00000428120 PRKAB2O43741 272 aa27.39■■□□□ 1.98
FAAP20-209ENST00000428120 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP27.39■■□□□ 1.98
FAAP20-209ENST00000428120 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
FAAP20-209ENST00000428120 LCORLQ8N3X6 602 aa27.39■■□□□ 1.98
FAAP20-209ENST00000428120 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa27.39■■□□□ 1.98
FAAP20-209ENST00000428120 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa27.39■■□□□ 1.98
FAAP20-209ENST00000428120 FIBPO43427 364 aa27.39■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 MCM5P33992 734 aa27.39■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 ANTXR2P58335 489 aa27.39■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 UBR3Q6ZT12 1888 aa27.39■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 ADRA2BP18089 450 aa27.38■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa27.38■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 ADGRA1Q86SQ6 560 aa27.38■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 RAI14Q9P0K7 980 aa27.38■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 GYS1P13807 737 aa27.38■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 IFNL3Q8IZI9 196 aa27.38■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 SLC27A3Q5K4L6 730 aa27.37■■□□□ 1.97
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FAAP20-209ENST00000428120 CTDNEP1O95476 244 aa27.36■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 PRR5LQ6MZQ0 368 aa27.36■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 FAM173BQ6P4H8 233 aa27.36■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 INCENPQ9NQS7 918 aa27.36■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM63CQ9P1W3 806 aa27.36■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 CYP7A1P22680 504 aa27.36■■□□□ 1.97
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FAAP20-209ENST00000428120 GSG1L2A8MUP6 293 aa27.35■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 MBD3O95983 291 aa27.35■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 TRDNQ13061 729 aa27.35■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 PANK2Q9BZ23 570 aa27.35■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa27.35■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 ANKRD2Q9GZV1 360 aa27.35■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 GRPEL1Q9HAV7 217 aa27.35■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa27.35■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 FOSBP53539 338 aa27.34■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 FBXO33Q7Z6M2 555 aa27.34■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 PROM2Q8N271 834 aa27.34■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 PTPDC1A2A3K4 754 aa27.34■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 TXNRD3Q86VQ6 643 aa27.34■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 FAM184AQ8NB25 1140 aa27.34■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa27.34■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 CTDSPL2Q05D32 466 aa27.33■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
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FAAP20-209ENST00000428120 TXNRD1Q16881 649 aa27.33■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 CYB5R4Q7L1T6 521 aa27.33■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 FBXL16Q8N461 479 aa27.33■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM87AQ8NBN3 555 aa27.33■■□□□ 1.97
FAAP20-209ENST00000428120 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa27.32■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 B4E1Z4 1266 aa27.32■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
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FAAP20-209ENST00000428120 ALX1Q15699 326 aa27.32■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 JAG2Q9Y219 1238 aa27.32■■□□□ 1.96
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FAAP20-209ENST00000428120 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa27.32■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 STK11IPQ8N1F8 1099 aa27.31■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa27.31■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 GOLGA8BA8MQT2 603 aa27.3■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 SERPINB2P05120 415 aa27.3■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 GRAPQ13588 217 aa27.3■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 H3BQV1 296 aa27.3■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 EVCP57679 992 aa27.3■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 IFFO2Q5TF58 517 aa27.3■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF384Q8TF68 577 aa27.3■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 SDR42E1Q8WUS8 393 aa27.3■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 TACC3Q9Y6A5 838 aa27.29■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF445P59923 1031 aa27.29■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 NACAP1Q9BZK3 213 aa27.29■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 ZMYM6O95789 1325 aa27.29■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa27.28■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 SYCE3A1L190 88 aa27.28■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 GNAT2P19087 354 aa27.28■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 HPS5Q9UPZ3 1129 aa27.28■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 CACNA1SQ13698 1873 aa27.27■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 DDR1Q08345 913 aa27.27■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 SENP2Q9HC62 589 aa27.27■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 SALL1Q9NSC2 1324 aa27.27■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 ST5P78524 1137 aa27.27■■□□□ 1.96
FAAP20-209ENST00000428120 WDR19Q8NEZ3 1342 aa27.26■■□□□ 1.95
FAAP20-209ENST00000428120 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
FAAP20-209ENST00000428120 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
FAAP20-209ENST00000428120 MYH13Q9UKX3 1938 aa27.26■■□□□ 1.95
FAAP20-209ENST00000428120 SEMA3EO15041 775 aa27.25■■□□□ 1.95
FAAP20-209ENST00000428120 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
FAAP20-209ENST00000428120 KDM4AO75164 1064 aa27.25■■□□□ 1.95
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