RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa26.27■■□□□ 1.8
LIMS1-208ENST00000428064 ALDH1A1P00352 501 aa26.26■■□□□ 1.79
LIMS1-208ENST00000428064 IREB2P48200 963 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
LIMS1-208ENST00000428064 MRIQ9BWK5 157 aa26.26■■□□□ 1.79
LIMS1-208ENST00000428064 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
LIMS1-208ENST00000428064 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
LIMS1-208ENST00000428064 MYH13Q9UKX3 1938 aa26.26■■□□□ 1.79
LIMS1-208ENST00000428064 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
LIMS1-208ENST00000428064 TBC1D8O95759 1140 aa26.25■■□□□ 1.79
LIMS1-208ENST00000428064 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
LIMS1-208ENST00000428064 LPIN2Q92539 896 aa26.25■■□□□ 1.79
LIMS1-208ENST00000428064 WNK4Q96J92 1243 aa26.25■■□□□ 1.79
LIMS1-208ENST00000428064 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
LIMS1-208ENST00000428064 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
LIMS1-208ENST00000428064 MAST3O60307 1309 aa26.24■■□□□ 1.79
LIMS1-208ENST00000428064 USP2O75604 605 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
LIMS1-208ENST00000428064 BCAMP50895 628 aa26.24■■□□□ 1.79
LIMS1-208ENST00000428064 GRIK5Q16478 980 aa26.24■■□□□ 1.79
LIMS1-208ENST00000428064 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa26.24■■□□□ 1.79
LIMS1-208ENST00000428064 CLMNQ96JQ2 1002 aa26.24■■□□□ 1.79
LIMS1-208ENST00000428064 TEPSINQ96N21 525 aa26.24■■□□□ 1.79
LIMS1-208ENST00000428064 HDAC5Q9UQL6 1122 aa26.24■■□□□ 1.79
LIMS1-208ENST00000428064 GPR25O00155 361 aa26.23■■□□□ 1.79
LIMS1-208ENST00000428064 CIAO1O76071 339 aa26.23■■□□□ 1.79
LIMS1-208ENST00000428064 TNNI2P48788 182 aa26.23■■□□□ 1.79
LIMS1-208ENST00000428064 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
LIMS1-208ENST00000428064 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
LIMS1-208ENST00000428064 ATG9AQ7Z3C6 839 aa26.23■■□□□ 1.79
LIMS1-208ENST00000428064 TEKT1Q969V4 418 aa26.23■■□□□ 1.79
LIMS1-208ENST00000428064 SLC5A1P13866 664 aa26.22■■□□□ 1.79
LIMS1-208ENST00000428064 ZDHHC15Q96MV8 337 aa26.22■■□□□ 1.79
LIMS1-208ENST00000428064 ARHGAP45Q92619 1136 aa26.21■■□□□ 1.79
LIMS1-208ENST00000428064 RARSP54136 660 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
LIMS1-208ENST00000428064 IFNL1Q8IU54 200 aa26.2■■□□□ 1.78
LIMS1-208ENST00000428064 ZBTB22O15209 634 aa26.19■■□□□ 1.78
LIMS1-208ENST00000428064 FKBP1CQ5VVH2 108 aa26.19■■□□□ 1.78
LIMS1-208ENST00000428064 TCP10L2B9ZVM9 353 aa26.18■■□□□ 1.78
LIMS1-208ENST00000428064 HHIPL2Q6UWX4 724 aa26.18■■□□□ 1.78
LIMS1-208ENST00000428064 WDR66Q8TBY9 1149 aa26.18■■□□□ 1.78
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM39BQ9GZU3 492 aa26.18■■□□□ 1.78
LIMS1-208ENST00000428064 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
LIMS1-208ENST00000428064 FKTNO75072 461 aa26.17■■□□□ 1.78
LIMS1-208ENST00000428064 FAM83AQ86UY5 434 aa26.17■■□□□ 1.78
LIMS1-208ENST00000428064 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
LIMS1-208ENST00000428064 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
LIMS1-208ENST00000428064 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP26.16■■□□□ 1.78
LIMS1-208ENST00000428064 GJA5P36382 358 aa26.16■■□□□ 1.78
LIMS1-208ENST00000428064 IL15P40933 162 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
LIMS1-208ENST00000428064 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
LIMS1-208ENST00000428064 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
LIMS1-208ENST00000428064 CDAN1Q8IWY9 1227 aa26.16■■□□□ 1.78
LIMS1-208ENST00000428064 COPRSQ9NQ92 184 aa26.16■■□□□ 1.78
LIMS1-208ENST00000428064 TMOD2Q9NZR1 351 aa26.16■■□□□ 1.78
LIMS1-208ENST00000428064 ATP2B3Q16720 1220 aa26.15■■□□□ 1.78
LIMS1-208ENST00000428064 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP26.15■■□□□ 1.78
LIMS1-208ENST00000428064 SIL1Q9H173 461 aa26.15■■□□□ 1.78
LIMS1-208ENST00000428064 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa26.15■■□□□ 1.78
LIMS1-208ENST00000428064 CEP126Q9P2H0 1117 aa26.15■■□□□ 1.78
LIMS1-208ENST00000428064 HPS5Q9UPZ3 1129 aa26.15■■□□□ 1.78
LIMS1-208ENST00000428064 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa26.14■■□□□ 1.78
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
LIMS1-208ENST00000428064 OPTNQ96CV9 577 aa26.14■■□□□ 1.78
LIMS1-208ENST00000428064 MEIS3Q99687 375 aa26.14■■□□□ 1.78
LIMS1-208ENST00000428064 SEMA3EO15041 775 aa26.13■■□□□ 1.77
LIMS1-208ENST00000428064 HOOK2Q96ED9 719 aa26.13■■□□□ 1.77
LIMS1-208ENST00000428064 ELP3Q9H9T3 547 aa26.13■■□□□ 1.77
LIMS1-208ENST00000428064 SALL1Q9NSC2 1324 aa26.13■■□□□ 1.77
LIMS1-208ENST00000428064 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
LIMS1-208ENST00000428064 GNAI3P08754 354 aa26.12■■□□□ 1.77
LIMS1-208ENST00000428064 MAP3K9P80192 1104 aa26.12■■□□□ 1.77
LIMS1-208ENST00000428064 VGLL4Q14135 290 aa26.12■■□□□ 1.77
LIMS1-208ENST00000428064 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
LIMS1-208ENST00000428064 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
LIMS1-208ENST00000428064 CACNB3P54284 484 aa26.11■■□□□ 1.77
LIMS1-208ENST00000428064 MTX1Q13505 466 aa26.11■■□□□ 1.77
LIMS1-208ENST00000428064 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
LIMS1-208ENST00000428064 CSADQ9Y600 493 aa26.11■■□□□ 1.77
LIMS1-208ENST00000428064 MS4A4AQ96JQ5 239 aa26.1■■□□□ 1.77
LIMS1-208ENST00000428064 PTPN18Q99952 460 aa26.1■■□□□ 1.77
LIMS1-208ENST00000428064 DENND2AQ9ULE3 1009 aa26.1■■□□□ 1.77
LIMS1-208ENST00000428064 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
LIMS1-208ENST00000428064 HTTP42858 3142 aa26.09■■□□□ 1.77
LIMS1-208ENST00000428064 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
LIMS1-208ENST00000428064 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa26.08■■□□□ 1.77
LIMS1-208ENST00000428064 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
LIMS1-208ENST00000428064 SPDYE5A6NIY4 337 aa26.07■■□□□ 1.76
LIMS1-208ENST00000428064 PRDX5P30044 214 aa26.07■■□□□ 1.76
LIMS1-208ENST00000428064 GTF2A2P52657 109 aa26.07■■□□□ 1.76
LIMS1-208ENST00000428064 SOX10P56693 466 aa26.07■■□□□ 1.76
LIMS1-208ENST00000428064 CRHR2Q13324 411 aa26.07■■□□□ 1.76
LIMS1-208ENST00000428064 LDHBP07195 334 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM27P14373 513 aa26.06■■□□□ 1.76
LIMS1-208ENST00000428064 PHKA1P46020 1223 aa26.06■■□□□ 1.76
LIMS1-208ENST00000428064 DCAF15Q66K64 600 aa26.06■■□□□ 1.76
LIMS1-208ENST00000428064 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
LIMS1-208ENST00000428064 FAM151AQ8WW52 585 aa26.06■■□□□ 1.76
LIMS1-208ENST00000428064 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa26.06■■□□□ 1.76
LIMS1-208ENST00000428064 SRGAP3O43295 1099 aa26.05■■□□□ 1.76
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