RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 RGS19P49795 217 aa26.05■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 RARSP54136 660 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa26.05■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 LPIN2Q92539 896 aa26.04■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 MRIQ9BWK5 157 aa26.04■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 CIAO1O76071 339 aa26.03■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 ARHGAP45Q92619 1136 aa26.03■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 SLC10A4Q96EP9 437 aa26.03■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 CLMNQ96JQ2 1002 aa26.03■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 TEPSINQ96N21 525 aa26.03■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 HDAC5Q9UQL6 1122 aa26.03■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 USP2O75604 605 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 TBC1D8O95759 1140 aa26.02■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 SLC5A1P13866 664 aa26.02■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 IREB2P48200 963 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 WNK4Q96J92 1243 aa26.02■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 OTOFQ9HC10 1997 aa26.02■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 MAST3O60307 1309 aa26.01■■□□□ 1.75
UBXN4-204ENST00000426921 INHBEP58166 350 aa26.01■■□□□ 1.75
UBXN4-204ENST00000426921 TEKT1Q969V4 418 aa26.01■■□□□ 1.75
UBXN4-204ENST00000426921 ZDHHC15Q96MV8 337 aa26.01■■□□□ 1.75
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UBXN4-204ENST00000426921 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa26■■□□□ 1.75
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
UBXN4-204ENST00000426921 MYH13Q9UKX3 1938 aa25.99■■□□□ 1.75
UBXN4-204ENST00000426921 GPR25O00155 361 aa25.99■■□□□ 1.75
UBXN4-204ENST00000426921 ALDH1A1P00352 501 aa25.99■■□□□ 1.75
UBXN4-204ENST00000426921 TNNI2P48788 182 aa25.99■■□□□ 1.75
UBXN4-204ENST00000426921 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
UBXN4-204ENST00000426921 CDAN1Q8IWY9 1227 aa25.99■■□□□ 1.75
UBXN4-204ENST00000426921 MEIS3Q99687 375 aa25.99■■□□□ 1.75
UBXN4-204ENST00000426921 TCP10L2B9ZVM9 353 aa25.98■■□□□ 1.75
UBXN4-204ENST00000426921 ZBTB22O15209 634 aa25.98■■□□□ 1.75
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM39BQ9GZU3 492 aa25.98■■□□□ 1.75
UBXN4-204ENST00000426921 IL15P40933 162 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
UBXN4-204ENST00000426921 ATP2B3Q16720 1220 aa25.97■■□□□ 1.75
UBXN4-204ENST00000426921 FKBP1CQ5VVH2 108 aa25.97■■□□□ 1.75
UBXN4-204ENST00000426921 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
UBXN4-204ENST00000426921 IFNL1Q8IU54 200 aa25.97■■□□□ 1.75
UBXN4-204ENST00000426921 WDR66Q8TBY9 1149 aa25.97■■□□□ 1.75
UBXN4-204ENST00000426921 SIL1Q9H173 461 aa25.97■■□□□ 1.75
UBXN4-204ENST00000426921 COPRSQ9NQ92 184 aa25.97■■□□□ 1.75
UBXN4-204ENST00000426921 GJA5P36382 358 aa25.96■■□□□ 1.75
UBXN4-204ENST00000426921 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
UBXN4-204ENST00000426921 HHIPL2Q6UWX4 724 aa25.96■■□□□ 1.75
UBXN4-204ENST00000426921 CEP126Q9P2H0 1117 aa25.96■■□□□ 1.75
UBXN4-204ENST00000426921 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
UBXN4-204ENST00000426921 FAM83AQ86UY5 434 aa25.95■■□□□ 1.74
UBXN4-204ENST00000426921 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa25.95■■□□□ 1.74
UBXN4-204ENST00000426921 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP25.94■■□□□ 1.74
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UBXN4-204ENST00000426921 MTX1Q13505 466 aa25.94■■□□□ 1.74
UBXN4-204ENST00000426921 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
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UBXN4-204ENST00000426921 GNAI3P08754 354 aa25.93■■□□□ 1.74
UBXN4-204ENST00000426921 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
UBXN4-204ENST00000426921 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP25.93■■□□□ 1.74
UBXN4-204ENST00000426921 TMOD2Q9NZR1 351 aa25.93■■□□□ 1.74
UBXN4-204ENST00000426921 SALL1Q9NSC2 1324 aa25.92■■□□□ 1.74
UBXN4-204ENST00000426921 SEMA3EO15041 775 aa25.92■■□□□ 1.74
UBXN4-204ENST00000426921 FKTNO75072 461 aa25.92■■□□□ 1.74
UBXN4-204ENST00000426921 CACNB3P54284 484 aa25.92■■□□□ 1.74
UBXN4-204ENST00000426921 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
UBXN4-204ENST00000426921 TRIM27P14373 513 aa25.91■■□□□ 1.74
UBXN4-204ENST00000426921 OPTNQ96CV9 577 aa25.91■■□□□ 1.74
UBXN4-204ENST00000426921 ELP3Q9H9T3 547 aa25.91■■□□□ 1.74
UBXN4-204ENST00000426921 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
UBXN4-204ENST00000426921 MAP3K9P80192 1104 aa25.9■■□□□ 1.74
UBXN4-204ENST00000426921 VGLL4Q14135 290 aa25.9■■□□□ 1.74
UBXN4-204ENST00000426921 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
UBXN4-204ENST00000426921 HPS5Q9UPZ3 1129 aa25.9■■□□□ 1.74
UBXN4-204ENST00000426921 PRDX5P30044 214 aa25.89■■□□□ 1.74
UBXN4-204ENST00000426921 PHKA1P46020 1223 aa25.89■■□□□ 1.74
UBXN4-204ENST00000426921 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.89■■□□□ 1.74
UBXN4-204ENST00000426921 DENND2AQ9ULE3 1009 aa25.89■■□□□ 1.74
UBXN4-204ENST00000426921 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa25.89■■□□□ 1.74
UBXN4-204ENST00000426921 SRGAP3O43295 1099 aa25.88■■□□□ 1.73
UBXN4-204ENST00000426921 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.88■■□□□ 1.73
UBXN4-204ENST00000426921 HOOK2Q96ED9 719 aa25.88■■□□□ 1.73
UBXN4-204ENST00000426921 MS4A4AQ96JQ5 239 aa25.88■■□□□ 1.73
UBXN4-204ENST00000426921 PTPN18Q99952 460 aa25.88■■□□□ 1.73
UBXN4-204ENST00000426921 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
UBXN4-204ENST00000426921 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
UBXN4-204ENST00000426921 CSADQ9Y600 493 aa25.87■■□□□ 1.73
UBXN4-204ENST00000426921 BCAR3O75815 825 aa25.86■■□□□ 1.73
UBXN4-204ENST00000426921 ADORA1P30542 326 aa25.86■■□□□ 1.73
UBXN4-204ENST00000426921 DIXDC1Q155Q3 683 aa25.86■■□□□ 1.73
UBXN4-204ENST00000426921 CCDC102BQ68D86 513 aa25.86■■□□□ 1.73
UBXN4-204ENST00000426921 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa25.86■■□□□ 1.73
UBXN4-204ENST00000426921 SPDYE5A6NIY4 337 aa25.85■■□□□ 1.73
UBXN4-204ENST00000426921 LDHBP07195 334 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
UBXN4-204ENST00000426921 TNNQ9UQP3 1299 aa25.85■■□□□ 1.73
UBXN4-204ENST00000426921 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa25.85■■□□□ 1.73
UBXN4-204ENST00000426921 HTTP42858 3142 aa25.84■■□□□ 1.73
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