RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.16■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 TEKT1Q969V4 418 aa22.16■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.16■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 LDHBP07195 334 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.15■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 PRDX5P30044 214 aa22.15■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.15■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.15■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.15■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.15■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 RAB11FIP3O75154 756 aa22.14■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.14■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 SPATA5Q8NB90 893 aa22.14■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 MRIQ9BWK5 157 aa22.14■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 VEZTQ9HBM0 779 aa22.14■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.14■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.14■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 CNTNAP1P78357 1384 aa22.13■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 MCAMP43121 646 aa22.13■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 DEFB115Q30KQ5 88 aa22.13■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 PI16Q6UXB8 463 aa22.13■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 AACSQ86V21 672 aa22.13■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 ABCF2Q9UG63 623 aa22.13■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.13■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 RASSF10A6NK89 507 aa22.12■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.12■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.12■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.12■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.11■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 SAPCD2Q86UD0 394 aa22.11■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.11■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 BCL11AQ9H165 835 aa22.11■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.11■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.11■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 CEP350Q5VT06 3117 aa22.11■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 SNRKQ9NRH2 765 aa22.1■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.09■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.09■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 VEGFBP49765 207 aa22.08■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 HUNKP57058 714 aa22.08■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 TNFAIP1Q13829 316 aa22.08■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.08■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.08■■□□□ 1.13
HERC3-205ENST00000426683 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.07■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 NF2P35240 595 aa22.07■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 RASA3Q14644 834 aa22.07■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 JMYQ8N9B5 988 aa22.07■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.07■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 DCTPP1Q9H773 170 aa22.07■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.06■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 ZAP70P43403 619 aa22.06■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 CACNB3P54284 484 aa22.06■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.06■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.06■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.06■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 TNNI2P48788 182 aa22.05■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 FKBP1BP68106 108 aa22.05■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 MECOMQ03112 1051 aa22.05■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 GRM1Q13255 1194 aa22.05■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 SLF2Q8IX21 1173 aa22.05■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 CAPNS2Q96L46 248 aa22.05■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 RAI14Q9P0K7 980 aa22.05■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.05■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 ECE1P42892 770 aa22.04■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.04■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 GAKO14976 1311 aa22.04■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 PRKG1Q13976 671 aa22.03■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 MOB2Q70IA6 237 aa22.03■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 USP40Q9NVE5 1235 aa22.03■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.03■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 GSTO1P78417 241 aa22.02■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 AAMPQ13685 434 aa22.02■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.02■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 RGMBQ6NW40 437 aa22.02■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.02■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 ZNF384Q8TF68 577 aa22.02■■□□□ 1.12
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