RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 TLDC2A0PJX2 215 aa12.45□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP7A1P22680 504 aa12.45□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 RTL1A6NKG5 1358 aa12.44□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 CALML3P27482 149 aa12.44□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 RGS22Q8NE09 1264 aa12.44□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 GUCA1BQ9UMX6 200 aa12.44□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 HS2ST1Q7LGA3 356 aa12.44□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 IMPG2Q9BZV3 1241 aa12.44□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa12.44□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 TSPY3P0CV98 308 aa12.44□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 TSPY8P0CW00 308 aa12.44□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa12.44□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa12.44□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM87AQ8NBN3 555 aa12.44□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 LZTFL1Q9NQ48 299 aa12.44□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 CD163L1Q9NR16 1453 aa12.44□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 ALDH1L1O75891 902 aa12.43□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa12.43□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa12.43□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 IL15P40933 162 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 KARSQ15046 597 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT79Q5XKE5 535 aa12.43□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 LMBR1LQ6UX01 489 aa12.43□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa12.43□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 TCHPQ9BT92 498 aa12.43□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 IFNKQ9P0W0 207 aa12.43□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 STIM2Q9P246 746 aa12.43□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 MRVI1Q9Y6F6 885 aa12.43□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa12.43□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGAP23Q9P227 1491 aa12.43□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC160A6NGH7 325 aa12.43□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 GRM8O00222 908 aa12.43□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 STX17P56962 302 aa12.43□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP8B2P98198 1209 aa12.43□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 SYT10Q6XYQ8 523 aa12.43□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC45Q96CN5 670 aa12.43□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 SLIT1O75093 1534 aa12.43□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF569Q5MCW4 686 aa12.43□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 DAAM2Q86T65 1068 aa12.43□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC114Q96M63 670 aa12.43□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 VPS18Q9P253 973 aa12.43□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 GSTO1P78417 241 aa12.42□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 NBPF11Q86T75 865 aa12.42□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 SMC5Q8IY18 1101 aa12.42□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 SELENOSQ9BQE4 189 aa12.42□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 CEP83Q9Y592 693 aa12.42□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 DLC1Q96QB1 1528 aa12.42□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 NAPAP54920 295 aa12.42□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 RAB3GAP1Q15042 981 aa12.42□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC152Q4G0S7 254 aa12.42□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 CFAP58Q5T655 872 aa12.42□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa12.42□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 CAPZA3Q96KX2 299 aa12.42□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP1R9BQ96SB3 815 aa12.42□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 C6orf50Q9HD87 102 aa12.42□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 BICDL2A1A5D9 508 aa12.42□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 RHOXF2BP0C7M4 288 aa12.42□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 COPS6Q7L5N1 327 aa12.42□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 GSTA5Q7RTV2 222 aa12.42□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 NEK11Q8NG66 645 aa12.42□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 RHOXF2Q9BQY4 288 aa12.42□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa12.42□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 XAGE3Q8WTP9 111 aa12.41□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 EEF2P13639 858 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 ADAMTS2O95450 1211 aa12.41□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 FBLN1P23142 703 aa12.41□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 TNNC1P63316 161 aa12.41□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 CNGA4Q8IV77 575 aa12.41□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC63Q8NA47 563 aa12.41□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 IQUBQ8NA54 791 aa12.41□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 CHPF2Q9P2E5 772 aa12.41□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa12.41□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 RIMS2Q9UQ26 1411 aa12.41□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 IGSF3O75054 1194 aa12.41□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 GJC1P36383 396 aa12.41□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 UBXN1Q04323 297 aa12.41□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 IFT81Q8WYA0 676 aa12.41□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 CFAP57Q96MR6 1250 aa12.41□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 NDC80O14777 642 aa12.4□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 AK2P54819 239 aa12.4□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 MAP3K9P80192 1104 aa12.4□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 CALCOCO2Q13137 446 aa12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms