RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421832.2

CTU1-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTU1, Length 2,087 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1-201ENST00000421832 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
CTU1-201ENST00000421832 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
CTU1-201ENST00000421832 SPON1Q9HCB6 807 aa29.14■■■□□ 2.26
CTU1-201ENST00000421832 ZNF532Q9HCE3 1301 aa29.14■■■□□ 2.26
CTU1-201ENST00000421832 HELLSQ9NRZ9 838 aa29.14■■■□□ 2.26
CTU1-201ENST00000421832 ZSCAN30Q86W11 494 aa29.14■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 MAGEB6Q8N7X4 407 aa29.14■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 CCDC171Q6TFL3 1326 aa29.13■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 ZBTB22O15209 634 aa29.13■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 MAP3K12Q12852 859 aa29.13■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 DOK7Q18PE1 504 aa29.13■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 KIF2CQ99661 725 aa29.13■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa29.13■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 NLGN2Q8NFZ4 835 aa29.13■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 APPBP2Q92624 585 aa29.13■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa29.12■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 RAB3GAP1Q15042 981 aa29.11■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 UBE3CQ15386 1083 aa29.11■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa29.11■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 GAS2L3Q86XJ1 694 aa29.11■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 ZNF384Q8TF68 577 aa29.11■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 PRDX5P30044 214 aa29.11■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 RAI14Q9P0K7 980 aa29.11■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 PALD1Q9ULE6 856 aa29.11■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 HS1BP3Q53T59 392 aa29.1■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 CCDC93Q567U6 631 aa29.1■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 VPS53Q5VIR6 699 aa29.1■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 EYA3Q99504 573 aa29.1■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 GRIK5Q16478 980 aa29.09■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 COA1Q9GZY4 146 aa29.09■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa29.09■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 ADGRA1Q86SQ6 560 aa29.09■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 DBNDD1Q9H9R9 158 aa29.08■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 SCN9AQ15858 1988 aa29.08■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 AOC3Q16853 763 aa29.08■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 MAP4K1Q92918 833 aa29.08■■■□□ 2.25
CTU1-201ENST00000421832 UTRNP46939 3433 aa29.07■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 WDR66Q8TBY9 1149 aa29.07■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 SALL1Q9NSC2 1324 aa29.06■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 GPAA1O43292 621 aa29.06■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 HSPA4P34932 840 aa29.06■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 CLEC17AQ6ZS10 378 aa29.06■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 KCNQ5Q9NR82 932 aa29.06■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 MAST2Q6P0Q8 1798 aa29.06■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 FOXP2O15409 715 aa29.05■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 GTF2IP78347 998 aa29.05■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 MECOMQ03112 1051 aa29.05■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 RTKN2Q8IZC4 609 aa29.05■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 CYP7A1P22680 504 aa29.05■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa29.04■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 KIAA2012Q0VF49 1180 aa29.03■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 MIGA1Q8NAN2 632 aa29.03■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 BCS1LQ9Y276 419 aa29.03■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 FAM205AQ6ZU69 1335 aa29.03■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 G3V3G9 751 aa29.03■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 NECTIN1Q15223 517 aa29.03■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 DCAF8Q5TAQ9 597 aa29.03■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 RASEFQ8IZ41 740 aa29.03■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 PSMD1Q99460 953 aa29.03■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 COL4A5P29400 1685 aa29.02■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 PPIP5K2O43314 1243 aa29.01■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 ECE2O60344 883 aa29.01■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 GRIPAP1Q4V328 841 aa29.01■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 MFSD14BQ5SR56 506 aa29.01■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 SUPT20HQ8NEM7 779 aa29.01■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 FBXW7Q969H0 707 aa29.01■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 MXD3Q9BW11 206 aa29.01■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.24
CTU1-201ENST00000421832 MBD4O95243 580 aa29.01■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 LDHBP07195 334 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 MCCP23508 829 aa29.01■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 ARMT1Q9H993 441 aa29.01■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 NASPP49321 788 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 AIDAQ96BJ3 306 aa29■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 MSNP26038 577 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 SOGA3Q5TF21 947 aa29■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 PODNQ7Z5L7 613 aa29■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 LCORLQ8N3X6 602 aa29■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 TAF6LQ9Y6J9 622 aa29■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 TTLL5Q6EMB2 1281 aa28.99■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 CERS5Q8N5B7 392 aa28.99■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 DSCC1Q9BVC3 393 aa28.99■■■□□ 2.23
CTU1-201ENST00000421832 SNX14Q9Y5W7 946 aa28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.1 ms