RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420058.1

NFE4-201, Transcript of nuclear factor, erythroid 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NFE4, Length 1,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE4-201ENST00000420058 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
NFE4-201ENST00000420058 GCC1Q96CN9 775 aa18.1■□□□□ 0.49
NFE4-201ENST00000420058 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
NFE4-201ENST00000420058 GRM8O00222 908 aa18.09■□□□□ 0.49
NFE4-201ENST00000420058 UBE4AQ14139 1066 aa18.09■□□□□ 0.49
NFE4-201ENST00000420058 CCDC57Q2TAC2 916 aa18.09■□□□□ 0.49
NFE4-201ENST00000420058 TMEM39BQ9GZU3 492 aa18.09■□□□□ 0.49
NFE4-201ENST00000420058 CACNA1FO60840 1977 aa18.09■□□□□ 0.49
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NFE4-201ENST00000420058 MAP3K9P80192 1104 aa18.08■□□□□ 0.48
NFE4-201ENST00000420058 WDR63Q8IWG1 891 aa18.08■□□□□ 0.48
NFE4-201ENST00000420058 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP18.08■□□□□ 0.48
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NFE4-201ENST00000420058 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa18.08■□□□□ 0.48
NFE4-201ENST00000420058 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa18.07■□□□□ 0.48
NFE4-201ENST00000420058 TCP10L2B9ZVM9 353 aa18.07■□□□□ 0.48
NFE4-201ENST00000420058 VGLL4Q14135 290 aa18.07■□□□□ 0.48
NFE4-201ENST00000420058 FBXO33Q7Z6M2 555 aa18.07■□□□□ 0.48
NFE4-201ENST00000420058 FAM43AQ8N2R8 423 aa18.07■□□□□ 0.48
NFE4-201ENST00000420058 CRKP46108 304 aa18.06■□□□□ 0.48
NFE4-201ENST00000420058 TNFAIP1Q13829 316 aa18.06■□□□□ 0.48
NFE4-201ENST00000420058 SUCLG2Q96I99 432 aa18.06■□□□□ 0.48
NFE4-201ENST00000420058 OTOFQ9HC10 1997 aa18.06■□□□□ 0.48
NFE4-201ENST00000420058 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
NFE4-201ENST00000420058 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa18.05■□□□□ 0.48
NFE4-201ENST00000420058 CCL15Q16663 113 aa18.05■□□□□ 0.48
NFE4-201ENST00000420058 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
NFE4-201ENST00000420058 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa18.05■□□□□ 0.48
NFE4-201ENST00000420058 ALDH1L1O75891 902 aa18.04■□□□□ 0.48
NFE4-201ENST00000420058 GTF2A2P52657 109 aa18.04■□□□□ 0.48
NFE4-201ENST00000420058 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
NFE4-201ENST00000420058 TAF7LQ5H9L4 462 aa18.04■□□□□ 0.48
NFE4-201ENST00000420058 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
NFE4-201ENST00000420058 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP18.03■□□□□ 0.48
NFE4-201ENST00000420058 CACNB3P54284 484 aa18.03■□□□□ 0.48
NFE4-201ENST00000420058 OTUD5Q96G74 571 aa18.03■□□□□ 0.48
NFE4-201ENST00000420058 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa18.03■□□□□ 0.48
NFE4-201ENST00000420058 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa18.03■□□□□ 0.48
NFE4-201ENST00000420058 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
NFE4-201ENST00000420058 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
NFE4-201ENST00000420058 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa18.03■□□□□ 0.48
NFE4-201ENST00000420058 SPDYE5A6NIY4 337 aa18.02■□□□□ 0.48
NFE4-201ENST00000420058 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
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NFE4-201ENST00000420058 MRIQ9BWK5 157 aa18.02■□□□□ 0.48
NFE4-201ENST00000420058 UTYO14607 1347 aa18.01■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 TLR2O60603 784 aa18.01■□□□□ 0.47
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NFE4-201ENST00000420058 TMEM106CQ9BVX2 250 aa18.01■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa18.01■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 BTBD19C9JJ37 291 aa18■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 IRF6O14896 467 aa18■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
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NFE4-201ENST00000420058 MROH5Q6ZUA9 1318 aa17.99■□□□□ 0.47
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NFE4-201ENST00000420058 TNNI2P48788 182 aa17.99■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 BCAMP50895 628 aa17.99■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa17.99■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 SLC4A10Q6U841 1118 aa17.99■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 ERO1BQ86YB8 467 aa17.99■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 SH3TC2Q8TF17 1288 aa17.99■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 ZDHHC15Q96MV8 337 aa17.99■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 CSADQ9Y600 493 aa17.99■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 ARHGEF6Q15052 776 aa17.98■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 FKBP1CQ5VVH2 108 aa17.98■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 NBPF11Q86T75 865 aa17.98■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 FAM83AQ86UY5 434 aa17.98■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 ARAP2Q8WZ64 1704 aa17.98■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 A0A0C4DFX4 3053 aa17.97■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 PDE8BO95263 885 aa17.97■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 MYCP01106 439 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 CETPP11597 493 aa17.97■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 C17orf99Q6UX52 265 aa17.97■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa17.97■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 TEKT1Q969V4 418 aa17.97■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 WRNIP1Q96S55 665 aa17.97■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa17.97■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 FGFR2P21802 821 aa17.96■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 PPIL2Q13356 520 aa17.96■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 MOGSQ13724 837 aa17.96■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa17.96■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 KLHDC4Q8TBB5 520 aa17.96■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 MRS2Q9HD23 443 aa17.96■□□□□ 0.47
NFE4-201ENST00000420058 H0YGN5 161 aa17.95■□□□□ 0.46
NFE4-201ENST00000420058 INPP5BP32019 993 aa17.95■□□□□ 0.46
NFE4-201ENST00000420058 SNAPC2Q13487 334 aa17.95■□□□□ 0.46
NFE4-201ENST00000420058 METTL24Q5JXM2 366 aa17.95■□□□□ 0.46
NFE4-201ENST00000420058 MIGA2Q7L4E1 593 aa17.95■□□□□ 0.46
NFE4-201ENST00000420058 VPS37DQ86XT2 251 aa17.95■□□□□ 0.46
NFE4-201ENST00000420058 MTFR1Q15390 333 aa17.94■□□□□ 0.46
NFE4-201ENST00000420058 CAVIN4Q5BKX8 364 aa17.94■□□□□ 0.46
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