RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417284.1

RGPD4-AS1-201, Transcript of RGPD4 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2

Gene RGPD4-AS1, Length 461 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SPDYE5A6NIY4 337 aa6.45□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 H7C1W4 665 aa6.45□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 APBB1O00213 710 aa6.45□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CIAO1O76071 339 aa6.45□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CASP7P55210 303 aa6.45□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CABP4P57796 275 aa6.45□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PROSER3Q2NL68 480 aa6.45□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RNF20Q5VTR2 975 aa6.45□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 USPL1Q5W0Q7 1092 aa6.45□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZNF511Q8NB15 262 aa6.45□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CCDC191Q8NCU4 936 aa6.45□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 WHAMMQ8TF30 809 aa6.45□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SUCLG2Q96I99 432 aa6.45□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GRPEL1Q9HAV7 217 aa6.45□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa6.45□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LMBRD1Q9NUN5 540 aa6.45□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SLAIN2Q9P270 581 aa6.45□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.45□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa6.45□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ABCC12Q96J65 1359 aa6.44□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SASH1O94885 1247 aa6.44□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IGHA1P01876 353 aa6.44□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa6.44□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP6.44□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IL2RBP14784 551 aa6.44□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 VARSP26640 1264 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SSFA2P28290 1259 aa6.44□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NECTIN1Q15223 517 aa6.44□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa6.44□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RNFT1Q5M7Z0 435 aa6.44□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 COPS6Q7L5N1 327 aa6.44□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 UNC5CLQ8IV45 518 aa6.44□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FBXL16Q8N461 479 aa6.44□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 XAGE3Q8WTP9 111 aa6.44□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ITPKCQ96DU7 683 aa6.44□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PLA2G12BQ9BX93 195 aa6.44□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa6.44□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZDHHC9Q9Y397 364 aa6.44□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SNX14Q9Y5W7 946 aa6.44□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RGPD2P0DJD1 1756 aa6.44□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C6orf229H3BNL8 230 aa6.43□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PDCP20941 246 aa6.43□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IL15P40933 162 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MTMR2Q13614 643 aa6.43□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SH3D19Q5HYK7 790 aa6.43□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 AACSQ86V21 672 aa6.43□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa6.43□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CCDC171Q6TFL3 1326 aa6.43□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GLI3P10071 1580 aa6.43□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MED23Q9ULK4 1368 aa6.43□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LAMB4A4D0S4 1761 aa6.42□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 STRCP1A6NGW2 1772 aa6.42□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NR3C2P08235 984 aa6.42□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CCDC173Q0VFZ6 552 aa6.42□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RUFY3Q7L099 469 aa6.42□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SVOPQ8N4V2 548 aa6.42□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FAM184AQ8NB25 1140 aa6.42□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PPP1R9BQ96SB3 815 aa6.42□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MYD88Q99836 296 aa6.42□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HAUS7Q99871 368 aa6.42□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZBTB3Q9H5J0 574 aa6.42□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GOPCQ9HD26 462 aa6.42□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PRDM11Q9NQV5 511 aa6.42□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.42□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PALD1Q9ULE6 856 aa6.42□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 USP16Q9Y5T5 823 aa6.42□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PAPPAQ13219 1627 aa6.42□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PALLDQ8WX93 1383 aa6.42□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 UBR2Q8IWV8 1755 aa6.41□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LRP6O75581 1613 aa6.41□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZBTB7CA1YPR0 619 aa6.41□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ARHGEF15O94989 841 aa6.41□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ANXA1P04083 346 aa6.41□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SLC39A6Q13433 755 aa6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms