RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 MAST3O60307 1309 aa4.74□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 MROH5Q6ZUA9 1318 aa4.74□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 ZPR1O75312 459 aa4.74□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 RPS6KA4O75676 772 aa4.74□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 IDH1O75874 414 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
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LRRTM4-201ENST00000409088 KRT32Q14532 448 aa4.74□□□□□ -1.65
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LRRTM4-201ENST00000409088 TSGA10IPQ3SY00 556 aa4.74□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 TBC1D9BQ66K14 1250 aa4.74□□□□□ -1.65
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LRRTM4-201ENST00000409088 CLEC17AQ6ZS10 378 aa4.74□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC24Q8N4L8 307 aa4.74□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 TPCN1Q9ULQ1 816 aa4.74□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa4.73□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A0G2JLW4 131 aa4.73□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 HRO43593 1189 aa4.73□□□□□ -1.65
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LRRTM4-201ENST00000409088 BRD1O95696 1058 aa4.73□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC5A1P13866 664 aa4.73□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 NCLP19338 710 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 PTMSP20962 102 aa4.73□□□□□ -1.65
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LRRTM4-201ENST00000409088 STK3Q13188 491 aa4.73□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 SETDB2Q96T68 719 aa4.73□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 DSCC1Q9BVC3 393 aa4.73□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 LRRC2Q9BYS8 371 aa4.73□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
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LRRTM4-201ENST00000409088 BCL2L12Q9HB09 334 aa4.73□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa4.73□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 FGFR2P21802 821 aa4.73□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 GJA5P36382 358 aa4.73□□□□□ -1.65
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LRRTM4-201ENST00000409088 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa4.73□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 TTLL5Q6EMB2 1281 aa4.73□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP4.73□□□□□ -1.65
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LRRTM4-201ENST00000409088 FOSBP53539 338 aa4.73□□□□□ -1.65
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LRRTM4-201ENST00000409088 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa4.73□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 APPBP2Q92624 585 aa4.73□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
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LRRTM4-201ENST00000409088 ST3GAL1Q11201 340 aa4.72□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM196AQ6ZSG2 479 aa4.72□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 Q6ZUG5 572 aa4.72□□□□□ -1.65
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LRRTM4-201ENST00000409088 LMBRD1Q9NUN5 540 aa4.72□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa4.72□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 E7EWF7 191 aa4.72□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 STX6O43752 255 aa4.72□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 FGAP02671 866 aa4.72□□□□□ -1.65
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LRRTM4-201ENST00000409088 RFC4P35249 363 aa4.72□□□□□ -1.65
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LRRTM4-201ENST00000409088 TRAPPC3LQ5T215 181 aa4.72□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa4.72□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 CHST3Q7LGC8 479 aa4.72□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 SPATA5Q8NB90 893 aa4.72□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 BRF1Q92994 677 aa4.72□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 NLRP3Q96P20 1036 aa4.72□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 WWC3Q9ULE0 1092 aa4.72□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 APPP05067 770 aa4.72□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 RASGRF1Q13972 1273 aa4.72□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 TPTE2Q6XPS3 522 aa4.72□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 LAPTM4BQ86VI4 370 aa4.72□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 NYXQ9GZU5 481 aa4.72□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 GDPD2Q9HCC8 539 aa4.72□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 CTNNA3Q9UI47 895 aa4.72□□□□□ -1.65
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