RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393193.6

NME1-NME2-202, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 1,021 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-202ENST00000393193 RGMBQ6NW40 437 aa20.25■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 CEP85Q6P2H3 762 aa20.25■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 MOB2Q70IA6 237 aa20.25■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 CLRN2A0PK11 232 aa20.24■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 MVPQ14764 893 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 WDR66Q8TBY9 1149 aa20.24■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 XAGE2Q96GT9 111 aa20.24■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 DEFB129Q9H1M3 183 aa20.24■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 RASGRF1Q13972 1273 aa20.23■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZDHHC15Q96MV8 337 aa20.23■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.23■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.23■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 SLC10A3P09131 477 aa20.22■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 HHIPL2Q6UWX4 724 aa20.22■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 TEPSINQ96N21 525 aa20.22■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 GPR108Q9NPR9 543 aa20.22■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa20.22■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 MS4A1P11836 297 aa20.21■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 PRDX5P30044 214 aa20.21■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 NOGQ13253 232 aa20.21■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 MAP3K11Q16584 847 aa20.21■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 LDLRAD1Q5T700 205 aa20.21■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 C20orf194Q5TEA3 1177 aa20.21■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 DENND2AQ9ULE3 1009 aa20.21■□□□□ 0.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.829e-7■■■□□ 17
NME1-NME2-202ENST00000393193 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 RASAL3Q86YV0 1011 aa20.2■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 CDAN1Q8IWY9 1227 aa20.2■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 SIRT2Q8IXJ6 389 aa20.2■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 TEKT1Q969V4 418 aa20.2■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 MAST2Q6P0Q8 1798 aa20.2■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 MAST3O60307 1309 aa20.2■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 MYO1BO43795 1136 aa20.19■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 RASA3Q14644 834 aa20.19■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 COG6Q9Y2V7 657 aa20.19■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 UBE2Q2LH0YL09 131 aa20.18■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 GRM1Q13255 1194 aa20.18■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 PDE3AQ14432 1141 aa20.18■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.18■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF384Q8TF68 577 aa20.18■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 CCDC102AQ96A19 550 aa20.18■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 VEZTQ9HBM0 779 aa20.18■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.18■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 FZD1Q9UP38 647 aa20.18■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa20.18■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 RFX7Q2KHR2 1363 aa20.18■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 TNNI3KQ59H18 835 aa20.17■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 FKBP1CQ5VVH2 108 aa20.17■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 HMG20BQ9P0W2 317 aa20.17■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa20.17■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 DOCK2Q92608 1830 aa20.17■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 GAKO14976 1311 aa20.17■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa20.16■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 PI16Q6UXB8 463 aa20.16■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 NF2P35240 595 aa20.15■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 MCAMP43121 646 aa20.15■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 CACNB3P54284 484 aa20.15■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 TNFAIP1Q13829 316 aa20.15■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 DBNDD2Q9BQY9 259 aa20.15■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 PRDM10Q9NQV6 1147 aa20.15■□□□□ 0.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa20.14■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 LDHBP07195 334 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM83AQ86UY5 434 aa20.14■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.14■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 TMEM39BQ9GZU3 492 aa20.14■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 FOCADQ5VW36 1801 aa20.13■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 TCP10L2B9ZVM9 353 aa20.13■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 USP2O75604 605 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa20.13■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 CSRNP1Q96S65 589 aa20.13■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa20.13■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 UNCXA6NJT0 531 aa20.12■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 LBX1P52954 281 aa20.12■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa20.12■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.12■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms