RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380711.3

CHKB-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CHKB-AS1, Length 578 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-AS1-201ENST00000380711 PTPN18Q99952 460 aa28.98■■■□□ 2.23
CHKB-AS1-201ENST00000380711 ELP3Q9H9T3 547 aa28.98■■■□□ 2.23
CHKB-AS1-201ENST00000380711 TNNI2P48788 182 aa28.97■■■□□ 2.23
CHKB-AS1-201ENST00000380711 VPS37DQ86XT2 251 aa28.97■■■□□ 2.23
CHKB-AS1-201ENST00000380711 OPTNQ96CV9 577 aa28.97■■■□□ 2.23
CHKB-AS1-201ENST00000380711 TCP10L2B9ZVM9 353 aa28.96■■■□□ 2.23
CHKB-AS1-201ENST00000380711 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
CHKB-AS1-201ENST00000380711 CDAN1Q8IWY9 1227 aa28.96■■■□□ 2.23
CHKB-AS1-201ENST00000380711 PCDH10Q9P2E7 1040 aa28.96■■■□□ 2.23
CHKB-AS1-201ENST00000380711 ZNF521Q96K83 1311 aa28.95■■■□□ 2.23
CHKB-AS1-201ENST00000380711 GRIK5Q16478 980 aa28.95■■■□□ 2.22
CHKB-AS1-201ENST00000380711 LRRC24Q50LG9 513 aa28.95■■■□□ 2.22
CHKB-AS1-201ENST00000380711 CAVIN4Q5BKX8 364 aa28.95■■■□□ 2.22
CHKB-AS1-201ENST00000380711 METTL24Q5JXM2 366 aa28.95■■■□□ 2.22
CHKB-AS1-201ENST00000380711 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
CHKB-AS1-201ENST00000380711 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
CHKB-AS1-201ENST00000380711 ANKRD44Q8N8A2 993 aa28.95■■■□□ 2.22
CHKB-AS1-201ENST00000380711 CD99L2Q8TCZ2 262 aa28.95■■■□□ 2.22
CHKB-AS1-201ENST00000380711 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa28.95■■■□□ 2.22
CHKB-AS1-201ENST00000380711 TMEM39BQ9GZU3 492 aa28.95■■■□□ 2.22
CHKB-AS1-201ENST00000380711 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
CHKB-AS1-201ENST00000380711 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
CHKB-AS1-201ENST00000380711 VGLL2Q8N8G2 317 aa28.94■■■□□ 2.22
CHKB-AS1-201ENST00000380711 MS4A4AQ96JQ5 239 aa28.94■■■□□ 2.22
CHKB-AS1-201ENST00000380711 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
CHKB-AS1-201ENST00000380711 PTPN22Q9Y2R2 807 aa28.94■■■□□ 2.22
CHKB-AS1-201ENST00000380711 PDE8BO95263 885 aa28.93■■■□□ 2.22
CHKB-AS1-201ENST00000380711 MAP3K9P80192 1104 aa28.93■■■□□ 2.22
CHKB-AS1-201ENST00000380711 SP3Q02447 781 aa28.93■■■□□ 2.22
CHKB-AS1-201ENST00000380711 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
CHKB-AS1-201ENST00000380711 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP28.93■■■□□ 2.22
CHKB-AS1-201ENST00000380711 VGLL4Q14135 290 aa28.92■■■□□ 2.22
CHKB-AS1-201ENST00000380711 EFCC1Q9HA90 598 aa28.92■■■□□ 2.22
CHKB-AS1-201ENST00000380711 PTPRCP08575 1304 aa28.92■■■□□ 2.22
CHKB-AS1-201ENST00000380711 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
CHKB-AS1-201ENST00000380711 TEKT1Q969V4 418 aa28.91■■■□□ 2.22
CHKB-AS1-201ENST00000380711 GTF2A2P52657 109 aa28.9■■■□□ 2.22
CHKB-AS1-201ENST00000380711 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa28.9■■■□□ 2.22
CHKB-AS1-201ENST00000380711 MRIQ9BWK5 157 aa28.9■■■□□ 2.22
CHKB-AS1-201ENST00000380711 CSADQ9Y600 493 aa28.9■■■□□ 2.22
CHKB-AS1-201ENST00000380711 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
CHKB-AS1-201ENST00000380711 BRI3BPQ8WY22 251 aa28.89■■■□□ 2.22
CHKB-AS1-201ENST00000380711 KIF16BQ96L93 1317 aa28.89■■■□□ 2.21
CHKB-AS1-201ENST00000380711 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa28.88■■■□□ 2.21
CHKB-AS1-201ENST00000380711 POTEFA5A3E0 1075 aa28.88■■■□□ 2.21
CHKB-AS1-201ENST00000380711 CCL15Q16663 113 aa28.88■■■□□ 2.21
CHKB-AS1-201ENST00000380711 ZDHHC15Q96MV8 337 aa28.88■■■□□ 2.21
CHKB-AS1-201ENST00000380711 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
CHKB-AS1-201ENST00000380711 HTTP42858 3142 aa28.87■■■□□ 2.21
CHKB-AS1-201ENST00000380711 BCAMP50895 628 aa28.87■■■□□ 2.21
CHKB-AS1-201ENST00000380711 KLHDC4Q8TBB5 520 aa28.87■■■□□ 2.21
CHKB-AS1-201ENST00000380711 ARMC5Q96C12 935 aa28.87■■■□□ 2.21
CHKB-AS1-201ENST00000380711 TMOD2Q9NZR1 351 aa28.87■■■□□ 2.21
CHKB-AS1-201ENST00000380711 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa28.87■■■□□ 2.21
CHKB-AS1-201ENST00000380711 MAST3O60307 1309 aa28.87■■■□□ 2.21
CHKB-AS1-201ENST00000380711 CACNB3P54284 484 aa28.86■■■□□ 2.21
CHKB-AS1-201ENST00000380711 CAP1Q01518 475 aa28.86■■■□□ 2.21
CHKB-AS1-201ENST00000380711 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
CHKB-AS1-201ENST00000380711 FAM83AQ86UY5 434 aa28.86■■■□□ 2.21
CHKB-AS1-201ENST00000380711 OTUD5Q96G74 571 aa28.86■■■□□ 2.21
CHKB-AS1-201ENST00000380711 USP44Q9H0E7 712 aa28.86■■■□□ 2.21
CHKB-AS1-201ENST00000380711 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa28.86■■■□□ 2.21
CHKB-AS1-201ENST00000380711 SPDYE5A6NIY4 337 aa28.85■■■□□ 2.21
CHKB-AS1-201ENST00000380711 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
CHKB-AS1-201ENST00000380711 FGFR2P21802 821 aa28.85■■■□□ 2.21
CHKB-AS1-201ENST00000380711 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
CHKB-AS1-201ENST00000380711 FKBP1CQ5VVH2 108 aa28.85■■■□□ 2.21
CHKB-AS1-201ENST00000380711 ARHGEF6Q15052 776 aa28.84■■■□□ 2.21
CHKB-AS1-201ENST00000380711 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
CHKB-AS1-201ENST00000380711 HOOK2Q96ED9 719 aa28.84■■■□□ 2.21
CHKB-AS1-201ENST00000380711 HHIPL2Q6UWX4 724 aa28.83■■■□□ 2.21
CHKB-AS1-201ENST00000380711 FAM43AQ8N2R8 423 aa28.83■■■□□ 2.21
CHKB-AS1-201ENST00000380711 SSH1Q8WYL5 1049 aa28.83■■■□□ 2.21
CHKB-AS1-201ENST00000380711 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa28.83■■■□□ 2.21
CHKB-AS1-201ENST00000380711 E9PSI1 815 aa28.82■■■□□ 2.2
CHKB-AS1-201ENST00000380711 ERO1BQ86YB8 467 aa28.82■■■□□ 2.2
CHKB-AS1-201ENST00000380711 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
CHKB-AS1-201ENST00000380711 WRNIP1Q96S55 665 aa28.81■■■□□ 2.2
CHKB-AS1-201ENST00000380711 EYA2O00167 538 aa28.8■■■□□ 2.2
CHKB-AS1-201ENST00000380711 CETPP11597 493 aa28.8■■■□□ 2.2
CHKB-AS1-201ENST00000380711 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
CHKB-AS1-201ENST00000380711 GCC1Q96CN9 775 aa28.8■■■□□ 2.2
CHKB-AS1-201ENST00000380711 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
CHKB-AS1-201ENST00000380711 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
CHKB-AS1-201ENST00000380711 SLC5A1P13866 664 aa28.79■■■□□ 2.2
CHKB-AS1-201ENST00000380711 DCAF15Q66K64 600 aa28.79■■■□□ 2.2
CHKB-AS1-201ENST00000380711 WDR66Q8TBY9 1149 aa28.79■■■□□ 2.2
CHKB-AS1-201ENST00000380711 LPIN2Q92539 896 aa28.79■■■□□ 2.2
CHKB-AS1-201ENST00000380711 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
CHKB-AS1-201ENST00000380711 ZNF333Q96JL9 665 aa28.78■■■□□ 2.2
CHKB-AS1-201ENST00000380711 MYH13Q9UKX3 1938 aa28.78■■■□□ 2.2
CHKB-AS1-201ENST00000380711 IRF6O14896 467 aa28.77■■■□□ 2.2
CHKB-AS1-201ENST00000380711 TLR2O60603 784 aa28.77■■■□□ 2.2
CHKB-AS1-201ENST00000380711 PPIL2Q13356 520 aa28.77■■■□□ 2.2
CHKB-AS1-201ENST00000380711 SNAPC2Q13487 334 aa28.77■■■□□ 2.2
CHKB-AS1-201ENST00000380711 EN2P19622 333 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
CHKB-AS1-201ENST00000380711 ALDH1L2Q3SY69 923 aa28.76■■■□□ 2.19
CHKB-AS1-201ENST00000380711 TMEM106CQ9BVX2 250 aa28.76■■■□□ 2.19
CHKB-AS1-201ENST00000380711 ZNF341Q9BYN7 854 aa28.76■■■□□ 2.19
CHKB-AS1-201ENST00000380711 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms