RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 EXOC6Q8TAG9 804 aa18.84■□□□□ 0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 GGA3Q9NZ52 723 aa18.84■□□□□ 0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa18.83■□□□□ 0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa18.83■□□□□ 0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 SLF2Q8IX21 1173 aa18.83■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 TEKT1Q969V4 418 aa18.83■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 HMG20BQ9P0W2 317 aa18.83■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 CRKP46108 304 aa18.82■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 NBPF9Q3BBW0 867 aa18.82■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 BCL11AQ9H165 835 aa18.82■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 ABCF2Q9UG63 623 aa18.82■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 MYH13Q9UKX3 1938 aa18.82■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 PASKQ96RG2 1323 aa18.81■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 SPDYE2BA6NHP3 402 aa18.81■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 IGSF3O75054 1194 aa18.81■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 SPDYE6P0CI01 402 aa18.81■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 HHIPL2Q6UWX4 724 aa18.81■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 ERICH6Q7L0X2 663 aa18.81■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 USP48Q86UV5 1035 aa18.81■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 GCC1Q96CN9 775 aa18.81■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 CREBZFQ9NS37 354 aa18.81■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 MCAMP43121 646 aa18.8■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 ZDHHC15Q96MV8 337 aa18.8■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 PRDX5P30044 214 aa18.79■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 GSTO1P78417 241 aa18.79■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 GRIK5Q16478 980 aa18.79■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 GPATCH3Q96I76 525 aa18.79■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 LRP2BPQ9P2M1 347 aa18.79■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM88BA6NKF7 163 aa18.78■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 TRAF5O00463 557 aa18.78■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP18.78■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 TNFAIP1Q13829 316 aa18.78■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 SNRKQ9NRH2 765 aa18.78■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 TMOD2Q9NZR1 351 aa18.78■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 LDHCP07864 332 aa18.77■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 PI16Q6UXB8 463 aa18.77■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP18.77■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 RAI14Q9P0K7 980 aa18.77■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 CNTNAP1P78357 1384 aa18.77■□□□□ 0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 CELF2O95319 508 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 VEZTQ9HBM0 779 aa18.76■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa18.76■□□□□ 0.59
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PGGT1B-202ENST00000379615 NF2P35240 595 aa18.75■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 ZAP70P43403 619 aa18.75■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 TNNI2P48788 182 aa18.75■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 SPDYE2Q495Y8 402 aa18.75■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa18.75■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 CLRN2A0PK11 232 aa18.74■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 FOXN1O15353 648 aa18.74■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 ATP5JP18859 108 aa18.74■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 VEGFBP49765 207 aa18.74■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 MECOMQ03112 1051 aa18.74■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 DIXDC1Q155Q3 683 aa18.74■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 ANKRD45Q5TZF3 282 aa18.74■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 CDCA5Q96FF9 252 aa18.74■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 DEFB129Q9H1M3 183 aa18.74■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF408Q9H9D4 720 aa18.74■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 ECHDC1Q9NTX5 307 aa18.74■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa18.74■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa18.74■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 MAP3K12Q12852 859 aa18.73■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 FKBP1CQ5VVH2 108 aa18.73■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa18.72■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 CST9Q5W186 159 aa18.72■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 C2orf69Q8N8R5 385 aa18.72■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 GAKO14976 1311 aa18.72■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 AKAP11Q9UKA4 1901 aa18.71■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 IDH1O75874 414 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 FKBP1BP68106 108 aa18.71■□□□□ 0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 SMC5Q8IY18 1101 aa18.71■□□□□ 0.59
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