RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 CEP126Q9P2H0 1117 aa29.28■■■□□ 2.28
FAAP20-201ENST00000378543 SPDYE2Q495Y8 402 aa29.27■■■□□ 2.28
FAAP20-201ENST00000378543 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
FAAP20-201ENST00000378543 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
FAAP20-201ENST00000378543 IL15P40933 162 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
FAAP20-201ENST00000378543 ATP2B3Q16720 1220 aa29.26■■■□□ 2.27
FAAP20-201ENST00000378543 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa29.26■■■□□ 2.27
FAAP20-201ENST00000378543 RASA3Q14644 834 aa29.25■■■□□ 2.27
FAAP20-201ENST00000378543 LDLRAD1Q5T700 205 aa29.25■■■□□ 2.27
FAAP20-201ENST00000378543 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
FAAP20-201ENST00000378543 RNF186Q9NXI6 227 aa29.25■■■□□ 2.27
FAAP20-201ENST00000378543 TRPA1O75762 1119 aa29.24■■■□□ 2.27
FAAP20-201ENST00000378543 SAGE1Q9NXZ1 904 aa29.24■■■□□ 2.27
FAAP20-201ENST00000378543 SRGAP3O43295 1099 aa29.23■■■□□ 2.27
FAAP20-201ENST00000378543 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
FAAP20-201ENST00000378543 MTX1Q13505 466 aa29.23■■■□□ 2.27
FAAP20-201ENST00000378543 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
FAAP20-201ENST00000378543 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
FAAP20-201ENST00000378543 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa29.22■■■□□ 2.27
FAAP20-201ENST00000378543 TMEM57Q8N5G2 664 aa29.22■■■□□ 2.27
FAAP20-201ENST00000378543 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
FAAP20-201ENST00000378543 TNFAIP1Q13829 316 aa29.21■■■□□ 2.27
FAAP20-201ENST00000378543 MAP3K11Q16584 847 aa29.21■■■□□ 2.27
FAAP20-201ENST00000378543 TEKT1Q969V4 418 aa29.21■■■□□ 2.27
FAAP20-201ENST00000378543 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa29.21■■■□□ 2.27
FAAP20-201ENST00000378543 GNAI2P04899 355 aa29.2■■■□□ 2.26
FAAP20-201ENST00000378543 TCP10L2B9ZVM9 353 aa29.19■■■□□ 2.26
FAAP20-201ENST00000378543 WDR66Q8TBY9 1149 aa29.19■■■□□ 2.26
FAAP20-201ENST00000378543 MRIQ9BWK5 157 aa29.19■■■□□ 2.26
FAAP20-201ENST00000378543 ADORA1P30542 326 aa29.18■■■□□ 2.26
FAAP20-201ENST00000378543 PHKA1P46020 1223 aa29.18■■■□□ 2.26
FAAP20-201ENST00000378543 CDAN1Q8IWY9 1227 aa29.18■■■□□ 2.26
FAAP20-201ENST00000378543 ZDHHC15Q96MV8 337 aa29.18■■■□□ 2.26
FAAP20-201ENST00000378543 TEPSINQ96N21 525 aa29.18■■■□□ 2.26
FAAP20-201ENST00000378543 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
FAAP20-201ENST00000378543 MAST3O60307 1309 aa29.18■■■□□ 2.26
FAAP20-201ENST00000378543 USP2O75604 605 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
FAAP20-201ENST00000378543 ABHD8Q96I13 439 aa29.17■■■□□ 2.26
FAAP20-201ENST00000378543 CLMNQ96JQ2 1002 aa29.17■■■□□ 2.26
FAAP20-201ENST00000378543 TM4SF4P48230 202 aa29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-201ENST00000378543 CACNB3P54284 484 aa29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-201ENST00000378543 TIMM10P62072 90 aa29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-201ENST00000378543 SPRYD7Q5W111 196 aa29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-201ENST00000378543 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-201ENST00000378543 SLC10A4Q96EP9 437 aa29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-201ENST00000378543 TMEM39BQ9GZU3 492 aa29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-201ENST00000378543 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-201ENST00000378543 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-201ENST00000378543 TNNI2P48788 182 aa29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-201ENST00000378543 TFCP2Q12800 502 aa29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-201ENST00000378543 HHIPL2Q6UWX4 724 aa29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-201ENST00000378543 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-201ENST00000378543 OTOFQ9HC10 1997 aa29.14■■■□□ 2.26
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC102BQ68D86 513 aa29.14■■■□□ 2.26
FAAP20-201ENST00000378543 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
FAAP20-201ENST00000378543 MS4A1P11836 297 aa29.13■■■□□ 2.25
FAAP20-201ENST00000378543 IREB2P48200 963 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
FAAP20-201ENST00000378543 MCOLN1Q9GZU1 580 aa29.13■■■□□ 2.25
FAAP20-201ENST00000378543 DENND2AQ9ULE3 1009 aa29.13■■■□□ 2.25
FAAP20-201ENST00000378543 A0A1B0GUL7 405 aa29.12■■■□□ 2.25
FAAP20-201ENST00000378543 UNCXA6NJT0 531 aa29.12■■■□□ 2.25
FAAP20-201ENST00000378543 SEMA3EO15041 775 aa29.12■■■□□ 2.25
FAAP20-201ENST00000378543 PRDX5P30044 214 aa29.12■■■□□ 2.25
FAAP20-201ENST00000378543 RLBP1P12271 317 aa29.11■■■□□ 2.25
FAAP20-201ENST00000378543 SREBF2Q12772 1141 aa29.11■■■□□ 2.25
FAAP20-201ENST00000378543 WNK4Q96J92 1243 aa29.11■■■□□ 2.25
FAAP20-201ENST00000378543 AKAP2Q9Y2D5 859 aa29.11■■■□□ 2.25
FAAP20-201ENST00000378543 SALL1Q9NSC2 1324 aa29.11■■■□□ 2.25
FAAP20-201ENST00000378543 ZBTB22O15209 634 aa29.1■■■□□ 2.25
FAAP20-201ENST00000378543 TBC1D8O95759 1140 aa29.1■■■□□ 2.25
FAAP20-201ENST00000378543 DGKZQ13574 1117 aa29.1■■■□□ 2.25
FAAP20-201ENST00000378543 DIXDC1Q155Q3 683 aa29.1■■■□□ 2.25
FAAP20-201ENST00000378543 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa29.1■■■□□ 2.25
FAAP20-201ENST00000378543 XAGE2Q96GT9 111 aa29.1■■■□□ 2.25
FAAP20-201ENST00000378543 TMOD2Q9NZR1 351 aa29.1■■■□□ 2.25
FAAP20-201ENST00000378543 LAMB1P07942 1786 aa29.1■■■□□ 2.25
FAAP20-201ENST00000378543 LDHBP07195 334 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
FAAP20-201ENST00000378543 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa29.09■■■□□ 2.25
FAAP20-201ENST00000378543 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
FAAP20-201ENST00000378543 FKBP1CQ5VVH2 108 aa29.08■■■□□ 2.25
FAAP20-201ENST00000378543 FAM83AQ86UY5 434 aa29.08■■■□□ 2.25
FAAP20-201ENST00000378543 GJA5P36382 358 aa29.07■■■□□ 2.24
FAAP20-201ENST00000378543 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP29.07■■■□□ 2.24
FAAP20-201ENST00000378543 RASGRF1Q13972 1273 aa29.07■■■□□ 2.24
FAAP20-201ENST00000378543 ITPRIPQ8IWB1 547 aa29.07■■■□□ 2.24
FAAP20-201ENST00000378543 NEUROD6Q96NK8 337 aa29.07■■■□□ 2.24
FAAP20-201ENST00000378543 C1orf115Q9H7X2 142 aa29.07■■■□□ 2.24
FAAP20-201ENST00000378543 MYH2Q9UKX2 1941 aa29.07■■■□□ 2.24
FAAP20-201ENST00000378543 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
FAAP20-201ENST00000378543 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
FAAP20-201ENST00000378543 ATP8B2P98198 1209 aa29.05■■■□□ 2.24
FAAP20-201ENST00000378543 POLA2Q14181 598 aa29.05■■■□□ 2.24
FAAP20-201ENST00000378543 MVPQ14764 893 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
FAAP20-201ENST00000378543 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa29.05■■■□□ 2.24
FAAP20-201ENST00000378543 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
FAAP20-201ENST00000378543 ELP3Q9H9T3 547 aa29.05■■■□□ 2.24
FAAP20-201ENST00000378543 INHBEP58166 350 aa29.04■■■□□ 2.24
FAAP20-201ENST00000378543 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
FAAP20-201ENST00000378543 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms