RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376303.6

SYP-202, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 2

Gene SYP, Length 858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-202ENST00000376303 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 BCAMP50895 628 aa22.02■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 INHBEP58166 350 aa22.02■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.02■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SYP-202ENST00000376303 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.01■■□□□ 1.11
SYP-202ENST00000376303 FBXO3Q9UK99 471 aa22.01■■□□□ 1.11
SYP-202ENST00000376303 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SYP-202ENST00000376303 ALDH1A1P00352 501 aa22■■□□□ 1.11
SYP-202ENST00000376303 SLC5A1P13866 664 aa22■■□□□ 1.11
SYP-202ENST00000376303 TNNI2P48788 182 aa22■■□□□ 1.11
SYP-202ENST00000376303 GRIK5Q16478 980 aa22■■□□□ 1.11
SYP-202ENST00000376303 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SYP-202ENST00000376303 LPIN2Q92539 896 aa22■■□□□ 1.11
SYP-202ENST00000376303 CLMNQ96JQ2 1002 aa22■■□□□ 1.11
SYP-202ENST00000376303 MRIQ9BWK5 157 aa22■■□□□ 1.11
SYP-202ENST00000376303 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22■■□□□ 1.11
SYP-202ENST00000376303 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.99■■□□□ 1.11
SYP-202ENST00000376303 TEKT1Q969V4 418 aa21.99■■□□□ 1.11
SYP-202ENST00000376303 WNK4Q96J92 1243 aa21.99■■□□□ 1.11
SYP-202ENST00000376303 OTOFQ9HC10 1997 aa21.99■■□□□ 1.11
SYP-202ENST00000376303 MAST3O60307 1309 aa21.99■■□□□ 1.11
SYP-202ENST00000376303 GPR25O00155 361 aa21.98■■□□□ 1.11
SYP-202ENST00000376303 RARSP54136 660 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SYP-202ENST00000376303 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SYP-202ENST00000376303 ATG9AQ7Z3C6 839 aa21.98■■□□□ 1.11
SYP-202ENST00000376303 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SYP-202ENST00000376303 TCP10L2B9ZVM9 353 aa21.97■■□□□ 1.11
SYP-202ENST00000376303 CIAO1O76071 339 aa21.97■■□□□ 1.11
SYP-202ENST00000376303 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SYP-202ENST00000376303 ARHGAP45Q92619 1136 aa21.97■■□□□ 1.11
SYP-202ENST00000376303 TEPSINQ96N21 525 aa21.97■■□□□ 1.11
SYP-202ENST00000376303 IFNL1Q8IU54 200 aa21.96■■□□□ 1.11
SYP-202ENST00000376303 WDR66Q8TBY9 1149 aa21.96■■□□□ 1.11
SYP-202ENST00000376303 ZDHHC15Q96MV8 337 aa21.96■■□□□ 1.11
SYP-202ENST00000376303 SIL1Q9H173 461 aa21.96■■□□□ 1.11
SYP-202ENST00000376303 CEP126Q9P2H0 1117 aa21.96■■□□□ 1.11
SYP-202ENST00000376303 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.95■■□□□ 1.1
SYP-202ENST00000376303 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SYP-202ENST00000376303 FKTNO75072 461 aa21.94■■□□□ 1.1
SYP-202ENST00000376303 HHIPL2Q6UWX4 724 aa21.94■■□□□ 1.1
SYP-202ENST00000376303 TMOD2Q9NZR1 351 aa21.94■■□□□ 1.1
SYP-202ENST00000376303 IL15P40933 162 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SYP-202ENST00000376303 ATP2B3Q16720 1220 aa21.93■■□□□ 1.1
SYP-202ENST00000376303 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.93■■□□□ 1.1
SYP-202ENST00000376303 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SYP-202ENST00000376303 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.93■■□□□ 1.1
SYP-202ENST00000376303 CDAN1Q8IWY9 1227 aa21.93■■□□□ 1.1
SYP-202ENST00000376303 MEIS3Q99687 375 aa21.93■■□□□ 1.1
SYP-202ENST00000376303 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa21.93■■□□□ 1.1
SYP-202ENST00000376303 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SYP-202ENST00000376303 FAM83AQ86UY5 434 aa21.92■■□□□ 1.1
SYP-202ENST00000376303 ELP3Q9H9T3 547 aa21.92■■□□□ 1.1
SYP-202ENST00000376303 COPRSQ9NQ92 184 aa21.92■■□□□ 1.1
SYP-202ENST00000376303 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SYP-202ENST00000376303 AK9Q5TCS8 1911 aa21.91■■□□□ 1.1
SYP-202ENST00000376303 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP21.91■■□□□ 1.1
SYP-202ENST00000376303 GNAI3P08754 354 aa21.91■■□□□ 1.1
SYP-202ENST00000376303 GJA5P36382 358 aa21.91■■□□□ 1.1
SYP-202ENST00000376303 CACNB3P54284 484 aa21.91■■□□□ 1.1
SYP-202ENST00000376303 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SYP-202ENST00000376303 OPTNQ96CV9 577 aa21.91■■□□□ 1.1
SYP-202ENST00000376303 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.91■■□□□ 1.1
SYP-202ENST00000376303 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SYP-202ENST00000376303 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SYP-202ENST00000376303 MAP3K9P80192 1104 aa21.9■■□□□ 1.1
SYP-202ENST00000376303 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
SYP-202ENST00000376303 HOOK2Q96ED9 719 aa21.9■■□□□ 1.1
SYP-202ENST00000376303 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SYP-202ENST00000376303 SEMA3EO15041 775 aa21.89■■□□□ 1.09
SYP-202ENST00000376303 CSADQ9Y600 493 aa21.89■■□□□ 1.09
SYP-202ENST00000376303 ZBTB22O15209 634 aa21.88■■□□□ 1.09
SYP-202ENST00000376303 VGLL4Q14135 290 aa21.88■■□□□ 1.09
SYP-202ENST00000376303 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SYP-202ENST00000376303 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.88■■□□□ 1.09
SYP-202ENST00000376303 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SYP-202ENST00000376303 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.87■■□□□ 1.09
SYP-202ENST00000376303 MYH2Q9UKX2 1941 aa21.87■■□□□ 1.09
SYP-202ENST00000376303 LDHBP07195 334 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SYP-202ENST00000376303 MS4A4AQ96JQ5 239 aa21.87■■□□□ 1.09
SYP-202ENST00000376303 SRGAP3O43295 1099 aa21.86■■□□□ 1.09
SYP-202ENST00000376303 PRDX5P30044 214 aa21.86■■□□□ 1.09
SYP-202ENST00000376303 PHKA1P46020 1223 aa21.86■■□□□ 1.09
SYP-202ENST00000376303 SOX10P56693 466 aa21.86■■□□□ 1.09
SYP-202ENST00000376303 MTX1Q13505 466 aa21.86■■□□□ 1.09
SYP-202ENST00000376303 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa21.86■■□□□ 1.09
SYP-202ENST00000376303 PTPN18Q99952 460 aa21.86■■□□□ 1.09
SYP-202ENST00000376303 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa21.86■■□□□ 1.09
SYP-202ENST00000376303 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa21.86■■□□□ 1.09
SYP-202ENST00000376303 TRIM27P14373 513 aa21.85■■□□□ 1.09
SYP-202ENST00000376303 GTF2A2P52657 109 aa21.85■■□□□ 1.09
SYP-202ENST00000376303 CRHR2Q13324 411 aa21.85■■□□□ 1.09
SYP-202ENST00000376303 DIXDC1Q155Q3 683 aa21.85■■□□□ 1.09
SYP-202ENST00000376303 DCAF15Q66K64 600 aa21.85■■□□□ 1.09
SYP-202ENST00000376303 CCDC102BQ68D86 513 aa21.85■■□□□ 1.09
SYP-202ENST00000376303 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
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