RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 MROH2AA6NES4 1674 aa17.77■□□□□ 0.44
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PTPRU-201ENST00000345512 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
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PTPRU-201ENST00000345512 SLFNL1Q499Z3 407 aa17.71■□□□□ 0.43
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PTPRU-201ENST00000345512 A0A1W2PQD8 194 aa17.71■□□□□ 0.43
PTPRU-201ENST00000345512 UBA7P41226 1012 aa17.71■□□□□ 0.43
PTPRU-201ENST00000345512 RILPL1Q5EBL4 403 aa17.71■□□□□ 0.43
PTPRU-201ENST00000345512 CEP112Q8N8E3 955 aa17.71■□□□□ 0.43
PTPRU-201ENST00000345512 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
PTPRU-201ENST00000345512 CARMIL3Q8ND23 1372 aa17.71■□□□□ 0.43
PTPRU-201ENST00000345512 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
PTPRU-201ENST00000345512 ZHX3Q9H4I2 956 aa17.7■□□□□ 0.42
PTPRU-201ENST00000345512 PHACTR2O75167 634 aa17.7■□□□□ 0.42
PTPRU-201ENST00000345512 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
PTPRU-201ENST00000345512 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
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