RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325103.10

HPS1-201, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPS1, Length 3,703 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-201ENST00000325103 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa15.22■□□□□ 0.03
HPS1-201ENST00000325103 NHSL1Q5SYE7 1610 aa15.22■□□□□ 0.03
HPS1-201ENST00000325103 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
HPS1-201ENST00000325103 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP15.21■□□□□ 0.032e-7■■■□□ 14.6
HPS1-201ENST00000325103 SCRN1Q12765 414 aa15.21■□□□□ 0.03
HPS1-201ENST00000325103 GAS2L3Q86XJ1 694 aa15.21■□□□□ 0.03
HPS1-201ENST00000325103 GPT2Q8TD30 523 aa15.21■□□□□ 0.03
HPS1-201ENST00000325103 GOLGA8AA7E2F4 631 aa15.21■□□□□ 0.03
HPS1-201ENST00000325103 LCORLQ8N3X6 602 aa15.21■□□□□ 0.03
HPS1-201ENST00000325103 UFL1O94874 794 aa15.21■□□□□ 0.03
HPS1-201ENST00000325103 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
HPS1-201ENST00000325103 DENND2AQ9ULE3 1009 aa15.21■□□□□ 0.03
HPS1-201ENST00000325103 MTMR6Q9Y217 621 aa15.21■□□□□ 0.03
HPS1-201ENST00000325103 NFIXQ14938 502 aa15.2■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 CKAP2LQ8IYA6 745 aa15.2■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 GIMAP6Q6P9H5 292 aa15.2■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 AMOTL1Q8IY63 956 aa15.2■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 IFNL3Q8IZI9 196 aa15.2■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 GTF3C6Q969F1 213 aa15.2■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 KLRK1P26718 216 aa15.2■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 TMEM63CQ9P1W3 806 aa15.2■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa15.19■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 STK38Q15208 465 aa15.19■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 SERPINB2P05120 415 aa15.19■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 PHKBQ93100 1093 aa15.19■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 SLC26A6Q9BXS9 759 aa15.19■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 TSPY26PQ9H489 355 aa15.19■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa15.19■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 ZBTB43O43298 467 aa15.18■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 ANKRD2Q9GZV1 360 aa15.18■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 ADD1P35611 737 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 UBE3CQ15386 1083 aa15.18■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 DRC7Q8IY82 874 aa15.18■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 GJB4Q9NTQ9 266 aa15.18■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 ZNF804BA4D1E1 1349 aa15.18■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP15.17■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 WTAPQ15007 396 aa15.17■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa15.17■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 MCM9Q9NXL9 1143 aa15.17■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 BCL9LQ86UU0 1499 aa15.17■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 AMIGO3Q86WK7 504 aa15.17■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 PKD1L3Q7Z443 1732 aa15.17■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa15.17■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 UBE4AQ14139 1066 aa15.17■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 MKNK2Q9HBH9 465 aa15.17■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 IARSP41252 1262 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 TBC1D10CQ8IV04 446 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP15.16■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 SDF4Q9BRK5 362 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 PRDX5P30044 214 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 UBE2HP62256 183 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 ATP2B2Q01814 1243 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP15.16■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 TRIM22Q8IYM9 498 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 LDHBP07195 334 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 TNMDQ9H2S6 317 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 LRRC4BQ9NT99 713 aa15.16■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 ALG1Q9BT22 464 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP15.15■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 CFAP45Q9UL16 551 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 TSPY2A6NKD2 308 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 USP17L12C9JPN9 530 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 USP17L21D6R901 530 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 SLC51AQ86UW1 340 aa15.15■□□□□ 0.02
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HPS1-201ENST00000325103 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 BCL2L12Q9HB09 334 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 SLIT2O94813 1529 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 TXNRD1Q16881 649 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 ABCC12Q96J65 1359 aa15.15■□□□□ 0.02
HPS1-201ENST00000325103 MSNP26038 577 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
HPS1-201ENST00000325103 IQCA1Q86XH1 822 aa15.14■□□□□ 0.01
HPS1-201ENST00000325103 VGLL2Q8N8G2 317 aa15.14■□□□□ 0.01
HPS1-201ENST00000325103 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
HPS1-201ENST00000325103 PICALMQ13492 652 aa15.14■□□□□ 0.01
HPS1-201ENST00000325103 DIXDC1Q155Q3 683 aa15.14■□□□□ 0.01
HPS1-201ENST00000325103 FAM47AQ5JRC9 791 aa15.14■□□□□ 0.01
HPS1-201ENST00000325103 NUP62CLQ9H1M0 184 aa15.14■□□□□ 0.01
HPS1-201ENST00000325103 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa15.14■□□□□ 0.01
HPS1-201ENST00000325103 AKNAD1Q5T1N1 836 aa15.14■□□□□ 0.01
HPS1-201ENST00000325103 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
HPS1-201ENST00000325103 SASS6Q6UVJ0 657 aa15.14■□□□□ 0.01
HPS1-201ENST00000325103 ZNF804AQ7Z570 1209 aa15.14■□□□□ 0.01
HPS1-201ENST00000325103 KRT23Q9C075 422 aa15.14■□□□□ 0.01
HPS1-201ENST00000325103 DACT1Q9NYF0 836 aa15.14■□□□□ 0.01
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