RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 NCLP19338 710 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
CAPNS1-201ENST00000246533 EPS15P42566 896 aa31.41■■■□□ 2.62
CAPNS1-201ENST00000246533 PDE1AP54750 535 aa31.41■■■□□ 2.62
CAPNS1-201ENST00000246533 TNIP1Q15025 636 aa31.41■■■□□ 2.62
CAPNS1-201ENST00000246533 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
CAPNS1-201ENST00000246533 NEUROD6Q96NK8 337 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-201ENST00000246533 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-201ENST00000246533 USP17L3A6NCW0 530 aa31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-201ENST00000246533 USP17L4A6NCW7 530 aa31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-201ENST00000246533 TTLL5Q6EMB2 1281 aa31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-201ENST00000246533 USP17L1Q7RTZ2 530 aa31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-201ENST00000246533 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-201ENST00000246533 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-201ENST00000246533 PSME4Q14997 1843 aa31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-201ENST00000246533 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 PHKA1P46020 1223 aa31.38■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 DACT2Q5SW24 774 aa31.38■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 LRSAM1Q6UWE0 723 aa31.38■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 VPS37DQ86XT2 251 aa31.38■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 XAGE2Q96GT9 111 aa31.38■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 POTEIP0CG38 1075 aa31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 POTEJP0CG39 1038 aa31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 CAVIN4Q5BKX8 364 aa31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 ZDHHC9Q9Y397 364 aa31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 TNNI3KQ59H18 835 aa31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF609O15014 1411 aa31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 CUL4AQ13619 759 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 CERS5Q8N5B7 392 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 RHPN1Q8TCX5 695 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 RBSNQ9H1K0 784 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 GPRC5DQ9NZD1 345 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 AKAP2Q9Y2D5 859 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 STRIP1Q5VSL9 837 aa31.35■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 GPT2Q8TD30 523 aa31.35■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 EGFRP00533 1210 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 PKP1Q13835 747 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC102BQ68D86 513 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 GMLQ99445 158 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 DBNDD2Q9BQY9 259 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 HACL1Q9UJ83 578 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 AOX1Q06278 1338 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 SALL3Q9BXA9 1300 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 ARAP2Q8WZ64 1704 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-201ENST00000246533 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
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CAPNS1-201ENST00000246533 MICALL2Q8IY33 904 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 SCN4AP35499 1836 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 EPHX2P34913 555 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 GRIK5Q16478 980 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 TMX3Q96JJ7 454 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 BRD1O95696 1058 aa31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 NEK4P51957 841 aa31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRCC1Q9C099 1032 aa31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 PDCL3Q9H2J4 239 aa31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 SAMD7Q7Z3H4 446 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR108Q9NPR9 543 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA0825Q8IV33 1275 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC39Q9UFE4 941 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 STAP2Q9UGK3 403 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 ERC1Q8IUD2 1116 aa31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 TRPM4Q8TD43 1214 aa31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 DPF2Q92785 391 aa31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 IQCA1LA6NCM1 817 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 PI16Q6UXB8 463 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 KIF1BPQ96EK5 621 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM205AQ6ZU69 1335 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 F8W031 263 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 SCARF1Q14162 830 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 AACSQ86V21 672 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 RASGRF1Q13972 1273 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 AGBL3Q8NEM8 1001 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB11FIP3O75154 756 aa31.26■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 MX1P20591 662 aa31.26■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 MFSD14BQ5SR56 506 aa31.26■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 GORABQ5T7V8 394 aa31.26■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa31.26■■■□□ 2.6
CAPNS1-201ENST00000246533 MYH13Q9UKX3 1938 aa31.26■■■□□ 2.59
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