RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 TRAPPC3LQ5T215 181 aa7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 NEURL1BA8MQ27 555 aa7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 SYKP43405 635 aa7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 MMP14P50281 582 aa7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 TRIML1Q8N9V2 468 aa7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 HAUS3Q68CZ6 603 aa7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 PDILTQ8N807 584 aa7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 ZNF592Q92610 1267 aa7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 ZBTB3Q9H5J0 574 aa7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 LDHBP07195 334 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 PAFAH1B1P43034 410 aa7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 PIP4K2BP78356 416 aa7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 IQUBQ8NA54 791 aa7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 TMOD4Q9NZQ9 345 aa7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 LTKP29376 864 aa7.22□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 KRT2P35908 639 aa7.22□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 BTG4Q9NY30 223 aa7.22□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 SPDYE3A6NKU9 549 aa7.22□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 UBXN4Q92575 508 aa7.22□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 LEMD3Q9Y2U8 911 aa7.22□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 ELP1O95163 1332 aa7.22□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 MYOM1P52179 1685 aa7.22□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 SYCE3A1L190 88 aa7.22□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 AKAP12Q02952 1782 aa7.22□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 ADRA2BP18089 450 aa7.22□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 RPL13P26373 211 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 ALG1Q9BT22 464 aa7.22□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 TNS3Q68CZ2 1445 aa7.22□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 TRIM75PA6NK02 468 aa7.22□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 DTHD1Q6ZMT9 781 aa7.22□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 TMEM94Q12767 1356 aa7.22□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 A0A1B0GUL7 405 aa7.22□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 USHBP1Q8N6Y0 703 aa7.22□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 HAUS7Q99871 368 aa7.22□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 HEG1Q9ULI3 1381 aa7.22□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 CLCN1P35523 988 aa7.22□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 STK3Q13188 491 aa7.22□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 IWS1Q96ST2 819 aa7.22□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 TSPYL1Q9H0U9 437 aa7.22□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 GNA14O95837 355 aa7.21□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 TRAPPC10P48553 1259 aa7.21□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 LMBR1Q8WVP7 490 aa7.21□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa7.21□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 SPTLC2O15270 562 aa7.21□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 MLKLQ8NB16 471 aa7.21□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 USP44Q9H0E7 712 aa7.21□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 CLIP2Q9UDT6 1046 aa7.21□□□□□ -1.25
SETX-201ENST00000224140 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 BEND3Q5T5X7 828 aa7.21□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 GIMAP6Q6P9H5 292 aa7.21□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa7.21□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa7.21□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 TNFAIP1Q13829 316 aa7.21□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 CNGA4Q8IV77 575 aa7.21□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 MED23Q9ULK4 1368 aa7.21□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 AK2P54819 239 aa7.21□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 FMN2Q9NZ56 1722 aa7.21□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 VWA3BQ502W6 1294 aa7.21□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 KCTD17Q8N5Z5 321 aa7.21□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 NT5C3AQ9H0P0 336 aa7.21□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 PRC1O43663 620 aa7.21□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 ITGA6P23229 1130 aa7.21□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 CROCCP2Q86T23 111 aa7.21□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa7.2□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 CTSWP56202 376 aa7.2□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 Q6ZUG5 572 aa7.2□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 KIAA1328Q86T90 577 aa7.2□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 TANGO6Q9C0B7 1094 aa7.2□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 CCDC87Q9NVE4 849 aa7.2□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa7.2□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 CYP7A1P22680 504 aa7.2□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 TAF4BQ92750 862 aa7.2□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 VTI1AQ96AJ9 217 aa7.2□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 LRRC45Q96CN5 670 aa7.2□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa7.2□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 EXOC1Q9NV70 894 aa7.2□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 KRT86O43790 486 aa7.2□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 TMCO3Q6UWJ1 677 aa7.2□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 FCHSD1Q86WN1 690 aa7.2□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 CEP112Q8N8E3 955 aa7.2□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 FAM81BQ96LP2 452 aa7.2□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 AK8Q96MA6 479 aa7.2□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
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