RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636280.1

DNM1-222, Transcript of dynamin 1, human

TSL 5

Gene DNM1, Length 2,462 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNM1-222	ENST00000636280	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280		M0R1X1	148 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	LY6H	O94772	140 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	S1PR2	O95136	353 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	DANCR	P0C864	163 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	FOLR2	P14207	255 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	RAB5B	P61020	215 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	KRAS	P01116	189 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	S100A8	P05109	93 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	G6PC	P35575	357 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	GPR157	Q5UAW9	335 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	TMED6	Q8WW62	240 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF714	Q96N38	554 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	FBXL17	Q9UF56	701 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	TAAR5	O14804	337 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	GPR137B	O60478	399 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	GNG10	P50151	68 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	DTX2	Q86UW9	622 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	CHST1	O43916	411 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	TMEM50A	O95807	157 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	IGHV2-70	P01814	119 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	IGFBP2	P18065	325 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	GAB2	Q9UQC2	676 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	C5orf52	A6NGY3	159 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	FSTL3	O95633	263 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280		P0C879	139 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	OR2C3	Q8N628	320 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		13.08	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	WRB	O00258	174 aa		13.08	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	RAB29	O14966	203 aa		13.08	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	CAV2	P51636	162 aa		13.08	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	NHLH2	Q02577	135 aa		13.08	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	LYG1	Q8N1E2	194 aa		13.08	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		13.08	□□□□□ -0.31
DNM1-222	ENST00000636280	VAMP2	P63027	116 aa		13.08	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		13.08	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		13.08	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	IGSF23	A1L1A6	192 aa		13.07	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	FCGR3B	O75015	233 aa		13.07	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	PRB1	P04280	392 aa		13.07	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	PAX9	P55771	341 aa		13.07	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	13.07	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	HRH4	Q9H3N8	390 aa		13.07	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	NIT2	Q9NQR4	276 aa		13.07	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		13.07	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		13.07	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	UBE2C	O00762	179 aa		13.07	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	MMP9	P14780	707 aa		13.07	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	DAO	P14920	347 aa		13.07	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	PAX6	P26367	422 aa		13.07	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		13.07	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		13.07	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		13.06	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		13.06	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		13.06	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		13.06	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	DDB2	Q92466	427 aa		13.06	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	WFDC1	Q9HC57	220 aa		13.06	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	S100A6	P06703	90 aa		13.06	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	DLX6	P56179	175 aa		13.06	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		13.06	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	MIDN	Q504T8	468 aa		13.06	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		13.06	□□□□□ -0.32
DNM1-222	ENST00000636280	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		13.06	□□□□□ -0.32

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