RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596522.1

FCHO1-215, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 4

Gene FCHO1, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-215	ENST00000596522	CD3D	P04234	171 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	AKAIN1	P0CW23	69 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	SLC35B1	P78383	322 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	C5orf30	Q96GV9	206 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	SHOX	O15266	292 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	IGLV2-14	P01704	120 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	IGKV1-16	P04430	117 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	F2RL1	P55085	397 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	FBLN7	Q53RD9	439 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	PYDC2	Q56P42	97 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	LIN54	Q6MZP7	749 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522		Q8N402	240 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	MFSD4A	Q8N468	514 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	COMMD1	Q8N668	190 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	PRRT1	Q99946	306 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	CITED1	Q99966	193 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522		V9GYH0	126 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522		A6NHS1	94 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	LINC00473	A8K010	186 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522		M0QYG6	137 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	FCGR3B	O75015	233 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	CRYZL1	O95825	349 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	PSG5	Q15238	335 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	FBXO24	O75426	580 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	HRAS	P01112	189 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	IGF1	P05019	195 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	VDAC1	P21796	283 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	GNRHR	P30968	328 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	UBE2K	P61086	200 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	ZNF45	Q02386	682 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	TEX45	Q8NA69	505 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	TERB2	Q8NHR7	220 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	PSMB11	A5LHX3	300 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522		M0QZ24	198 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	B3GALNT1	O75752	331 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	HPRT1	P00492	218 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	OPN1MW	P04001	364 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	PGAM2	P15259	253 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	INPP1	P49441	399 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	TRIQK	Q629K1	86 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	STPG2	Q8N412	459 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	OR51J1	Q9H342	316 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	FBXL15	Q9H469	300 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	COMMD9	Q9P000	198 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FCHO1-215	ENST00000596522	TNFSF12	O43508	249 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-215	ENST00000596522	SLC25A17	O43808	307 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-215	ENST00000596522	F2R	P25116	425 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-215	ENST00000596522	CNTFR	P26992	372 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-215	ENST00000596522	TAS2R31	P59538	309 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-215	ENST00000596522	RND3	P61587	244 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-215	ENST00000596522	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-215	ENST00000596522	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-215	ENST00000596522	ZNF79	Q15937	498 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-215	ENST00000596522	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-215	ENST00000596522	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-215	ENST00000596522		Q6ZS46	218 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-215	ENST00000596522	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FCHO1-215	ENST00000596522	OR51H1	Q8NH63	302 aa		11.2	□□□□□ -0.62

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