RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590599.1

CTDP1-205, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTDP1, Length 1,762 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-205ENST00000590599 MBPP02686 304 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 RLN2P04090 185 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 CT45A6P0DMU7 189 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 CT45A5P0DMU8 189 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 CT45A7P0DMV0 189 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 G6PCP35575 357 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 ZNF137PP52743 207 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 HLA-DRB5Q30154 266 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 PNKDQ8N490 385 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 BEND2Q8NDZ0 799 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 OR1S1Q8NH92 325 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 CACNG5Q9UF02 275 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 KPTNQ9Y664 436 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 H0YIZ8 118 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 ST8SIA3O43173 380 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 IGLV1-47P01700 117 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 CXCL2P19875 107 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 PRTN3P24158 256 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 RTL8BQ17RB0 113 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 CLEC12BQ2HXU8 276 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 R3HDM4Q96D70 268 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 RNF126Q9BV68 326 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 MFFQ9GZY8 342 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 OR5AC2Q9NZP5 309 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 TNFSF18Q9UNG2 199 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 K7EPK0 472 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 APOA2P02652 100 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 C4BPBP20851 252 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 REG1BP48304 166 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 PAX2Q02962 417 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 SLC35D1Q9NTN3 355 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 POMT1Q9Y6A1 747 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 MARCH11A6NNE9 402 aa14.71□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 DEDDO75618 318 aa14.71□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 CRYZL1O95825 349 aa14.71□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 LYL1P12980 280 aa14.71□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 ERVK-16P61578 105 aa14.71□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa14.71□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 VMO1Q7Z5L0 202 aa14.71□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 MMP26Q9NRE1 261 aa14.71□□□□□ -0.05
CTDP1-205ENST00000590599 FAM157AC9JC47 383 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 SLC25A16P16260 332 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 Q6ZRM9 215 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 DMBX1Q8NFW5 382 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 LPAR2Q9HBW0 351 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 ACANP16112 2415 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 TSC22D2O75157 780 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 PITX3O75364 302 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 ARG1P05089 322 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 P0C879 139 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 RRASP10301 218 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 NQO2P16083 231 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 DEFB113Q30KQ7 82 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 OR11H6Q8NGC7 330 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 OR4P4Q8NGL7 312 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 SIRPDQ9H106 197 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 COA4Q9NYJ1 87 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 E5RGE8 158 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 H7C2Y5 167 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 WRBO00258 174 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 OR2F2O95006 317 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 NXPH3O95157 252 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 KLRD1Q13241 179 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 OR2F1Q13607 317 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 ZNF345Q14585 488 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 TMUB2Q71RG4 321 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 NABP2Q9BQ15 211 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 ARL6Q9H0F7 186 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 NSG2Q9Y328 171 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 ZFHX3Q15911 3703 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 A0A0D9SG52 128 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 H0YJW9 148 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 TOX4O94842 621 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 S100A11P31949 105 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms