RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, human

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAPNS1-208	ENST00000589162	IGKV1D-33	P01593	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	IGKV1-33	P01594	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	IGKV1-39	P01597	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	IGKV1D-39	P04432	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	IL3RA	P26951	378 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	RAB7A	P51149	207 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	LGALS4	P56470	323 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	TATDN3	Q17R31	274 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162		Q6ZNX1	250 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	SSX9	Q7RTT3	188 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	TMEM219	Q86XT9	240 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	DDB2	Q92466	427 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	CFHR4	Q92496	578 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	RPE	Q96AT9	228 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	NAA60	Q9H7X0	242 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	MPTX1	A8MV57	137 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162		H3BUX3	64 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162		H7C2Y5	167 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	VENTX	O95231	258 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	SFT2D2	O95562	160 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	CRYZL1	O95825	349 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	IGHV4-59	P01825	116 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	IGKV1-16	P04430	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	HOXB5	P09067	269 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR4E1	P0C645	316 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	GATA3	P23771	443 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	F2R	P25116	425 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	G6PC	P35575	357 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	THBS3	P49746	956 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	ZNF137P	P52743	207 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	RND3	P61587	244 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	DHODH	Q02127	395 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	DHRS2	Q13268	280 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	HES1	Q14469	280 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	TMEM187	Q14656	261 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	FCN2	Q15485	313 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	LYG2	Q86SG7	212 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	NANP	Q8TBE9	248 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	PIFO	Q8TCI5	191 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	CLCC1	Q96S66	551 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	S1PR3	Q99500	378 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	NUP50	Q9UKX7	468 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	NSG2	Q9Y328	171 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162		H0Y980	276 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	GOSR2	O14653	212 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	CHST1	O43916	411 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	DHFR	P00374	187 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	KRAS	P01116	189 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	IFNA2	P01563	188 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	IGKV1-5	P01602	117 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR9G9	P0C7N8	305 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	F2RL1	P55085	397 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR2B8P	P59922	312 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	CD300C	Q08708	224 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	MIDN	Q504T8	468 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	SPINK9	Q5DT21	86 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	SLC35G3	Q8N808	338 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CAPNS1-208	ENST00000589162	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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