RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	IGLV1-44	P01699	117 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	CRYAA	P02489	173 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	S100A8	P05109	93 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	OMG	P23515	440 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	PTAFR	P25105	342 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	NFYB	P25208	207 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	ATP6V0C	P27449	155 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	MAS1L	P35410	378 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	RAB7A	P51149	207 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	DYNLT3	P51808	116 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	UBE2K	P61086	200 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	S100A12	P80511	92 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	AKR1C1	Q04828	323 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	HERPUD1	Q15011	391 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	TGIF1	Q15583	401 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	ATRAID	Q6UW56	229 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	FGFRL1	Q8N441	504 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF709	Q8N972	641 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	OR8U1	Q8NH10	309 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	DYRK2	Q92630	601 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	GPR146	Q96CH1	333 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	MALSU1	Q96EH3	234 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	SSX3	Q99909	188 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	GGACT	Q9BVM4	153 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	WFDC1	Q9HC57	220 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289		R4GN57	208 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	NCOR1	O75376	2440 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	MED13	Q9UHV7	2174 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	IGSF23	A1L1A6	192 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM74A7	A6NL05	159 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289		A6NLC8	198 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRC30	A6NM36	301 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	COLCA2	A8K830	154 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM157A	C9JC47	383 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289		M0R036	132 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	SIRPB1	O00241	398 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	HSPB6	O14558	160 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	AGPAT2	O15120	278 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	NKX2-8	O15522	239 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	CYB5B	O43169	146 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	NDUFA2	O43678	99 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	YPEL1	O60688	119 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	RHBDL1	O75783	438 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	CLDN1	O95832	211 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	IGHV3-13	P01766	116 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	PSG2	P11465	335 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	EGR1	P18146	543 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	ADCYAP1	P18509	176 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	PRDX2	P32119	198 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	TIMP3	P35625	211 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	GLRX	P35754	106 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	GNB2	P62879	340 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	TNFRSF9	Q07011	255 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF154	Q13106	437 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	RAB31	Q13636	194 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	SSX2	Q16385	188 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	HFE	Q30201	348 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	MED12L	Q86YW9	2145 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	DRAM1	Q8N682	238 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	OR52E5	Q8NH55	327 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		3.75	□□□□□ -1.81

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