RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566689.5

BBS2-217, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 4

Gene BBS2, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-217	ENST00000566689	RAB18	Q9NP72	206 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	RAB9B	Q9NP90	201 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	TREM2	Q9NZC2	230 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	EHF	Q9NZC4	300 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	FAM172BP	A6NC97	362 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	RNF222	A6NCQ9	220 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	OR2AT4	A6NND4	320 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	VWC2L	B2RUY7	222 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	SRRM5	B3KS81	715 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	TRDC	B7Z8K6	153 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	WNT9B	O14905	357 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	HSPA12A	O43301	675 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	SSNA1	O43805	119 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	NDUFA7	O95182	113 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	PLAU	P00749	431 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	OR5H8	P0DN80	308 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	LMO1	P25800	156 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	G0S2	P27469	103 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	MAS1L	P35410	378 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	TAS2R31	P59538	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	HERV-K104	P61576	105 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	HNF4G	Q14541	408 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689		Q6P435	159 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	ZNF546	Q86UE3	836 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	ZNF561	Q8N587	486 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	TERB2	Q8NHR7	220 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689		Q8TCH9	128 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	NEUROG1	Q92886	237 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	RAB39B	Q96DA2	213 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	TIMD4	Q96H15	378 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	SLC6A7	Q99884	636 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	HES4	Q9HCC6	221 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	TG	P01266	2768 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	DYSF	O75923	2080 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	DSCAM	O60469	2012 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689		A0A0A0MQY5	61 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	MGST3	O14880	152 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	BET1	O15155	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	FABP7	O15540	132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	SPINT2	O43291	252 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	NDUFA2	O43678	99 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	CCNK	O75909	580 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	LHB	P01229	141 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	IL5	P05113	134 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	PSG2	P11465	335 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	GZMH	P20718	246 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	IL2RG	P31785	369 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	BTC	P35070	178 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	PPOX	P50336	477 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	EDDM3B	P56851	147 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	PLP1	P60201	277 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	SPCS3	P61009	180 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	HERV-K104	P63124	156 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	COL10A1	Q03692	680 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	EDDM3A	Q14507	147 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.7 ms