RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565638.1

N4BP1-205, Transcript of NEDD4 binding protein 1, human

TSL 5

Gene N4BP1, Length 296 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
N4BP1-205	ENST00000565638	ACTBL2	Q562R1	376 aa		4.65	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		4.65	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	STPG2	Q8N412	459 aa		4.65	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		4.65	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	ZNF383	Q8NA42	475 aa		4.65	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	OR8U1	Q8NH10	309 aa		4.65	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		4.65	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	GPX8	Q8TED1	209 aa		4.65	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	SNAPC3	Q92966	411 aa		4.65	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	ISOC1	Q96CN7	298 aa		4.65	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		4.65	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		4.65	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		4.65	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		4.65	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	FAM25A	B3EWG3	89 aa		4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	FAM25C	B3EWG5	89 aa		4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	FAM25G	B3EWG6	89 aa		4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638		H3BMQ9	156 aa		4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638		H3BS24	57 aa		4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	RRH	O14718	337 aa		4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	RGS5	O15539	181 aa		4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	HPGDS	O60760	199 aa		4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	PROP1	O75360	226 aa		4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	PPY	P01298	95 aa		4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	ELANE	P08246	267 aa		4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	CSF1	P09603	554 aa		4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	ELK1	P19419	428 aa		4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	VDAC1	P21796	283 aa		4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	KIR2DS2	P43631	304 aa		4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	CD83	Q01151	205 aa		4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	CATR1	Q13166	79 aa		4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	SPCS2	Q15005	226 aa		4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	KCTD9	Q7L273	389 aa		4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	DDB2	Q92466	427 aa		4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	HARBI1	Q96MB7	349 aa		4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	OR4F4	Q96R69	305 aa		4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	EHF	Q9NZC4	300 aa		4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		4.64	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	CTDSPL	O15194	276 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	IGHG4	P01861	327 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	IGKV1-16	P04430	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	FGF2	P09038	288 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	S100G	P29377	79 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	FCGR2C	P31995	323 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	F2RL1	P55085	397 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	HERV-K104	P61576	105 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	VAMP2	P63027	116 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	CFHR3	Q02985	330 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	FOXE3	Q13461	319 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	PLGLA	Q15195	96 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	LIN54	Q6MZP7	749 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	TEX38	Q6PEX7	206 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	LAX1	Q8IWV1	398 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	OR4S2	Q8NH73	311 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	MOB3A	Q96BX8	217 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	C5orf30	Q96GV9	206 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	TMEM68	Q96MH6	324 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	OR51J1	Q9H342	316 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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