RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	TFF3	Q07654	80 aa		15.34	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		15.34	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	FRZB	Q92765	325 aa		15.34	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	DIRC2	Q96SL1	478 aa		15.34	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	PROCR	Q9UNN8	238 aa		15.34	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		15.33	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		15.33	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	15.33	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	HNF4G	Q14541	408 aa		15.33	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	OR4F5	Q8NH21	305 aa		15.33	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		15.33	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	15.33	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	OR4F4	Q96R69	305 aa		15.33	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	GNG12	Q9UBI6	72 aa		15.33	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		15.33	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	SRRM5	B3KS81	715 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	MGST3	O14880	152 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	15.32	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	MPDU1	O75352	247 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	TFF1	P04155	84 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	CFHR2	P36980	270 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	SPCS3	P61009	180 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	15.32	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	EDDM3A	Q14507	147 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	15.32	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	OR5B12	Q96R08	314 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	PARL	Q9H300	379 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	15.32	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	YPEL1	O60688	119 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	VENTX	O95231	258 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	15.32	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	CR1L	Q2VPA4	569 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	OR52E5	Q8NH55	327 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	15.32	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	SNX22	Q96L94	193 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	YPEL2	Q96QA6	119 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	15.32	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	C15orf62	A8K5M9	175 aa		15.31	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559		H7BYZ3	331 aa		15.31	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	WISP2	O76076	250 aa		15.31	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	15.31	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	CD1B	P29016	333 aa		15.31	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	15.31	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	MORN2	Q502X0	79 aa		15.31	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	PYY3	Q5JQD4	70 aa		15.31	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		15.31	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	OR4A16	Q8NH70	328 aa		15.31	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	SSX3	Q99909	188 aa		15.31	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		15.31	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		15.31	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		15.31	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	FCGR3B	O75015	233 aa		15.31	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	TNFSF13	O75888	250 aa		15.31	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	ERVK-16	P61578	105 aa		15.31	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		15.31	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	RAB1C	Q92928	201 aa		15.31	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	RAB9B	Q9NP90	201 aa		15.31	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	PHOX2A	O14813	284 aa		15.3	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	SOD3	P08294	240 aa		15.3	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	KIR2DS2	P43631	304 aa		15.3	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	15.3	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		15.3	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	PIP4P1	Q86T03	277 aa		15.3	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		15.3	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	STARD4	Q96DR4	205 aa		15.3	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	15.3	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		15.29	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	OR9G9	P0C7N8	305 aa		15.29	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	SPINK9	Q5DT21	86 aa		15.29	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		15.29	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		15.29	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		15.29	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	15.29	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		15.29	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		15.29	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	15.29	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	PTPRB	P23467	1997 aa		15.29	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	F2RL2	O00254	374 aa		15.29	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	PDE6D	O43924	150 aa		15.29	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	PAGE4	O60829	102 aa		15.29	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	CGA	P01215	116 aa		15.29	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	GALR1	P47211	349 aa		15.29	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00205	P59089	165 aa		15.29	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	LTC4S	Q16873	150 aa		15.29	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	C11orf94	C9JXX5	98 aa		15.28	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559		M0R1X1	148 aa		15.28	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	IFNA10	P01566	189 aa		15.28	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	15.28	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	S100PBP	Q96BU1	408 aa		15.28	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		15.28	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		15.28	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		15.28	■□□□□ 0.04

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