RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563176.1

LCMT1-AS1-201, LCMT1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene LCMT1-AS1, Length 432 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 H2BFSP57053 126 aa3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 DEFA1P59665 94 aa3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 NCS1P62166 190 aa3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 CACNG7P62955 275 aa3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 GAGE4Q13068 117 aa3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 LY6DQ14210 128 aa3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 IL17AQ16552 155 aa3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 NRF1Q16656 503 aa3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 SLC35E4Q6ICL7 350 aa3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 GFRALQ6UXV0 394 aa3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 TMEM219Q86XT9 240 aa3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 C20orf196Q8IYI0 205 aa3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 OR8I2Q8N0Y5 310 aa3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 TMEM86AQ8N2M4 240 aa3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 FTMTQ8N4E7 242 aa3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 TMEM178AQ8NBL3 297 aa3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 OR1L1Q8NH94 360 aa3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 LYSMD1Q96S90 227 aa3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 OR2D2Q9H210 308 aa3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 OR51I2Q9H344 312 aa3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 OR52D1Q9H346 318 aa3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 ZNF556Q9HAH1 456 aa3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 HIGD1AQ9Y241 93 aa3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 CCL26Q9Y258 94 aa3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 MYOFQ9NZM1 2061 aa3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 PI4KAP42356 2102 aa3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 TSC2P49815 1807 aa3.35□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 CHD8Q9HCK8 2581 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 A0A0G2JN53 185 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 A0A1B0GXF2 115 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 D6RAR5 112 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 H7C417 338 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 SAP18O00422 153 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 OR2A4O95047 310 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 ZNF682O95780 498 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 HBZP02008 142 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 FABP3P05413 133 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 CASP1P29466 404 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 LHX2P50458 406 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 MTPNP58546 118 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 RPS25P62851 125 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 P2RY6Q15077 328 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 PDGFRLQ15198 375 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 BATFQ16520 125 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 GSG1Q2KHT4 349 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 ZNF181Q2M3W8 571 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 ZNF718Q3SXZ3 478 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 TTC32Q5I0X7 151 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 ZNF506Q5JVG8 444 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 LY6G5CQ5SRR4 150 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 ANKRD22Q5VYY1 191 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 C9orf57Q5W0N0 161 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 CNIH2Q6PI25 160 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 UGT2A3Q6UWM9 527 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 IL34Q6ZMJ4 242 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 ZNF793Q6ZN11 406 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 C11orf42Q8N5U0 333 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 ZNF615Q8N8J6 731 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 TMEM229BQ8NBD8 167 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 DEFB124Q8NES8 71 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 OR10G6Q8NH81 332 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 JOSD2Q8TAC2 188 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 VN1R17PQ8TDU5 208 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 TMEM174Q8WUU8 243 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 PLEKHB2Q96CS7 222 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 WBP1Q96G27 269 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 BTN2A3PQ96KV6 586 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 RDH12Q96NR8 316 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 OR2A7Q96R45 310 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 TRIB3Q96RU7 358 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 SLC25A33Q9BSK2 321 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 TMEM70Q9BUB7 260 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 LRRC61Q9BV99 259 aa3.34□□□□□ -1.87
LCMT1-AS1-201ENST00000563176 PITPNM3Q9BZ71 974 aa3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.1 ms