RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559551.5

RABGGTA-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, human

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 2,060 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTA-209	ENST00000559551	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RABGGTA-209	ENST00000559551	NUDT19	A8MXV4	375 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RABGGTA-209	ENST00000559551	RAMP3	O60896	148 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RABGGTA-209	ENST00000559551	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RABGGTA-209	ENST00000559551	IL15RA	Q13261	267 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RABGGTA-209	ENST00000559551	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RABGGTA-209	ENST00000559551	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RABGGTA-209	ENST00000559551	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RABGGTA-209	ENST00000559551	BIN3	Q9NQY0	253 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RABGGTA-209	ENST00000559551	GAB2	Q9UQC2	676 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RABGGTA-209	ENST00000559551	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	11.66	□□□□□ -0.54	2e-6	■■□□□ 14.3
RABGGTA-209	ENST00000559551	ZAN	Q9Y493	2812 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RABGGTA-209	ENST00000559551		A0A0G2JRQ6	117 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RABGGTA-209	ENST00000559551	FAM25E	A8MYX2	175 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RABGGTA-209	ENST00000559551	LIPF	P07098	398 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RABGGTA-209	ENST00000559551	LCN2	P80188	198 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RABGGTA-209	ENST00000559551	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RABGGTA-209	ENST00000559551	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RABGGTA-209	ENST00000559551	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RABGGTA-209	ENST00000559551	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RABGGTA-209	ENST00000559551	LYG1	Q8N1E2	194 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RABGGTA-209	ENST00000559551	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RABGGTA-209	ENST00000559551	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RABGGTA-209	ENST00000559551	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RABGGTA-209	ENST00000559551	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	TMEM218	A2RU14	115 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	RAB7A	P51149	207 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	ARF6	P62330	175 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	HCP5	Q6MZN7	132 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	LGI3	Q8N145	548 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	LINC00311	Q8N616	119 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	DDB2	Q92466	427 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551		A0A096LNT2	108 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551		J3QR06	171 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551		M0R1X1	148 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	NDUFS8	O00217	210 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	RAB13	P51153	203 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	AKR1D1	P51857	326 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	C12orf57	Q99622	126 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	MBD2	Q9UBB5	411 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	IGKV1-5	P01602	117 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	IGLV1-47	P01700	117 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	RBP4	P02753	201 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	TNC	P24821	2201 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	C5orf51	A6NDU8	294 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	RAB29	O14966	203 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	NMS	Q5H8A3	153 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	ZNF383	Q8NA42	475 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	TNFRSF14	Q92956	283 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551		F8W036	122 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	IFNA4	P05014	189 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	CT45A6	P0DMU7	189 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	CT45A5	P0DMU8	189 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	CT45A7	P0DMV0	189 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	S100G	P29377	79 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	LPAR6	P43657	344 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	KLRD1	Q13241	179 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	OR9G1	Q8NH87	305 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	C2orf50	Q96LR7	162 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	SIRPD	Q9H106	197 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	COA4	Q9NYJ1	87 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	RNF222	A6NCQ9	220 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551		H0YIZ8	118 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	S1PR2	O95136	353 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	COX7A1	P24310	79 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RABGGTA-209	ENST00000559551	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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